FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00163.ptfa, 798 aa vs ./tmplib.26680 library 1768219 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6999+/-0.00753; mu= -6.4893+/- 0.497 mean_var=348.7789+/-85.139, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0687 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1114 ( 1736 res) mbg06405 (1736) 1312 145 8.3e-35 mFLJ00211 ( 305 res) mbg20018 ( 305) 684 82 1.4e-16 mKIAA1587 ( 934 res) mfj49064 ( 934) 622 76 2.1e-14 mKIAA1802 ( 804 res) mpj02246 ( 804) 258 40 0.0014 >>mKIAA1114 ( 1736 res) mbg06405 (1736 aa) initn: 1354 init1: 1303 opt: 1312 Z-score: 717.3 bits: 144.7 E(): 8.3e-35 Smith-Waterman score: 1312; 59.639% identity (60.923% ungapped) in 332 aa overlap (464-794:230-555) 440 450 460 470 480 490 mFLJ00 PDWSFPSDWPFPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRSSSN-SRASQNQGPPQPRDVALLQ :. . :...: : .. : :::::.:: mKIAA1 VQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHPNGEERTGNNYRRIPWGRRLPPPRDVAILQ 200 210 220 230 240 250 500 510 520 530 540 550 mFLJ00 ERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEID ::::::::::..:: ::.:::::.::.:.:.:: : .::::::: ..::: : ..::::: mKIAA1 ERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLKDVIQEYEDYFPEIIERASYALEKMFRVNLKEID 260 270 280 290 300 310 560 570 580 590 600 610 mFLJ00 KEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGIIFMNGNRATEAVLWEALRKMGLR :...::::::: :: :::.::::::::::::.:::..::::::.:.:::.::.:::.::. mKIAA1 KQNNLYILISTQESSAGIMGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLH 320 330 340 350 360 370 620 630 640 650 660 670 mFLJ00 PGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIA :::.: :.:...::.: ::::::::.:.::::: ::::::.:::::::::::::::.: mKIAA1 PGVKHSLFGEVKKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFAC 380 390 400 410 420 430 680 690 700 710 720 730 mFLJ00 EVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARNRMGIGDEAVSGPWSWDDIEF .:::.::.::.::. ::.. ..: .:.:::.:::::: .::::.:::.:::.:::... mKIAA1 KVQKKDPKDWAAQYREAVEMDIQAAAVAVAEAKARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDI 440 450 460 470 480 490 740 750 760 770 780 790 mFLJ00 ELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQNARSRFPQAFTGPIIGPSGTATANFAANFGAI . :: .: :: .. :::. : . : ..:: : : .. .:..: : .. ..: mKIAA1 NCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEPRAQENAD---P---TTNVLFNQGATTRNSFSDGAGI 500 510 520 530 540 550 mFLJ00 GFFWVE .: mKIAA1 SFGGITNPSGGFGGISNPSGGFGGISNPSGGFGGISNPSGGFGGISNPSGGFGGISNPSG 560 570 580 590 600 610 >>mFLJ00211 ( 305 res) mbg20018 (305 aa) initn: 711 init1: 449 opt: 684 Z-score: 390.0 bits: 81.6 E(): 1.4e-16 Smith-Waterman score: 684; 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