# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpj02652.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1009.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
mKIAA1009, 620 aa
vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library
2727779818 residues in 7921681 sequences
statistics sampled from 60000 to 7918176 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9912+/-0.000196; mu= 8.5184+/- 0.011
mean_var=104.8882+/-19.888, 0's: 32 Z-trim: 39 B-trim: 2 in 1/65
Lambda= 0.125231
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(7921681)
gi|223462495|gb|AAI51105.1| RIKEN cDNA 4922501C03 (1403) 4029 739.1 2.2e-210
gi|148694578|gb|EDL26525.1| mCG11890, isoform CRA_ (1366) 3944 723.7 9.2e-206
gi|148694577|gb|EDL26524.1| mCG11890, isoform CRA_ (1406) 3944 723.7 9.4e-206
gi|109485065|ref|XP_001063109.1| PREDICTED: simila (1403) 3483 640.5 1.1e-180
gi|158563784|sp|Q4KLH6.2|QN1_RAT RecName: Full=Pro (1403) 3478 639.5 2.1e-180
gi|116283237|gb|AAH04073.1| 4922501C03Rik protein ( 475) 2766 510.5 4.8e-142
gi|109071904|ref|XP_001086275.1| PREDICTED: simila (1325) 2698 498.6 5.2e-138
gi|119569029|gb|EAW48644.1| chromosome 6 open read (1401) 2661 491.9 5.6e-136
gi|149018961|gb|EDL77602.1| rCG25580, isoform CRA_ (1065) 2616 483.7 1.3e-133
gi|73973878|ref|XP_532220.2| PREDICTED: similar to (1405) 2589 478.9 4.6e-132
gi|149638940|ref|XP_001512972.1| PREDICTED: simila (1476) 1332 251.9 1.1e-63
gi|82109548|sp|Q91365.1|QN1_COTCO RecName: Full=Pr (1251) 996 191.1 1.8e-45
gi|118088850|ref|XP_419856.2| PREDICTED: similar t (1476) 940 181.0 2.3e-42
gi|224048476|ref|XP_002188543.1| PREDICTED: simila (1366) 930 179.2 7.7e-42
gi|193785775|dbj|BAG51210.1| unnamed protein produ ( 789) 670 132.0 7e-28
gi|210103078|gb|EEA51118.1| hypothetical protein B (1650) 310 67.2 4.6e-08
gi|156225903|gb|EDO46717.1| predicted protein [Nem (1313) 263 58.7 1.4e-05
>>gi|223462495|gb|AAI51105.1| RIKEN cDNA 4922501C03 gene (1403 aa)
initn: 4029 init1: 4029 opt: 4029 Z-score: 3933.3 bits: 739.1 E(): 2.2e-210
Smith-Waterman score: 4029; 99.839% identity (100.000% similar) in 620 aa overlap (1-620:114-733)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 EESAEKVQFLKSSGTSILSVDSLEANELVVSEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
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100 110 120 130 140 150
mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
mKIAA1 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
mKIAA1 RSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATDSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 RSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATDSKE
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
mKIAA1 AESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDKMYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 AESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDKMYL
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340 350 360 370 380 390
mKIAA1 EILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKPQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 EILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKPQSG
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400 410 420 430 440 450
mKIAA1 LYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKLIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 LYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKLIKP
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460 470 480 490 500 510
mKIAA1 AASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 AASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560 570
mKIAA1 TGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETSRKQ
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 TGAQTLMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETSRKQ
630 640 650 660 670 680
580 590 600 610 620
mKIAA1 RWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|223 RWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQEQNKKNEERMF
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gi|223 KENQNLFSELASLKEQMHKNHFLSQAVENTEPTKNQSFTDLLAELRAAQKEKNHLMEDIK
750 760 770 780 790 800
>>gi|148694578|gb|EDL26525.1| mCG11890, isoform CRA_b [M (1366 aa)
initn: 3216 init1: 3181 opt: 3944 Z-score: 3850.4 bits: 723.7 E(): 9.2e-206
Smith-Waterman score: 3944; 97.913% identity (98.234% similar) in 623 aa overlap (1-620:114-736)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 EESAEKVQFLKSSGTSILSVDSLEANELVVSEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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40 50 60 70 80 90
mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140
mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTG---MLANVVLLDSFDSVEDVGLSS
::::::::::::::.::::::::::::::: .: :::::::::::::::::
