FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1764.ptfa, 1034 aa vs ./tmplib.26680 library 1767983 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5953+/-0.0079; mu= -0.9751+/- 0.522 mean_var=434.4773+/-104.169, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0615 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 359 48 1.6e-05 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 343 46 3.5e-05 mKIAA1074 ( 1043 res) mfj11296 (1043) 322 44 0.00011 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 (1693) 290 42 0.001 mKIAA1601 ( 856 res) mpm03175 ( 856) 279 40 0.0014 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 260 39 0.0069 mKIAA1509 ( 1178 res) mbg12984 (1178) 254 38 0.0079 >>mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984 aa) initn: 120 init1: 86 opt: 359 Z-score: 191.4 bits: 48.0 E(): 1.6e-05 Smith-Waterman score: 409; 23.990% identity (27.859% ungapped) in 792 aa overlap (295-1034:940-1673) 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 TPEDNVLASLLSVCPSSEPEKINQENDFQNEVKLQKLDDQILQLLNETNNSLIDNVPEKD :..:.. .:. :: : .. . . : mKIAA0 AETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILHEMEARLEEEEDRGQQLQAERKKMAQQML---D 910 920 930 940 950 960 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 LRPKRDTDITSESDYGNRRECSRKVPRRTKIPYYARTIQTIKHHNKNNGAFVSCNRKMRQ :. . . : . . .. .:: ..:: : .. .:.. .: .::. . mKIAA0 LEEQLE-----EEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKLEDDILVMDDQNSK----LSKERKLLE 970 980 990 1000 1010 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 PYLRDLYVRSSLVNCNNLRDLDEQKTGVIKVDKNFSDNSTYRSLVEQLDQEREMRWKAEQ . :: .:: . .:. .. :. .. .: : .: .:.. : . :. mKIAA0 ERVSDL--------TTNLAEEEEKAKNLTKLKSKH--ESMISELEVRLKKEEKSRQELEK 1020 1030 1040 1050 1060 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 TEKKLMDYIDELHKQADEKKDVHSQALITTDRLKDAIFKERHCKAQLEIIVHRLQNEVKK ..:: ...:.: :. :: :. ... : ::.. .: : ::..:. . mKIAA0 LKRKLEGDASDFHEQI---ADL--QAQIAELKMQLAK-KEEELQAALA----RLDEEIAQ 1070 1080 1090 1100 1110 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 LTIELMKARDQQEDHIRHLRTLERALEKMEKQKAQQQAAQIRLIQEVELKASAADREINL . : : :. : :: :. . :. ..::..: : . : ::.: .. : .: mKIAA0 KNNALKKIREL-EGHISDLQE-DLDSERAARNKAEKQK---RDLGE-ELEALKTELEDTL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 570 580 590 600 610 mKIAA1 LRTSLHQE-----KQQVQQLHELLALKEQEHRQEI-ETRQFFTDAEFQDALTKRLCKEER :. .:: .:.: :.. : . . :. .. : :: :.: . ::..: . .: mKIAA0 DSTATQQELRAKREQEVTVLKKALDEETRSHEAQVQEMRQKHTQAV--EELTEQLEQFKR 1180 1190 1200 1210 1220 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 KHEQEVKEYQEKIDILNQQYLDLENEFRI----ALTVEARRFK-DVQDGFEDVATELAKS . . : : :... :: .:.:. :: .. : .:: ..:. .. . . mKIAA0 AKANLDKSKQT----LEKENADLAGELRVLGQAKQEVEHKKKKLEVQ--LQDLQSKCSDG 1230 1240 1250 1260 1270 1280 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 KHALIWAQRKENESSSLIKDLTCMVKEQKTKLSEVCKLKQEAAANLQNQI-NTLEILIED ..: . : .. .. ....: :..: . : . :: ...:. : .:. .: :.: :. mKIAA0 ERARAELSDKVHKLQNEVESVTGMLNEAEGK---AIKLAKDVAS-LGSQLQDTQELLQEE 1290 1300 1310 1320 1330 740 750 760 770 mKIAA1 DKQK---SIQIELLKHEKT----QLISELAAKESLIYGLRT------ERKVWGQELACQS .:: : ... :. :.. :: :. ::..: . : . : :..: mKIAA0 TRQKLNVSTKLRQLEDERNSLQDQLDEEMEAKQNLERHVSTLNIQLSDSKKKLQDFASTI 1340 1350 1360 1370 1380 1390 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 STLSQSRGKLEAQIESLCRENESLRKSHESDCDAL-RIKCKIIEDQNETI------RKLK .. ... .:. ..:.: .. : .. : : . : .. .. .. . :.: mKIAA0 EVMEEGKKRLQKEMEGLSQQYEEKAAAY----DKLEKTKNRLQQELDDLVVDLDNQRQLV 1400 1410 1420 1430 1440 1450 840 850 860 870 880 mKIAA1 DSLQEKDGQI-KLLQEQIALIEKCSQE------QLNEKSSQLDSIVEKLERHNERKEKLK ..:..:. .. .:: :. . : ..: . :: .. :... ::. : ::.:. mKIAA0 SNLEKKQKKFDQLLAEEKNISSKYADERDRAEAEAREKETKALSLARALEEALEAKEELE 1460 1470 1480 1490 1500 1510 890 900 910 920 930 940 mKIAA1 QQLKAKELELEEIRKAYSTLNKKWHDKGELLSHLEMQVKEVKEKFEDKERKLKAERDKSL . : . :.:.. .. . ..:. :. . :: :..:.: ..:. : .:.: .: .: mKIAA0 RTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKL 1520 1530 1540 1550 1560 1570 950 960 970 980 990 mKIAA1 ELQ------KDAMEK-LQNMDDA---FRRQVDEIVEAHQAEIMQLANEKQKYIDCANLKV .:. : .:. :: :. :::... .. ...: : .:... : : mKIAA0 RLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETE---LEDERKQRALAAAAK- 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 QQVEDEMRGLLDETCKNKKMMEEKIKQ---LACAISEIQKEM ...: ... : .. . : :: ::: : ....:.:. mKIAA0 KKLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELDDARASRDEIFATSKENE 1640 1650 1660 1670 1680 1690 mKIAA0 KKAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNTLQDEKRRLEARIA 1700 1710 1720 1730 1740 1750 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 193 init1: 109 opt: 343 Z-score: 185.3 bits: 46.3 E(): 3.5e-05 Smith-Waterman score: 399; 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