# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph01928.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0156.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0156, 968 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7912318 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7798+/-0.000197; mu= 11.8742+/- 0.011 mean_var=112.9220+/-21.739, 0's: 34 Z-trim: 63 B-trim: 341 in 1/64 Lambda= 0.120694 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81917559|sp|Q9JLI8.1|SART3_MOUSE RecName: Full= ( 962) 6234 1097.2 0 gi|26352049|dbj|BAC39661.1| unnamed protein produc ( 962) 6228 1096.1 0 gi|149063643|gb|EDM13966.1| squamous cell carcinom ( 960) 5809 1023.2 0 gi|73994829|ref|XP_864466.1| PREDICTED: similar to ( 959) 5521 973.0 0 gi|109098607|ref|XP_001102668.1| PREDICTED: simila ( 963) 5514 971.8 0 gi|73994825|ref|XP_864427.1| PREDICTED: similar to ( 964) 5500 969.4 0 gi|158261441|dbj|BAF82898.1| unnamed protein produ ( 963) 5495 968.5 0 gi|114646770|ref|XP_001163755.1| PREDICTED: squamo ( 963) 5486 966.9 0 gi|194214206|ref|XP_001916628.1| PREDICTED: simila ( 962) 5472 964.5 0 gi|154425531|gb|AAI51266.1| SART3 protein [Bos tau ( 957) 5309 936.1 0 gi|109098613|ref|XP_001102488.1| PREDICTED: simila ( 905) 5209 918.7 0 gi|114646774|ref|XP_001163716.1| PREDICTED: squamo ( 905) 5187 914.8 0 gi|224071650|ref|XP_002193793.1| PREDICTED: simila ( 993) 4371 772.8 0 gi|109098611|ref|XP_001102582.1| PREDICTED: simila ( 981) 4173 738.3 4.2e-210 gi|114646768|ref|XP_522523.2| PREDICTED: hypotheti ( 981) 4163 736.6 1.4e-209 gi|75070943|sp|Q5REG1.1|SART3_PONAB RecName: Full= ( 981) 4145 733.4 1.2e-208 gi|73994827|ref|XP_543445.2| PREDICTED: similar to ( 982) 4137 732.0 3.2e-208 gi|26343775|dbj|BAC35544.1| unnamed protein produc ( 612) 4046 716.0 1.4e-203 gi|62020925|gb|AAH32601.1| SART3 protein [Homo sap ( 615) 3686 653.3 1e-184 gi|194043125|ref|XP_001926720.1| PREDICTED: simila ( 828) 3668 650.3 1.1e-183 gi|194388388|dbj|BAG65578.1| unnamed protein produ ( 699) 3492 619.6 1.6e-174 gi|119618222|gb|EAW97816.1| squamous cell carcinom ( 575) 3228 573.5 9.9e-161 gi|194387736|dbj|BAG61281.1| unnamed protein produ ( 639) 3052 542.9 1.8e-151 gi|190338766|gb|AAI63594.1| Squamous cell carcinom ( 951) 2984 531.3 8.6e-148 gi|37606131|emb|CAE50170.1| novel protein similar ( 951) 2980 530.6 1.4e-147 gi|166797005|gb|AAI59117.1| Sart3 protein [Danio r ( 952) 2975 529.7 2.6e-147 gi|114646772|ref|XP_001163651.1| PREDICTED: squamo ( 927) 2370 424.3 1.3e-115 gi|219520657|gb|AAI43254.1| Unknown (protein for M ( 927) 2370 424.3 1.3e-115 gi|148687991|gb|EDL19938.1| squamous cell carcinom ( 404) 2355 421.4 4.4e-115 gi|23273663|gb|AAH36350.1| Sart3 protein [Mus musc ( 406) 2343 419.3 1.9e-114 gi|118098576|ref|XP_415181.2| PREDICTED: similar t (1017) 2238 401.4 1.1e-108 gi|163915611|gb|AAI57502.1| LOC100137683 protein [ ( 590) 2070 371.9 5e-100 gi|210098364|gb|EEA46475.1| hypothetical protein B ( 925) 2023 363.9 2e-97 gi|145337883|gb|AAI39590.1| Sart3 protein [Danio r ( 623) 1985 357.1 1.5e-95 gi|133777384|gb|AAI15051.1| Sart3 protein [Danio r ( 587) 1886 339.9 2.2e-90 gi|194379396|dbj|BAG63664.1| unnamed protein produ ( 527) 1522 276.4 2.5e-71 gi|156216405|gb|EDO37342.1| predicted protein [Nem ( 817) 1495 271.9 8.7e-70 gi|115620271|ref|XP_781643.2| PREDICTED: hypotheti ( 890) 1242 227.9 1.7e-56 gi|193606175|ref|XP_001946245.1| PREDICTED: simila ( 843) 1200 220.6 2.6e-54 gi|156555684|ref|XP_001602582.1| PREDICTED: hypoth ( 935) 1091 201.6 1.4e-48 gi|47226485|emb|CAG08501.1| unnamed protein produc ( 909) 1027 190.5 3.2e-45 gi|190579124|gb|EDV19227.1| hypothetical protein T ( 930) 933 174.1 2.7e-40 gi|158603609|gb|EDP39472.1| conserved hypothetical ( 842) 843 158.4 1.3e-35 gi|90077424|dbj|BAE88392.1| unnamed protein produc ( 272) 828 155.3 3.7e-35 gi|89267910|emb|CAJ82400.1| Novel protein similar ( 191) 785 147.7 5.2e-33 gi|212505369|gb|EEB09841.1| squamous cell carcinom ( 858) 789 149.0 9.1e-33 gi|5051769|emb|CAB45062.1| putative protein [Arabi ( 768) 712 135.6 9.2e-29 gi|110748963|ref|XP_394225.3| PREDICTED: similar t ( 802) 699 133.3 4.5e-28 gi|3873696|emb|CAA97405.1| C. elegans protein B003 ( 836) 693 132.3 9.6e-28 gi|210083173|gb|EEA31800.1| hypothetical protein B ( 892) 690 131.8 1.4e-27 >>gi|81917559|sp|Q9JLI8.1|SART3_MOUSE RecName: Full=Squa (962 aa) initn: 6251 init1: 5235 opt: 6234 Z-score: 5867.9 bits: 1097.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 6234; 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