gi|148 EDADDPLITKDEETYPKENSESGKDSFPKQFSAPLTSFFHVAAVVLLDSFDSVEDVGLSS
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
mKIAA1 QEKATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QEKATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTV
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
mKIAA1 QTVRSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QTVRSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATD
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
mKIAA1 SKEAESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 SKEAESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDK
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330 340 350 360 370 380
mKIAA1 MYLEILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 MYLEILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKP
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390 400 410 420 430 440
mKIAA1 QSGLYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QSGLYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKL
510 520 530 540 550 560
450 460 470 480 490 500
mKIAA1 IKPAASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 IKPAASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAE
570 580 590 600 610 620
510 520 530 540 550 560
mKIAA1 EKWTGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 EKWTGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETS
630 640 650 660 670 680
570 580 590 600 610 620
mKIAA1 RKQRWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 RKQRWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQEQNKKNEE
690 700 710 720 730 740
gi|148 RMFKENQNLFSELASLKEQMHKNHFLSQAVENTEPTKNQSFTDLLAELRAAQKEKNHLME
750 760 770 780 790 800
>>gi|148694577|gb|EDL26524.1| mCG11890, isoform CRA_a [M (1406 aa)
initn: 3216 init1: 3181 opt: 3944 Z-score: 3850.3 bits: 723.7 E(): 9.4e-206
Smith-Waterman score: 3944; 97.913% identity (98.234% similar) in 623 aa overlap (1-620:114-736)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 EESAEKVQFLKSSGTSILSVDSLEANELVVSEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
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100 110 120 130 140
mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTG---MLANVVLLDSFDSVEDVGLSS
::::::::::::::.::::::::::::::: .: :::::::::::::::::
gi|148 EDADDPLITKDEETYPKENSESGKDSFPKQFSAPLTSFFHVAAVVLLDSFDSVEDVGLSS
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
mKIAA1 QEKATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QEKATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTV
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210 220 230 240 250 260
mKIAA1 QTVRSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QTVRSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATD
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mKIAA1 SKEAESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 SKEAESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDK
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330 340 350 360 370 380
mKIAA1 MYLEILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 MYLEILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKP
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390 400 410 420 430 440
mKIAA1 QSGLYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 QSGLYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKL
510 520 530 540 550 560
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mKIAA1 IKPAASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 IKPAASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAE
570 580 590 600 610 620
510 520 530 540 550 560
mKIAA1 EKWTGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 EKWTGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETS
630 640 650 660 670 680
570 580 590 600 610 620
mKIAA1 RKQRWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|148 RKQRWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQEQNKKNEE
690 700 710 720 730 740
gi|148 RMFKENQNLFSELASLKEQMHKNHFLSQAVENTEPTKNQSFTDLLAELRAAQKEKNHLME
750 760 770 780 790 800
>>gi|109485065|ref|XP_001063109.1| PREDICTED: similar to (1403 aa)
initn: 3483 init1: 3483 opt: 3483 Z-score: 3400.2 bits: 640.5 E(): 1.1e-180
Smith-Waterman score: 3483; 87.258% identity (94.516% similar) in 620 aa overlap (1-620:110-729)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
:: :::::::::::::::::::::::::::
gi|109 EEENEKVQFLKSSGTSVLSVDSLEANELVASELHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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40 50 60 70 80 90
mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
::::::::::::::::::::::...:::: :.:::: : :::::.::::::::::::::
gi|109 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQFRVLHRYQGNVEPAEGGRENESEHEELPETYSDDFEDA
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
::.:.:::::::::.:::: :::: :::.:::::::::::::::::::::::: :...:.
