FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1813.ptfa, 675 aa vs ./tmplib.26680 library 1768342 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0059+/-0.0091; mu= -13.9790+/- 0.604 mean_var=504.3652+/-118.062, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0571 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0552 ( 560 res) mbp12120 ( 560) 975 95 2.8e-20 mKIAA0341 ( 539 res) mbp04120 ( 539) 318 40 0.00053 >>mKIAA0552 ( 560 res) mbp12120 (560 aa) initn: 814 init1: 494 opt: 975 Z-score: 456.5 bits: 94.6 E(): 2.8e-20 Smith-Waterman score: 1023; 39.539% identity (44.600% ungapped) in 564 aa overlap (100-643:7-526) 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 GYEAQEPLCPAVPPRKAVPGNSFTYVNEDFRTESPPSPSSDVEDPREHQAHNAHLRGPP- . :. : .. .:: : ::: mKIAA0 SGLIMAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPD 10 20 30 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 PKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPGFLGPRAAGLS-GSQGSLTQLF :.: . :. . :.::.:::::.:: . :. .. :.. : : :: . : mKIAA0 PRL--TMGSCSEP----LVRPSAFKPVVPK--NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-AGLK 40 50 60 70 80 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 GGPASSSSSSSSSSAADKPLALSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTT :: .: . . : . :: : :::::::::.::::::.. .. : . mKIAA0 GGLDKSRTMT--------PAGGSG-------GGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLS 90 100 110 120 130 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 NSPG--GHLPSHGPGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGA : . ... . : . :. : . : : ::::.::.....: :: .: :::: mKIAA0 ASTSHINRIGTAGYSSGSSGGGSGYQDLGTS--DSGRASSKSGSSSSMGR--SGHLGSGE 140 150 160 170 180 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 RASPGSSSGGDRSPPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSMDESEATVCQA ::. . : ::: ::.. :: .: ..: :. :: :...:::.: :. mKIAA0 --------GGNGGLPFAACSPPSPSALIQE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQV 190 200 210 220 230 370 380 390 400 410 mKIAA1 FGARQRRWPRERGE---DCAAQAQQATQRVQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQ . ::. : :: .: :... ::...:.::::: :::::..:::.:.:::.. :::.. mKIAA0 LEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAAQLIR 240 250 260 270 280 290 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 EREQLERRCATFEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVA .::.:: . :. ..:: .. ::.::::::::::.:::::::::::.:::.. :: ::.:. mKIAA0 QREELEDKVAVCQKEQADFLPRMEETKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVG 300 310 320 330 340 350 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 LRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARAREQELE--------ACSQELQRYRQEAERLRE :: :::.::.:: .: . .:... ... :: :: . . .: . mKIAA0 LRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFGSKQASLELSEGELPPACLKPALTPVDLVEPQEA 360 370 380 390 400 410 540 550 560 570 580 mKIAA1 KAGHLDAEASGLRDPPVPPATTDPFLLAESDEAKVQRAAAGAGGS--LRAQVERLRQELQ :. . ::. :. : :.. :.. . :.. :.: ::. :: .: ::. :: mKIAA0 LASCESDEAKMRRQAGVAAAAS---LVSVDGEVE----AGGEGGTRALRREVGRLQAELA 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 REQRRGDEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELE :.: ..: :: :: .: :::.::.:::::: .:..::.::.:::..:.. mKIAA0 AERRARERQGASFAEERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGG 480 490 500 510 520 530 650 660 670 mKIAA1 ARELADLGLAESAPCICLEEITATEI mKIAA0 SSTPTPQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI 540 550 560 >>mKIAA0341 ( 539 res) mbp04120 (539 aa) initn: 652 init1: 224 opt: 318 Z-score: 164.2 bits: 40.4 E(): 0.00053 Smith-Waterman score: 645; 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