# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm02067.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1548.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1548, 789 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919422 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2520+/-0.000193; mu= 12.8926+/- 0.011 mean_var=75.2441+/-14.967, 0's: 37 Z-trim: 45 B-trim: 1410 in 2/66 Lambda= 0.147856 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148707867|gb|EDL39814.1| erythrocyte protein ba ( 783) 5089 1095.4 0 gi|81873727|sp|Q8BGS1.1|E41L5_MOUSE RecName: Full= ( 731) 4753 1023.7 0 gi|26330111|dbj|BAC28794.1| unnamed protein produc ( 731) 4742 1021.4 0 gi|187471072|sp|Q5FVG2.2|E41L5_RAT RecName: Full=B ( 731) 4393 946.9 0 gi|119615641|gb|EAW95235.1| erythrocyte membrane p ( 733) 3967 856.0 0 gi|187608883|sp|Q9HCM4.3|E41L5_HUMAN RecName: Full ( 733) 3962 855.0 0 gi|114580603|ref|XP_001157953.1| PREDICTED: erythr ( 733) 3958 854.1 0 gi|119615639|gb|EAW95233.1| erythrocyte membrane p ( 732) 3948 852.0 0 gi|149759113|ref|XP_001492516.1| PREDICTED: simila ( 732) 3884 838.3 0 gi|10434740|dbj|BAB14360.1| unnamed protein produc ( 687) 3701 799.3 0 gi|114580605|ref|XP_001157901.1| PREDICTED: hypoth ( 687) 3690 796.9 0 gi|62630113|gb|AAX88859.1| unknown [Homo sapiens] ( 533) 3034 656.9 5.9e-186 gi|13278193|gb|AAH03937.1| Epb4.1l5 protein [Mus m ( 504) 2928 634.3 3.6e-179 gi|224054688|ref|XP_002190499.1| PREDICTED: simila ( 786) 2930 634.9 3.8e-179 gi|74195432|dbj|BAE39535.1| unnamed protein produc ( 504) 2916 631.7 2.1e-178 gi|109104478|ref|XP_001088764.1| PREDICTED: erythr ( 726) 2900 628.4 3e-177 gi|58476614|gb|AAH90012.1| Erythrocyte protein ban ( 504) 2809 608.9 1.6e-171 gi|23270923|gb|AAH32822.1| EPB41L5 protein [Homo s ( 505) 2742 594.6 3.2e-167 gi|114580607|ref|XP_001157755.1| PREDICTED: erythr ( 505) 2735 593.1 9e-167 gi|75050384|sp|Q9MYU8.1|E41L5_CANFA RecName: Full= ( 505) 2709 587.6 4.2e-165 gi|75057558|sp|Q58CU2.1|E41L5_BOVIN RecName: Full= ( 502) 2636 572.0 2e-160 gi|223647792|gb|ACN10654.1| Band 4.1-like protein ( 766) 2567 557.4 7.6e-156 gi|46849979|gb|AAT02412.1| mosaic eyes [Danio reri ( 776) 2564 556.8 1.2e-155 gi|118093800|ref|XP_422083.2| PREDICTED: similar t ( 502) 2535 550.5 6.2e-154 gi|195539962|gb|AAI67959.1| Epb41l5 protein [Xenop ( 747) 2382 517.9 5.7e-144 gi|89268624|emb|CAJ83325.1| erythrocyte membrane p ( 498) 2360 513.1 1.1e-142 gi|37682117|gb|AAQ97985.1| erythrocyte membrane pr ( 772) 2361 513.5 1.3e-142 gi|125826061|ref|XP_001343472.1| PREDICTED: simila ( 772) 2361 513.5 1.3e-142 gi|33416630|gb|AAH55968.1| Epb4.1l5 protein [Xenop ( 498) 2357 512.5 1.7e-142 gi|149637751|ref|XP_001509941.1| PREDICTED: hypoth ( 820) 1969 429.9 2e-117 gi|73971944|ref|XP_532028.2| PREDICTED: similar to ( 914) 1942 424.2 1.2e-115 gi|119579448|gb|EAW59044.1| erythrocyte membrane p ( 881) 1933 422.2 4.4e-115 gi|209572611|sp|Q9H329.2|E41LB_HUMAN RecName: Full ( 900) 1933 422.2 4.4e-115 gi|12002682|gb|AAG43366.1|AF153416_1 FERM-containi ( 913) 1933 422.2 4.5e-115 gi|123229181|emb|CAM19969.1| erythrocyte protein b ( 899) 1930 421.6 6.9e-115 gi|149739724|ref|XP_001491824.1| PREDICTED: erythr ( 833) 1929 421.4 7.5e-115 gi|194669706|ref|XP_597526.4| PREDICTED: similar t ( 868) 1910 417.3 1.3e-113 gi|209572833|sp|B2RYE5.1|E41LB_RAT RecName: Full=B ( 527) 1864 407.3 7.9e-111 gi|126333972|ref|XP_001364288.1| PREDICTED: simila ( 515) 1860 406.5 1.4e-110 gi|126333970|ref|XP_001364211.1| PREDICTED: simila ( 898) 1860 406.7 2.2e-110 gi|123229182|emb|CAM19970.1| erythrocyte protein b ( 527) 1857 405.8 2.2e-110 gi|30172954|sp|Q9JMC8.1|E41LB_MOUSE RecName: Full= ( 527) 1856 405.6 2.6e-110 gi|119579447|gb|EAW59043.1| erythrocyte membrane p ( 499) 1852 404.8 4.5e-110 gi|12002686|gb|AAG43368.1|AF153418_1 FERM-containi ( 504) 1852 404.8 4.5e-110 gi|55664811|emb|CAH71093.1| erythrocyte membrane p ( 518) 1852 404.8 4.6e-110 gi|8096551|dbj|BAA96079.2| EHM2 [Homo sapiens] ( 518) 1851 404.6 5.3e-110 gi|74227227|dbj|BAE38378.1| unnamed protein produc ( 524) 1848 403.9 8.4e-110 gi|148670301|gb|EDL02248.1| mCG3043 [Mus musculus] ( 464) 1824 398.8 2.6e-108 gi|118086655|ref|XP_419046.2| PREDICTED: similar t ( 839) 1819 397.9 8.8e-108 gi|114626099|ref|XP_520178.2| PREDICTED: erythrocy ( 925) 1790 391.7 6.9e-106 >>gi|148707867|gb|EDL39814.1| erythrocyte protein band 4 (783 aa) initn: 2955 init1: 2955 opt: 5089 Z-score: 5861.5 bits: 1095.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5089; 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