gi|109 EDTDEPLITKDEETRPKENPESGKGSFPNQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVDLNNHER
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
mKIAA1 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
:::::: ::.. ::::: ::::::::::::::: ::::::::::::::::: ..:
gi|109 PTPKAKALPEMAGGELAETGVSYGQSSGDTEALHQAYHHVAHSLGDTGEPRIEASPGHSV
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
mKIAA1 RSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATDSKE
::: :::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.:::::.::.::. :::
gi|109 RSSAKDGLQENEESSKNISTTESDLPTVEELMKPIRIDSYGIRGFDLQPVSLQKAVGSKE
320 330 340 350 360 370
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mKIAA1 AESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDKMYL
::::.:::: .::::.::::::. :::..:::::::::: ::.::::::::::::::::
gi|109 AESVSSLPLTVNTNTMSQDTRHVSPFPHEQDESVVLHRTAGEGVGSSCPATEEHLDKMYL
380 390 400 410 420 430
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mKIAA1 EILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKPQSG
:::.:::::::::::::.: ::::::.:.: ::.:: .::::::::::.: ::.::::::
gi|109 EILRKKTSVNPSLLPQDNKANQTSRSRLSAREEAPVTSKQVPCKKARSAPPLPRRKPQSG
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
mKIAA1 LYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKLIKP
::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::::
gi|109 LYASARSSGYSKPSSPLQFFSALEKKTSKDNTKTKNVRPIPTSNQFRKREILSGTKLIKP
500 510 520 530 540 550
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mKIAA1 AASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
:: ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
gi|109 AALNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTETLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
mKIAA1 TGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETSRKQ
:::::.::.:::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
gi|109 RGAQALIEQIKMTFSEKEKELENTVESLKRQQERELFKLNQENYILQAKLSSFEETSRKQ
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620
mKIAA1 RWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQE
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
gi|109 RWLQFGETSDPLTEEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYSQVKDLQEQNKKNEERMF
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gi|109 KENQNLFSELASLKEQMHKNHFLPQAVENIEPTKNQSFTDLLAELRAAQKEKNHLMEDIK
740 750 760 770 780 790
>>gi|158563784|sp|Q4KLH6.2|QN1_RAT RecName: Full=Protein (1403 aa)
initn: 3478 init1: 3478 opt: 3478 Z-score: 3395.3 bits: 639.5 E(): 2.1e-180
Smith-Waterman score: 3478; 87.097% identity (94.516% similar) in 620 aa overlap (1-620:110-729)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
:: :::::::::::::::::::::::::::
gi|158 EEENEKVQFLKSSGTSVLSVDSLEANELVASELHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
::::::::::::::::::::::...:::: :.:::: : :::::..:::::::::::::
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mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
::.:.:::::::::.:::: :::: :::.:::::::::::::::::::::::: :...:.
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mKIAA1 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
:::::: ::.. ::::: ::::::::::::::: ::::::::::::::::: ..:
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::: :::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.:::::.::.::. :::
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mKIAA1 AESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCPATEEHLDKMYL
::::.:::: .::::.::::::. :::..:::::::::: ::.::::::::::::::::
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:::.:::::::::::::.: ::::::.:.: ::.:: .::::::::::.: ::.::::::
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mKIAA1 LYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKLIKP
::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::::
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mKIAA1 AASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
:: ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
gi|158 AALNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTETLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
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mKIAA1 TGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEETSRKQ
:::::.::.:::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
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580 590 600 610 620
mKIAA1 RWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQE
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
gi|158 RWLQFGETSDPLTEEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYSQVKDLQEQNKKNEERMF
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gi|158 KENQNLFSELASLKEQMHKNHFLPQAVENIEPTKNQSFTDLLAELRAAQKEKNHLMEDIK
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>>gi|116283237|gb|AAH04073.1| 4922501C03Rik protein [Mus (475 aa)
initn: 2801 init1: 2766 opt: 2766 Z-score: 2706.4 bits: 510.5 E(): 4.8e-142
Smith-Waterman score: 2766; 96.591% identity (98.864% similar) in 440 aa overlap (1-440:35-474)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
::::::::::::::::::::::::::::::
gi|116 EESAEKVQFLKSSGTSILSVDSLEANELVVSEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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40 50 60 70 80 90
mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
::::::::::::::::::::::::::: ::.:.::.:::::::::.::::::::::::::
gi|116 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHSYPHNAEPTEDGCENESEHEELPETYSDDFEDA
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mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|116 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
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160 170 180 190 200 210
mKIAA1 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
gi|116 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASIVQTV
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220 230 240 250 260 270
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:::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::: :::::::::::::::.::::
gi|116 RSSIKDGLQENEESSKNISTTESDLPTVEKLMQPIRIDSDGIRAFDLQPISLKKAADSKE
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280 290 300 310 320 330
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::::
gi|116 AESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGVGSSCSATEEHLDKMYL
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340 350 360 370 380 390
mKIAA1 EILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKPQSG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|116 EILKKKTSVNPSLLPQDDKTNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKPQSG
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400 410 420 430 440 450
mKIAA1 LYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKLIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..
gi|116 LYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKKKK
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460 470 480 490 500 510
mKIAA1 AASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDAEEKW
>>gi|109071904|ref|XP_001086275.1| PREDICTED: similar to (1325 aa)
initn: 2041 init1: 914 opt: 2698 Z-score: 2634.0 bits: 498.6 E(): 5.2e-138
Smith-Waterman score: 2698; 67.949% identity (86.378% similar) in 624 aa overlap (1-620:35-657)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
:: .:: ::.::::::::::::::::::::
gi|109 EESAEKIQFLKSSGTSLLSTDSLETNELVVSELNHSILGVGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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40 50 60 70 80 90
mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
:::::::::.::.::::.:: ..:::: :.: ..: ::::..::: :.:::::::
gi|109 GLTSSIDYSRLNKELDSNDSIHFKALHSNQANVELTDDEHENESKHEELAENYSDDFED-
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mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
: . :: :::::: ::::.: : : :::::::::::::::::::.::: .:.:. :..
