# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph02162.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1813.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1813, 675 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7905934 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0287+/-0.000211; mu= 5.8224+/- 0.012 mean_var=172.6760+/-33.001, 0's: 35 Z-trim: 69 B-trim: 93 in 2/64 Lambda= 0.097602 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|46396490|sp|Q91YU6.1|LZTS2_MOUSE RecName: Full= ( 671) 4494 645.2 2.2e-182 gi|194473727|ref|NP_663478.2| leucine zipper, puta ( 671) 4493 645.0 2.4e-182 gi|60593173|gb|AAX28869.1| LZTS2 [Rattus norvegicu ( 670) 4339 623.3 8.2e-176 gi|46396501|sp|Q9BRK4.2|LZTS2_HUMAN RecName: Full= ( 669) 4105 590.4 6.8e-166 gi|37589139|gb|AAH58938.1| LZTS2 protein [Homo sap ( 669) 4101 589.8 1e-165 gi|109090297|ref|XP_001109715.1| PREDICTED: simila ( 669) 4079 586.7 8.6e-165 gi|73998655|ref|XP_543975.2| PREDICTED: similar to ( 680) 4075 586.2 1.3e-164 gi|149689750|ref|XP_001500106.1| PREDICTED: leucin ( 670) 4073 585.9 1.5e-164 gi|148745062|gb|AAI42534.1| LZTS2 protein [Bos tau ( 667) 4019 578.3 3e-162 gi|15193290|gb|AAK31577.1| LAPSER1 [Homo sapiens] ( 644) 3981 572.9 1.2e-160 gi|194389924|dbj|BAG60478.1| unnamed protein produ ( 631) 3411 492.6 1.7e-136 gi|109090307|ref|XP_001109524.1| PREDICTED: simila ( 603) 3252 470.2 9e-130 gi|109090305|ref|XP_001109574.1| PREDICTED: simila ( 624) 3247 469.5 1.5e-129 gi|21739970|emb|CAD39005.1| hypothetical protein [ ( 531) 3227 466.6 9.5e-129 gi|109090309|ref|XP_001109674.1| PREDICTED: simila ( 532) 3203 463.3 9.9e-128 gi|109090303|ref|XP_001109628.1| PREDICTED: simila ( 627) 2283 333.8 1.1e-88 gi|148709999|gb|EDL41945.1| leucine zipper, putati ( 450) 2084 305.6 2.4e-80 gi|53733412|gb|AAH83580.1| Leucine zipper, putativ ( 320) 2049 300.5 5.8e-79 gi|149040261|gb|EDL94299.1| leucine zipper, putati ( 449) 1970 289.6 1.6e-75 gi|9280082|dbj|BAB01595.1| unnamed protein product ( 316) 1850 272.5 1.6e-70 gi|38013974|gb|AAH05855.2| LZTS2 protein [Homo sap ( 307) 1821 268.4 2.6e-69 gi|56462553|emb|CAI10928.1| novel protein [Homo sa ( 240) 1527 226.9 6.3e-57 gi|56462552|emb|CAI10927.1| novel protein [Homo sa ( 221) 1408 210.1 6.6e-52 gi|47223296|emb|CAF98680.1| unnamed protein produc ( 608) 1306 196.2 2.8e-47 gi|47220631|emb|CAG06553.1| unnamed protein produc ( 710) 1271 191.4 9.5e-46 gi|56462551|emb|CAI10926.1| novel protein [Homo sa ( 199) 1255 188.5 1.9e-45 gi|220679001|emb|CAX14727.1| novel protein similar ( 741) 1050 160.3 2.3e-36 gi|49523154|gb|AAH75457.1| Leucine zipper, putativ ( 683) 1019 155.9 4.4e-35 gi|149023310|gb|EDL80204.1| ProSAPiP1 protein, iso ( 587) 982 150.6 1.5e-33 gi|189526824|ref|XP_699551.3| PREDICTED: similar t ( 709) 982 150.7 1.7e-33 gi|73990974|emb|CAC82182.2| ProSAPiP1 protein [Rat ( 703) 981 150.5 1.8e-33 gi|122889934|emb|CAM13272.1| ProSAPiP1 protein [Mu ( 586) 977 149.9 2.4e-33 gi|149023311|gb|EDL80205.1| ProSAPiP1 protein, iso ( 703) 977 150.0 2.7e-33 gi|34849690|gb|AAH58280.1| Prosapip1 protein [Mus ( 556) 975 149.6 2.8e-33 gi|122889935|emb|CAM13273.1| ProSAPiP1 protein [Mu ( 700) 968 148.7 6.5e-33 gi|109092706|ref|XP_001115087.1| PREDICTED: ProSAP ( 673) 967 148.5 7e-33 gi|114680653|ref|XP_525250.2| PREDICTED: ProSAPiP1 ( 673) 963 148.0 1e-32 gi|73991426|ref|XP_542921.2| PREDICTED: similar to ( 673) 960 147.5 1.4e-32 gi|54647570|gb|AAH84933.1| LOC495421 protein [Xeno ( 666) 957 147.1 1.8e-32 gi|149410765|ref|XP_001505720.1| PREDICTED: simila ( 616) 940 144.7 9.2e-32 gi|189526552|ref|XP_001344522.2| PREDICTED: wu:fj9 ( 608) 896 138.5 6.7e-30 gi|126332334|ref|XP_001377273.1| PREDICTED: simila ( 728) 892 138.0 1.1e-29 gi|73993816|ref|XP_859534.1| PREDICTED: similar to ( 586) 877 135.8 4.2e-29 gi|57105318|ref|XP_543262.1| PREDICTED: similar to ( 605) 871 135.0 7.6e-29 gi|126303455|ref|XP_001373322.1| PREDICTED: simila ( 608) 866 134.3 1.2e-28 gi|76624775|ref|XP_588491.2| PREDICTED: similar to ( 595) 861 133.5 2e-28 gi|194041415|ref|XP_001925540.1| PREDICTED: leucin ( 596) 861 133.5 2e-28 gi|46396069|sp|Q8CFC9.3|LZTS1_RAT RecName: Full=Le ( 601) 852 132.3 4.9e-28 gi|194208205|ref|XP_001914693.1| PREDICTED: leucin ( 600) 849 131.9 6.5e-28 gi|121934208|gb|AAI27607.1| Lzts1 protein [Mus mus ( 598) 843 131.0 1.2e-27 >>gi|46396490|sp|Q91YU6.1|LZTS2_MOUSE RecName: Full=Leuc (671 aa) initn: 4494 init1: 4494 opt: 4494 Z-score: 3430.7 bits: 645.2 E(): 2.2e-182 Smith-Waterman score: 4494; 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