FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0992.ptfa, 1081 aa vs ./tmplib.26680 library 1767936 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4240+/- 0.011; mu= -27.1794+/- 0.730 mean_var=719.4176+/-173.464, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0478 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4170 ( 1376 res) mbg21326 (1376) 1888 146 3e-35 >>mKIAA4170 ( 1376 res) mbg21326 (1376 aa) initn: 3054 init1: 1120 opt: 1888 Z-score: 725.2 bits: 146.3 E(): 3e-35 Smith-Waterman score: 3066; 46.886% identity (54.162% ungapped) in 1124 aa overlap (1-1081:361-1376) 10 20 30 mKIAA0 WFCEGKELYNSPDVQIHCESGELHTLVIAE :.:::::: ::::..: ..:.::.:.::: mKIAA4 TQKLRSREVPEGSRVQLDCIVVGIPPPQVRWYCEGKELENSPDIHI-VQAGNLHSLTIAE 340 350 360 370 380 40 50 60 70 80 mKIAA0 AFEDDTGRYTCLATNPSGSDSTSAEVFIEGASSTDSDSESLSFISKAGAMPQAQK--KTT :::.:::::.:.:.: :.::::::..:::.::.::... .: : . :: 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