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mKIAA1 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
::: .. ::.:.. . ::: :::::.:.:::::::::.:::::: . .:...:.. .
gi|109 ITPKPRGLPEMTENEMTGTGVSYGQSSSDVEALHQAYCHIAHSLGDEDKQKIDSNTMEDI
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220 230 240 250 260 270
mKIAA1 RSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATDSKE
.::.: :::::.::: :: :::::::::::.::::::.:. .:::::.: .:...:::
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280 290 300 310 320
mKIAA1 AESVGSLPLKTNTNTVSQDTRHAIQFPHKHDESVVLHRTADEGMGSSCP---ATEEHLDK
.: :.::::::: : .:::..:. .: :.::.:.:..:..:.: .::: :::::.::
gi|109 TEFVNSLPLKTNPNIMSQDSQHVNHFFDKNDENVILQKTTNESMENSCPQVTATEEHVDK
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330 340 350 360 370 380
mKIAA1 MYLEILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKARSTPSLPKRKP
:::.::.:: ::: : : ::::.:.: ::::.. :: :.::::: :::::.: : ::::
gi|109 MYLNILRKKISVNSSSLSQDDKINKTYRSQLSSEEEGAVMGKQVPYKKARSAPPLLKRKP
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mKIAA1 QSGLYASARSSGYGKPSSPLQLFSALEKKTSKDNTKTKSVRSIPTSNQFRKREILSGTKL
. :::::.::::::::::::..::.::.::: : :.:..::: :::: :..::::::::
gi|109 HRGLYASVRSSGYGKPSSPLKMFSTLENKTSGDIIKSKNLRSISTSNQPRRKEILSGTKL
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mKIAA1 IKPAASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSD-DSFVQLQTEPLGSYGGNREKELLMLKRAQDA
::::: .::.:. :. .:::. :::.. :: .:.::. :: : :.:.::::.::.:.:
gi|109 IKPAALDKPAPKTESCLVTPKKSEDPTETDSCIQFQTDSLGYCGENKEEELLMFKRVQEA
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mKIAA1 EEKWTGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYILQAKLSSFEET
:::: :::::.::.: :: :::::::: .: ::.:::.:::.:::.::::::::::::::
gi|109 EEKWRGAQALIEQIKATFSEKEKELENKLEELKKQQEKELFKLNQDNYILQAKLSSFEET
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mKIAA1 SRKQRWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQE
..: :::.:::..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|109 NKKTRWLHFGEAADPVTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQEQNKKNE
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gi|109 ERMFKENQSLFSEVASLKEQMHKSRFLSQVVEDSEPTRNQNFTDLLAELRMAQKEKDSLL
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>>gi|119569029|gb|EAW48644.1| chromosome 6 open reading (1401 aa)
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Smith-Waterman score: 2661; 67.464% identity (85.486% similar) in 627 aa overlap (1-620:111-734)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
:: .::.::.::::::::::::::::::::
gi|119 EESAEKIQFLKSSGTSLLSTDSLETNELVVSELNHSSLGVGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
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mKIAA1 GLTSSIDYSKLNQELDSDDSAQLKALHRYPRNTEPAEDGCENESEQEELPETYSDDFEDA
:::::::::.::.::::.::...:::: :.: ..: ::::..::: :.:::::::
gi|119 GLTSSIDYSRLNKELDSNDSTHFKALHSNQANAELTDDEHENESKHEELAENYSDDFED-
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mKIAA1 EDADDPLITKDEETHPKENSESGKDSFPKQEEEKTGMLANVVLLDSFDSVEDVGLSSQEK
: . :: ::::: ::::.: : : :::::::::::::::::::.::: .:.:. :.:
gi|119 EYVGAPLTTKDEEMPSKENSKSEKISVPKQEEEKTGMLANVVLLDSLDSVAEVNLDEQDK
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mKIAA1 ATPKAKAPPEITDDGPAETGVPYGQSSGDTEALHQAYCHVAHSLGDTGEPRIEASTVQTV
::: . ::.:.. . ::: :::::.:.:::::::::.:::::: . .::..::. .
