FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1277.ptfa, 1074 aa vs ./tmplib.26680 library 1767943 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3272+/-0.00768; mu= -7.6865+/- 0.507 mean_var=326.4543+/-81.361, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0710 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1608 ( 845 res) mkg10115 ( 845) 363 51 6.4e-07 mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217) 282 43 0.00026 mKIAA3020 ( 1884 res) mbg15810 (1884) 283 44 0.00033 mKIAA1766 ( 618 res) mfj69272 ( 618) 266 41 0.00049 >>mKIAA1608 ( 845 res) mkg10115 (845 aa) initn: 270 init1: 270 opt: 363 Z-score: 216.6 bits: 51.5 E(): 6.4e-07 Smith-Waterman score: 365; 27.820% identity (30.833% ungapped) in 266 aa overlap (689-945:31-279) 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 LKLEKSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWAPVQEFTSE-----TFSFVLTGEDGSRRF ::: . :.. ..... :. . .. mKIAA1 GRPVGRGRAGSAVQRSTERGPRVHEEAPGPWAPGSSKTQRLHLKCMWKWLILGQVALFQI 10 20 30 40 50 60 720 730 740 750 760 mKIAA1 GYCRRLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSKIL----DEVEKRRGISPALVQPLMRSV :: :...: ..: : : .: :.: : . ::. . . :.... mKIAA1 LRCR-----GNSQRTT----VTSYLPWFEVFYKLLNILADYTTKRQ---ESQWNELLETL 70 80 90 100 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 MEAPFPALGKTIIVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVSVFASL . :.: : .. : . .. : : : :. .. : ...: ... ..::. mKIAA1 HRLPIPDPGVSV----HLSVHSYFTVPDSRELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASM 110 120 130 140 150 160 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 LLERRVIFIADKLSTLSKCCHAMVALIYPFSWQHTYIPVLPPAMIDIVCSPTPFLIGLLS : :::...: .:::::. : :. .:..::. :::.::::::: ..: :.: :.:::. mKIAA1 LYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHL 170 180 190 200 210 220 890 900 910 920 930 940 mKIAA1 SSLPLLRELPLEEVLVVDLINDRFLRQMEDEDSILPRKLQVALEHILEQRNDLACDQDGG : . .:.. :..:..... .. . ..: .: :: . .:.. :.. . . : mKIAA1 SLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQS-LPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVAR 230 240 250 260 270 280 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 PLDCVHGPESSSLSEVVSEAFVRFFVEIVGHYPLFLTSGEERSLQREAFRKAVSSKSLRR mKIAA1 AFLKAQAAFFGSYRNALKIEPERDPGPQTSRRPEPITVHFGQVRPPRPHVVRRPKSNITV 290 300 310 320 330 340 >>mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217 aa) initn: 277 init1: 206 opt: 282 Z-score: 169.7 bits: 43.3 E(): 0.00026 Smith-Waterman score: 282; 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