FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00316.ptfa, 641 aa vs ./tmplib.26680 library 1768376 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4122+/-0.00724; mu= 8.9514+/- 0.480 mean_var=289.0091+/-67.646, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0754 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4245 ( 606 res) mfj00189 ( 606) 2267 261 2.8e-70 mKIAA4246 ( 602 res) msj08227 ( 602) 1988 230 3.9e-61 >>mKIAA4245 ( 606 res) mfj00189 (606 aa) initn: 2263 init1: 1692 opt: 2267 Z-score: 1354.1 bits: 260.7 E(): 2.8e-70 Smith-Waterman score: 2267; 65.000% identity (65.242% ungapped) in 540 aa overlap (61-600:39-576) 40 50 60 70 80 90 mFLJ00 INILERITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNRLAGQNHGFNLGTTVRSETKGIWMWCVPHPS ..: . : ::.::.:.::::::::.:::. mKIAA4 HRDSGQDFSASGSSGYCWMVPYREVLFDELFGGTESRFPLGSTVQSQTKGIWMWCMPHPT 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 mFLJ00 KPKFTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTE ::. ::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::.::::::::::::::: mKIAA4 KPEHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDLWIFALSVLLSSTFVYNSMNTINHQALEQLHYVTE 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 mFLJ00 LTERIRAKSTSRSEEVDDSDEFVSFFPDFIWTVRDFVLELKLEGRVITADEYLENALKLI ::: :::::. . . .: :::::::::.::::::.:::::.:. ::.::::::::::: mKIAA4 LTELIRAKSSPNPHGIKNSTEFVSFFPDFVWTVRDFMLELKLNGEDITSDEYLENALKLI 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 mFLJ00 PGMSIKAQKANLPRECIRHFFPRRKCFVFDRPTKDKELLVHVEEMPEDQLDHSFQVQSKE :: . . : .: :::::.::: ::::::. ::.: ::. ..: . ::::: .:. .. mKIAA4 PGNNPRIQASNSARECIRRFFPNRKCFVFEWPTHDIELIKQLETISEDQLDPTFKESAMA 190 200 210 220 230 240 280 290 300 310 320 330 mFLJ00 FCSYIFSNSKAKTLKEGIVVNGNRLATLVTTYVDAINSGDVPCLENAVTTLAQRENSIAV : ::::. .: :::.::: :.:: :.::::::::::::: ::::..:::::::::::.:: mKIAA4 FASYIFTYAKIKTLREGIKVTGNGLGTLVTTYVDAINSGAVPCLDDAVTTLAQRENSVAV 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 390 mFLJ00 QKAADHYSEQMAQRMRLPTDTLQELLTVHTACEKEAIAVFMEHSFKDENQQFQKNLVVTI ::::.:::::::::. :::::.:::: ::.::::::.::::::::::::::: :.:: . mKIAA4 QKAASHYSEQMAQRLSLPTDTIQELLDVHAACEKEAMAVFMEHSFKDENQQFLKKLVELL 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 mFLJ00 EEKKEDFLRQNEAASLSHCQAELDKLSESLRESISRGVFSVPGGHRLYLEARKKVEQDYE .::. :: .:: :: ..:: :::.::..: ..:: .::::::::::.. :.:.:.:: mKIAA4 REKNGLFLLKNEEASDKYCQEELDRLSKDLMDNIS--TFSVPGGHRLYMDMREKIEHDYW 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 mFLJ00 RVPRKGVKANHVLQSFLQSQISIEDSIMQSDKALTDGQKAMEAERAQKEAAEKEQELLRQ .::::::::..:.:.::::: ::.::.:.: ::: ::::. ....::::::::.:::: mKIAA4 QVPRKGVKASEVFQNFLQSQAIIESSILQADTALTAGQKAIAEKHTKKEAAEKEQDLLRQ 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 mFLJ00 KQKELQQVMEAQERSYKENVAQLHEKMETERKNILREQEVKLEHKLKIQKDMLNEGFKRK :::: :. :::::. :::. ::..:.: ::......... ::. : :: . .::.: . mKIAA4 KQKEHQEYMEAQEKRNKENLEQLRRKLEQEREQLIKDHNMMLEKLTKEQKTFREEGYKTQ 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 mFLJ00 CEAMDLEISQLQKEIQLNKEKNSSLGAKILDGFGDVLISVVPGSGKYFGLGLKILSSQMN : . :: :: ..:. :....:: .:: mKIAA4 AEELRREIHQLGHNIKEMKQNGDSLVESILRSWFSFISPPSESEKAISSVLSLLRKKDRL 550 560 570 580 590 600 >>mKIAA4246 ( 602 res) msj08227 (602 aa) initn: 2020 init1: 1084 opt: 1988 Z-score: 1190.0 bits: 230.3 E(): 3.9e-61 Smith-Waterman score: 1988; 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