FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA2014.ptfa, 1045 aa vs ./tmplib.26680 library 1767972 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5263+/-0.00914; mu= -7.4505+/- 0.605 mean_var=444.7086+/-107.721, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0608 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00304 ( 864 res) mng15233 ( 864) 1801 173 1.6e-43 mKIAA1902 ( 293 res) mph04215 ( 293) 1231 122 9e-29 mKIAA0666 ( 1087 res) mbg21234 (1087) 848 90 2.7e-18 mKIAA0381 ( 1032 res) mbe05005 (1032) 819 87 1.5e-17 mKIAA4117 ( 1192 res) mfj20353 (1192) 650 72 4.9e-13 mKIAA4062 ( 1285 res) mbg09432 (1285) 606 68 7.5e-12 mKIAA1727 ( 1159 res) mbh01547 (1159) 531 62 6.7e-10 mKIAA1695 ( 1294 res) mbp08127 (1294) 338 45 9e-05 >>mFLJ00304 ( 864 res) mng15233 (864 aa) initn: 2671 init1: 1339 opt: 1801 Z-score: 873.8 bits: 173.1 E(): 1.6e-43 Smith-Waterman score: 2827; 55.698% identity (61.806% ungapped) in 860 aa overlap (246-1032:1-848) 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 SVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILCLRAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSL .::::::::: ::.:::.:: :::::::: mFLJ00 MCLRAIMNYQSGFSLVMNHPACVNEIALSL 10 20 30 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 NNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAFDNFKEVCKELHRFEKLMEYFRNEDSNID :::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::: : :::::::::::.:::::: mFLJ00 NNKSPRTKALVLELLAAVCLVRGGHDIILAAFDNFKEVCGEQHRFEKLMEYFRHEDSNID 40 50 60 70 80 90 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 FMVACMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLEEFLQKSRHTESEKLQVQIQAYLDNV :::::::::::::::::.::::: ::::::.:::. .:.. : :::.::::::::::::: mFLJ00 FMVACMQFINIVVHSVENMNFRVFLQYEFTHLGLDLYLERLRLTESDKLQVQIQAYLDNV 100 110 120 130 140 150 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 FDVGGLLEDAETKNVALEKVEELEEHVSHLTEKLLDLENENMMRVAELEKQLLQREKELE :::: :::..::::..::..:::.:.:. :::.: : ::..: ..::::::: : .:::: mFLJ00 FDVGTLLEETETKNAVLEHMEELQEQVATLTERLRDTENDSMAKIAELEKQLSQARKELE 160 170 180 190 200 210 460 470 480 490 500 510 mKIAA2 SIKETYENTSNQVHTLRRLIKEKEEAFQRRCHLEPSARGL--ESMGGEALARV--GPTEL ...: . . :. . : :: : : :.. ..::: : : . ..: :. :: .. mFLJ00 TLRERF-SESTPMGTSRR-IPEPEKVPVPTV-VRPSALELKVEELEEKGLIRILRGPGDV 220 230 240 250 260 520 mKIAA2 T--EGIP-----PSDLDLLAP--------------------------------------A . : .: :: : :: : mFLJ00 VSIEILPGAAATPSGDDAQAPRVSTDSPSTAESIPEAASPPPPPPPPPPPLPNLQSQQEA 270 280 290 300 310 320 530 540 550 560 570 mKIAA2 PPTEETL--PLP----PPPAPPLP----PPPPPLPDKC-----PPAPPLPGAAPSVVLTV ::. : ::: :::::::: ::::: : :: :: ::. :... mFLJ00 PPSAPPLAPPLPGCAEPPPAPPLPGDLPPPPPPPPLGTDGPVPPPPPPPPGGPPDILGGQ 330 340 350 360 370 380 580 590 600 610 620 mKIAA2 GLS---AIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQINGTVFSELDDEKILEDLDLDRFEELFK : . ... ::::.::::.:..::.::::.::.::::.::.:::.:..::.. ::: :: mFLJ00 GPDIGPGVKAKKPIQTKFRMPLLNWVALKPSQITGTVFTELNDEKVLQELDMNDFEEHFK 390 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 680 mKIAA2 TKAQGPALDLICSKNKTAQKAASKVTLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEICRAIHTFDLQ ::.::: ::. :.:..::: .:. :.::::::::::::::.. .:..::.::.:.::: mFLJ00 TKSQGPCLDISALKGKASQKAPTKTILIEANRAKNLAITLRKGNLGADRICQAIETYDLQ 450 460 470 480 490 500 690 700 710 720 730 740 mKIAA2 TLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMAGMA :: .::.: : :::::. : .:. ..:.:..:.:::. :::::: ::...:: .:: .. mFLJ00 TLSLDFLELLTRFLPTDYERSLIARFEKEQRPMEELSEEDRFMLRFSRIQRLPERMNTLT 510 520 530 540 550 560 750 760 770 780 790 800 mKIAA2 FLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKRGAVYGFKLQ ::::: :. :.: :::::::::: :.:::.::.:.:::.::.:::::::::::.:::.:: mFLJ00 FLGNFPDTAQLLMPQLNAIIAASMSIKSSDKLRQILEIVLAFGNYMNSSKRGAAYGFRLQ 570 580 590 600 610 620 810 820 830 840 850 860 mKIAA2 SLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPELANFWQELHFVEKAAAVSLENVLLDVKEL ::: ::. ::::::.::::... .. ::::.:..: ..:::..::..:::..:: ::. : mFLJ00 SLDALLEMKSTDRKQTLLHYLVKVIAEKYPQLTGFHSDLHFLDKAGSVSLDSVLGDVRSL 630 640 650 660 670 680 870 880 890 900 910 920 mKIAA2 GRGMELIRRECSIHDNS-VLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEEAYNAVVRYFGESPKTTP ::.:: .:: .:. ::..:: .: .::: :.:::.:::..::.::::.:::: mFLJ00 QRGLELTQREFVRQDDCLVLKEFLRANSPTMDKLLADSKTAQEAYESVVEYFGENPKTTS 690 700 710 720 730 740 930 940 950 960 970 980 mKIAA2 PSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEARKKQEEVMREKQLAQEAKKLDAKTPSQ--RNKWQQQ ::.:: .: :: ..::.:::: : ::. :. . . . ::.. . . ::. mFLJ00 PSMFFSLFSRFTKAYKKAEQEVEQWKKEAA-------ADTSGREEPPTPKSPPKARRQQM 750 760 770 780 790 800 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA2 ELIAELRRRQAKEHRP-VYEG-KDGTIEDIITVLKSVPFT-ARTAKRGSRFFCDAAHHDE .::.::.:.: :: : .::. .::.:::::: :.. :. : :..:..: mFLJ00 DLISELKRKQQKE--PLIYESDRDGAIEDIITDLRNQPYIRADTGRRSARRRPPGPPLPV 810 820 830 840 850 mKIAA2 SNC mFLJ00 TTDLAL 860 >>mKIAA1902 ( 293 res) mph04215 (293 aa) initn: 857 init1: 637 opt: 1231 Z-score: 608.9 bits: 122.5 E(): 9e-29 Smith-Waterman score: 1231; 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