FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1445.ptfa, 632 aa vs ./tmplib.26680 library 1768385 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7271+/-0.00521; mu= 11.4358+/- 0.346 mean_var=123.2012+/-28.599, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1155 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0550 ( 612 res) mbg18962 ( 612) 460 88 2.6e-18 mKIAA4089 ( 1251 res) mbg12616 (1251) 460 88 4.2e-18 mKIAA1679 ( 1608 res) meh02165 (1608) 300 62 5.3e-10 mKIAA2029 ( 1233 res) meh00056 (1233) 264 56 2.9e-08 mKIAA0688 ( 893 res) mbh00872 ( 893) 250 53 1.2e-07 mKIAA4060 ( 1035 res) mbg16808 (1035) 250 53 1.3e-07 mKIAA1346 ( 998 res) mfj09039 ( 998) 239 51 4.5e-07 mKIAA0762 ( 729 res) mbg11441 ( 729) 230 50 1e-06 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 191 43 0.0001 mKIAA0605 ( 402 res) mpf03178 ( 402) 174 40 0.00045 mKIAA0960 ( 1668 res) mbg08685 (1668) 179 42 0.00064 mKIAA1233 ( 747 res) mbp17192 ( 747) 171 40 0.00095 mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 165 39 0.0025 mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 ( 755) 160 38 0.0034 mKIAA1479 ( 1009 res) mbg01940 (1009) 161 38 0.0037 >>mKIAA0550 ( 612 res) mbg18962 (612 aa) initn: 412 init1: 241 opt: 460 Z-score: 421.0 bits: 88.0 E(): 2.6e-18 Smith-Waterman score: 520; 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