FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0339.ptfa, 822 aa vs ./tmplib.26680 library 1768195 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.7882+/-0.0115; mu= -34.5637+/- 0.766 mean_var=673.3090+/-160.309, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0494 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1076 ( 855 res) mbh01320 ( 855) 1525 124 7.9e-29 mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744) 537 54 2.2e-07 mKIAA1506 ( 1520 res) mbg19167 (1520) 434 46 3.2e-05 mKIAA4065 ( 779 res) mpj03374 ( 779) 319 38 0.0057 mKIAA0388 ( 758 res) mbh00510 ( 758) 316 38 0.0064 >>mKIAA1076 ( 855 res) mbh01320 (855 aa) initn: 1518 init1: 919 opt: 1525 Z-score: 610.0 bits: 123.9 E(): 7.9e-29 Smith-Waterman score: 1654; 40.835% identity (47.439% ungapped) in 862 aa overlap (64-822:11-855) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 RPSTPAEEDEDDPEREKEAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFTLDSEGEEASQES : ::. ..... . . .:..: :. mKIAA1 SSPSSSSSSDKDDEDDNEADSDGQIDSDIDDQGAPLSE-- 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 SSEKDEDDDDEDEEDEEQEEAVDATKKEAEASDGEDEDSDSSSQCSLYADSDGENGSTSD .:::: . : .:::::. . . ..: : . : : . ... .:. . . .: mKIAA1 ASEKD--NGDSEEEDEEEMTVPGVEEEEEEEEEEEKETAMAAATVVAMAEESMPPVGGQD 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 mKIAA0 SESGSSSSSSSSSSSSSSSSSSESSSEEEEQSAVIPSASPP-REVPEPL--------PAP :. . . . : ..: . : .. : .: .: : :. : : mKIAA1 FEQDRAEVPLGPRGPMRESLGTEEEVDIEAEDEVPEMQAPELEEPPLPMGARKLEGSPEP 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 mKIAA0 DEK--PETDG-LVDSPVMPLSEKET--LPTQPA-GPAE------EPPP--SVP-QPPA-- :. :.:.: .. :: .: : : ::. : :: :::: :.: ::: mKIAA1 PEEPGPNTQGDMLLSPELPARETEEAQLPSPPEHGPESDLDMEPEPPPMLSLPLQPPLPP 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 mKIAA0 ----EPPAGPPDAAPRLDERPSSPIPLLPPPKK---RRKTVSFSAAEEA---PVPE-PST .::. ::. :. : :. :.:: :::. : . : :. :: :. mKIAA1 PRLLRPPSPPPE--PETPEPPKPPVPLEPPPEDHPPRTPGLCGSLAKSQSTETVPATPGG 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 mKIAA0 AAPLQAKSSG-----------PVSRKVPR--VVERTIRNLPLDHASLVKSWPEE------ ::.. ::: : : : . . : :.. ..:: mKIAA1 EPPLSGGSSGLSLSSPQVPGSPFSYPSPSPGLSSGGLPRTPGRDFSFTPTFPEPSGPLLL 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ----VARGGRNRAGGRVRSTEEEEATESGTEVDLAVLADLALT---PARRGLA------- . : :.. : . : :.: . : . : :. :. :. mKIAA1 PVCPLPTGRRDERTGPLASPV---LLETGLPLPLPLPLPLPLALPVPVLRAQPRPPPQLP 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 mKIAA0 -TLPTGDDSEATETSDEAERP--SPLLSHILLEHNYALAIKPPPTTPAPRPL--EPAPAL ::. : . . :: :: .: . : ..::: : : :. mKIAA1 PLLPATLAPCPTPIKRKPGRPRRSP---PSMLSLDGPL-VRPPPGPALGRDLLLLPGQPP 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 mKIAA0 AALFSSPADEVLEAPEVVVAEAEEPKQQLQQQHPEQ------EGEE---EEEDEEEESES : .: : : . . . : : : : :. . .: :.. ::. mKIAA1 APIFPSAHDPRAVTLDFRNTGIPAPPPPLPPQPPPPPPPPPVESTKLPFKELDNQWPSEA 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 mKIAA0 -SESSSSSSSDEE--------GAIRRRSLRSHTRRRRPPL-PPPPPPPPSFEPRSEFEQM . . :: : :: . : : : : :: : :.::::::.: mKIAA1 IPPGPRRDEVTEEYVDLAKVRGPWRRPPKKRHEDLVAPSASPEPSPPQPLFRPRSEFEEM 510 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 TILYDIWNSGLDLEDMSYLRLTYERLLQQTSGADWLNDTHWVQHTITNLSTPKRKRRPQD ::::::::.:.: ::. .: .:::::::: .: :::::: :: : :.::. :.:.: .: mKIAA1 TILYDIWNGGIDEEDIRFLCVTYERLLQQDNGMDWLNDTLWVYHPSTSLSSAKKKKR-ED 570 580 590 600 610 620 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 GPREHQTGSARSEGYYPISKKEKDKYLDVCPVSARQLEGGDTQG---------TNRVLSE : ::: :: :::::.: :.::.: .::. .:. . :::: ..:. :: mKIAA1 GIREHVTGCARSEGFYTIDKKDKLRYLNSSRASTDE-PPMDTQGMSIPAQPHASTRAGSE 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 RRSEQRRLLSAIGTSAIMDSDLLKLNQLKFRKKKLRFGRSRIHEWGLFAMEPIAADEMVI ::::::::::.. : ::::::.::::::::::.: .:.::.:::::::::::::::: mKIAA1 RRSEQRRLLSSFTGSC--DSDLLKFNQLKFRKKKLKFCKSHIHDWGLFAMEPIAADEMVI 690 700 710 720 730 740 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 EYVGQNIRQMVADMREKRYVQEGIGSSYLFRVDHDTIIDATKCGNLARFINHCCTPNCYA :::::::::..:::::::: .:::::::.::::::::::::::::.:::::: :.::::: mKIAA1 EYVGQNIRQVIADMREKRYEDEGIGSSYMFRVDHDTIIDATKCGNFARFINHSCNPNCYA 750 760 770 780 790 800 780 790 800 810 820 mKIAA0 KVITIESQKKIVIYSKQPIGVDEEITYDYKFPLEDNKIPCLCGTESCRGSLN ::::.:::::::::::: :.:.::::::::::.:: :::::::.:.:::.:: mKIAA1 KVITVESQKKIVIYSKQHINVNEEITYDYKFPIEDVKIPCLCGSENCRGTLN 810 820 830 840 850 >>mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744 aa) initn: 535 init1: 279 opt: 537 Z-score: 224.9 bits: 53.6 E(): 2.2e-07 Smith-Waterman score: 569; 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