FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1548.ptfa, 789 aa vs ./tmplib.26680 library 1768228 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3518+/-0.00475; mu= 20.8381+/- 0.318 mean_var=111.3919+/-26.102, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1215 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0338 ( 907 res) mbg08118 ( 907) 959 180 1.4e-45 mKIAA4056 ( 844 res) mfj33372 ( 844) 932 175 3.5e-44 mKIAA0987 ( 851 res) mfk00358 ( 851) 673 129 1.6e-30 mKIAA1013 ( 989 res) mpg00833 ( 989) 239 53 1.4e-07 mKIAA1027 ( 2564 res) mia05043 (2564) 211 49 7.1e-06 >>mKIAA0338 ( 907 res) mbg08118 (907 aa) initn: 929 init1: 529 opt: 959 Z-score: 910.8 bits: 179.6 E(): 1.4e-45 Smith-Waterman score: 959; 41.406% identity (43.324% ungapped) in 384 aa overlap (68-443:103-477) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 VSVASRCSPPSTEMLSFLRRTLGRRSMRKHAEKERLREAQRAATHIPAAGDAKSIITCRV .:. .::.. .: : :: : ::: mKIAA0 NEKHLTQQDTRPAEQSLDMDDKDYSEADGLSERTTPSKAQKSPQKI--AKKFKSAI-CRV 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 SLLDGTDVSVDLPKKAKGQELFDQIMYHLDLIESDYFGLRFMDSAQVAHWLDGTKSIKKQ .:::... .. :...:: ::: . ::.:.:.::::: : :. . .::: .: :::: mKIAA0 TLLDASEYECEVEKHGRGQVLFDLVCEHLNLLEKDYFGLTFCDADSQKNWLDPSKEIKKQ 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 VKIGSPYCLHLRVKFYSSEPNNLREELTRYLFVLQLKQDILSGKLECPFDTAVQLAAYNL .. .::. . . :::: .: .: :..::: . :::. ::..:.: : : : . :..: . mKIAA0 IR-SSPWNFAFTVKFYPPDPAQLTEDITRYYLCLQLRADIITGRLPCSFVTHALLGSYAV 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 QAELGDYDLAEHSPELVSEFRFVPIQTEEMELAIFEKWKEYRGQTPAQAETNYLNKAKWL :::::::: :: . :::.::.: ::.:.: :.: : :::.::..:: ..:..:: : mKIAA0 QAELGDYDAEEHVGNYVSELRFAPNQTRELEERIMELHKTYRGMTPGEAEIHFLENAKKL 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 EMYGVDMHVVKARDGNDYSLGLTPTGVLVFEGETKIGLFFWPKITRLDFKKNKLTLVVVE :::::.: .: .: : ::. .:.:... . .:. : :::: ....:.... . . mKIAA0 SMYGVDLHHAKDSEGIDIMLGVCANGLLIYRDRLRINRFAWPKILKISYKRSNFYIKIRP 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 DDDQGKEQEHTFVFRLDHPKACKHLWKCAVEHHAFFRLRGPVQKSSHRSGFIRLGSRFRY . . . : :. :.: . .. :.::: .:::.:::: .: . ::. .::.::: mKIAA0 GEYE--QFESTIGFKLPNHRSAKRLWKVCIEHHTFFRLVSPEPPPK---GFLVMGSKFRY 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 mKIAA1 SGKTEYQTTKTNK--ARRSTSFERRPSKRYS-RRTLQ-----MKASTTQPEDLGRFSSLL ::.:. :: ... : . ::: ::::. :.:. ::... .: : mKIAA0 SGRTQAQTRQASALIDRPAPFFERSSSKRYTMSRSLDGAEFSRPASVSENHDAGPEGDKR 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 YSVLNASAQKSDSQQAWGVMSPVPVTSSSSCGAVQVEIENLPQTSATEQHDRKCLPLSVD mKIAA0 EDDAESGGRRSEAEEGEVRTPTKIKELKPEQETTPRHKQEFLDKPEDVLLKHQASINELK 490 500 510 520 530 540 >>mKIAA4056 ( 844 res) mfj33372 (844 aa) initn: 826 init1: 521 opt: 932 Z-score: 885.5 bits: 174.8 E(): 3.5e-44 Smith-Waterman score: 940; 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