gi|119 ITPKPRCLPEMTENEMTGTGVSYGQSSSDVEALHQAYCHIAHSLGDEDKQKIESNTVEDI
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mKIAA1 RSSIKDGLQENEESSKNVSTTESDLPTVEELMQPIRIDSYGIRAFDLQPISLKKATDSKE
.::.: :::::.:::.:: :::::::::::.::::::.:: .:::::.: .:... ::
gi|119 KSSVKGHPQENEENSKNISTMESDLPTVEELMKPIRIDSFGISGFDLQPVSSEKVAERKE
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.: .::::: : : .:::..:. : :.::.:.:..:..:.: .::: :::::
gi|119 TEFFSSLPLKMNPNILSQDSQHVNLFFDKNDENVILQKTTNESMENSCPQVTEVTATEEH
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.:::::.::.:: .:: : : ::::.:.: ::::.. :: :.::::: :::::.: : :
gi|119 VDKMYLNILRKKITVNSSSLSQDDKINKTYRSQLSSEEEGAVMGKQVPYKKARSAPPLLK
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::::::::::.::::::::::::..::.::::::.: :.:..::: :::: ::.:::::
gi|119 RKPQSGLYASVRSSGYGKPSSPLKMFSTLEKKTSEDIIKSKNLRSISTSNQPRKKEILSG
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:::::::: .::. . :. .: :. :.:.. :: .:.:: .: : :.::.:::.::.
gi|119 TKLIKPAALDKPAHKTESCLSTRKKSENPTETDSCIQFQT--VGYCGENKEKKLLMFKRV
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:.::.:: :::::.::.: :: :::::::: .: ::.:::.:::.:::.:::::::::::
gi|119 QEAEDKWRGAQALIEQIKATFSEKEKELENKLEELKKQQEKELFKLNQDNYILQAKLSSF
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:::..:::::.:::..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|119 EETNKKQRWLHFGEAADPVTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVKDLQEQNK
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>>gi|149018961|gb|EDL77602.1| rCG25580, isoform CRA_a [R (1065 aa)
initn: 2616 init1: 2616 opt: 2616 Z-score: 2555.2 bits: 483.7 E(): 1.3e-133
Smith-Waterman score: 2616; 88.987% identity (95.595% similar) in 454 aa overlap (167-620:7-460)
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::::: ::::::::::::::: ::::::::
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::::::::: ..:::: :::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::.::
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:::.::.::. :::::::.:::: .::::.::::::. :::..:::::::::: ::.::
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mKIAA1 SCPATEEHLDKMYLEILKKKTSVNPSLLPQDDKMNQTSRSQLGAGEEVPVIGKQVPCKKA
:::::::::::::::::.:::::::::::::.: ::::::.:.: ::.:: .::::::::
gi|149 SCPATEEHLDKMYLEILRKKTSVNPSLLPQDNKANQTSRSRLSAREEAPVTSKQVPCKKA
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::.: ::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.:: :::::::
gi|149 RSAPPLPRRKPQSGLYASARSSGYSKPSSPLQFFSALEKKTSKDNTKTKNVRPIPTSNQF
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mKIAA1 RKREILSGTKLIKPAASNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTEPLGSYGGNREKE
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
gi|149 RKREILSGTKLIKPAALNKPSPHREGSPATPKRPEDPSDDSFVQLQTETLGSYGGNREKE
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mKIAA1 LLMLKRAQDAEEKWTGAQALMEQMKMTFCEKEKELENTVESLKRQQERELFRLNQENYIL
:::::::::::::: :::::.::.:::: ::::::::::::::::::::::.::::::::
gi|149 LLMLKRAQDAEEKWRGAQALIEQIKMTFSEKEKELENTVESLKRQQERELFKLNQENYIL
340 350 360 370 380 390
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mKIAA1 QAKLSSFEETSRKQRWLQFGETSDPLTGEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYNQVK
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.:::
gi|149 QAKLSSFEETSRKQRWLQFGETSDPLTEEKLKQIQKEIQEQETLLQGYQQENERLYSQVK
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620
mKIAA1 DLQE
::::
gi|149 DLQEQNKKNEERMFKENQNLFSELASLKEQMHKNHFLPQAVENIEPTKNQSFTDLLAELR
460 470 480 490 500 510
>>gi|73973878|ref|XP_532220.2| PREDICTED: similar to EEA (1405 aa)
initn: 1704 init1: 928 opt: 2589 Z-score: 2527.2 bits: 478.9 E(): 4.6e-132
Smith-Waterman score: 2589; 66.506% identity (84.615% similar) in 624 aa overlap (1-620:111-731)
10 20 30
mKIAA1 SEPHHSTLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEK
:: .::.::::::::::::::::::::::.
gi|739 EDSAERIQFLQSSGTSILSIDSLETNEIVVSELNHSVLGLGLDTLEEQEEKEQFFARLEE
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