FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1171.ptfa, 586 aa vs ./tmplib.26680 library 1768431 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3355+/-0.00392; mu= 17.4885+/- 0.262 mean_var=77.3200+/-17.875, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 152 in 1/35 Lambda= 0.1459 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 ( 979) 207 54 9.4e-08 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 185 48 1.2e-06 mKIAA0882 ( 1229 res) mfj03243 (1229) 175 47 1.2e-05 mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 172 46 1.5e-05 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 166 45 3.9e-05 mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 ( 738) 164 44 4.2e-05 mKIAA1322 ( 645 res) mbh00387 ( 645) 162 44 5.1e-05 mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 146 41 0.00081 mKIAA0676 ( 1268 res) mfj02220 (1268) 144 40 0.0011 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 130 37 0.0064 mKIAA1609 ( 274 res) mib38091 ( 274) 125 36 0.0066 >>mKIAA1055 ( 979 res) mpf00228 (979 aa) initn: 192 init1: 74 opt: 207 Z-score: 231.6 bits: 53.6 E(): 9.4e-08 Smith-Waterman score: 208; 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