# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph01644.fasta.nr -Q ../query/mFLJ00316.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mFLJ00316, 641 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7913551 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8767+/-0.000195; mu= 8.9555+/- 0.011 mean_var=107.3452+/-20.374, 0's: 32 Z-trim: 58 B-trim: 94 in 1/66 Lambda= 0.123789 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|47847508|dbj|BAD21426.1| mFLJ00316 protein [Mus ( 641) 4126 748.0 2.3e-213 gi|26352718|dbj|BAC39989.1| unnamed protein produc ( 638) 4111 745.3 1.4e-212 gi|26331592|dbj|BAC29526.1| unnamed protein produc ( 632) 4069 737.8 2.6e-210 gi|149026107|gb|EDL82350.1| rCG28487 [Rattus norve ( 627) 3591 652.4 1.3e-184 gi|17512480|gb|AAH19195.1| Guanylate binding prote ( 620) 3034 552.9 1.1e-154 gi|81862925|sp|Q61107.1|GBP4_MOUSE RecName: Full=G ( 620) 3015 549.5 1.2e-153 gi|109465647|ref|XP_227762.4| PREDICTED: similar t ( 644) 3010 548.7 2.3e-153 gi|149026108|gb|EDL82351.1| rCG28728, isoform CRA_ ( 684) 3010 548.7 2.4e-153 gi|148680106|gb|EDL12053.1| mCG21119, isoform CRA_ ( 620) 3009 548.5 2.5e-153 gi|149026109|gb|EDL82352.1| rCG28728, isoform CRA_ ( 620) 3008 548.3 2.8e-153 gi|194211128|ref|XP_001494306.2| PREDICTED: guanyl ( 629) 2921 532.8 1.3e-148 gi|15558943|gb|AAL02054.1|AF288814_1 guanylate bin ( 640) 2889 527.0 7.2e-147 gi|34526533|dbj|BAC85144.1| FLJ00316 protein [Homo ( 649) 2889 527.1 7.2e-147 gi|109009945|ref|XP_001086706.1| PREDICTED: simila ( 633) 2886 526.5 1e-146 gi|114557621|ref|XP_001149060.1| PREDICTED: guanyl ( 640) 2883 526.0 1.5e-146 gi|109009936|ref|XP_001086345.1| PREDICTED: simila ( 627) 2881 525.6 1.9e-146 gi|116242487|sp|Q96PP9.2|GBP4_HUMAN RecName: Full= ( 640) 2871 523.8 6.7e-146 gi|189065488|dbj|BAG35327.1| unnamed protein produ ( 640) 2862 522.2 2e-145 gi|47123304|gb|AAH70055.1| Guanylate binding prote ( 640) 2862 522.2 2e-145 gi|74729533|sp|Q8N8V2.1|GBP7_HUMAN RecName: Full=G ( 638) 2859 521.7 2.9e-145 gi|162317974|gb|AAI56124.1| Guanylate binding prot ( 638) 2855 521.0 4.8e-145 gi|74749570|sp|Q6ZN66.1|GBP6_HUMAN RecName: Full=G ( 633) 2848 519.7 1.1e-144 gi|119593551|gb|EAW73145.1| guanylate binding prot ( 627) 2847 519.5 1.3e-144 gi|75041787|sp|Q5R9T9.1|GBP6_PONAB RecName: Full=G ( 633) 2842 518.6 2.4e-144 gi|114557629|ref|XP_001149821.1| PREDICTED: guanyl ( 633) 2839 518.1 3.5e-144 gi|124297113|gb|AAI31714.1| Guanylate binding prot ( 633) 2839 518.1 3.5e-144 gi|119593545|gb|EAW73139.1| guanylate binding prot ( 633) 2838 517.9 3.9e-144 gi|31873994|emb|CAD97917.1| hypothetical protein [ ( 633) 2827 516.0 1.5e-143 gi|164691085|dbj|BAF98725.1| unnamed protein produ ( 633) 2826 515.8 1.7e-143 gi|73960069|ref|XP_547290.2| PREDICTED: similar to ( 627) 2814 513.6 7.6e-143 gi|76669288|ref|XP_591383.2| PREDICTED: similar to ( 628) 2811 513.1 1.1e-142 gi|158261629|dbj|BAF82992.1| unnamed protein produ ( 633) 2808 512.6 1.6e-142 gi|194665492|ref|XP_001789805.1| PREDICTED: simila ( 624) 2773 506.3 1.2e-140 gi|194665494|ref|XP_001789823.1| PREDICTED: simila ( 624) 2767 505.2 2.5e-140 gi|194665496|ref|XP_001789822.1| PREDICTED: simila ( 624) 2766 505.1 2.9e-140 gi|119889874|ref|XP_617067.3| PREDICTED: similar t ( 627) 2734 499.4 1.5e-138 gi|119593550|gb|EAW73144.1| guanylate binding prot ( 571) 2646 483.6 7.6e-134 gi|170650637|ref|NP_919317.2| macrophage activatio ( 611) 2643 483.1 1.2e-133 gi|151555866|gb|AAI49508.1| GBP4 protein [Bos taur ( 607) 2639 482.4 1.9e-133 gi|148688258|gb|EDL20205.1| mCG20328, isoform CRA_ ( 607) 2638 482.2 2.2e-133 gi|194685658|ref|XP_001788656.1| PREDICTED: simila ( 607) 2635 481.7 3.1e-133 gi|34536662|dbj|BAC87667.1| unnamed protein produc ( 611) 2628 480.4 7.5e-133 gi|116008272|gb|ABJ51942.1| guanylate-binding prot ( 611) 2623 479.5 1.4e-132 gi|34786063|gb|AAH57969.1| Macrophage activation 2 ( 611) 2623 479.5 1.4e-132 gi|109500283|ref|XP_001064585.1| PREDICTED: simila ( 582) 2614 477.9 4.1e-132 gi|89130358|gb|AAI14210.1| Macrophage activation 2 ( 611) 2612 477.6 5.4e-132 gi|109499442|ref|XP_223172.4| PREDICTED: similar t ( 572) 2609 477.0 7.5e-132 gi|85662606|gb|AAI12329.1| Macrophage activation 2 ( 611) 2609 477.0 7.8e-132 gi|34784364|gb|AAH57170.1| CDNA sequence BC057170 ( 619) 2607 476.7 1e-131 gi|26353978|dbj|BAC40619.1| unnamed protein produc ( 619) 2602 475.8 1.9e-131 >>gi|47847508|dbj|BAD21426.1| mFLJ00316 protein [Mus mus (641 aa) initn: 4126 init1: 4126 opt: 4126 Z-score: 3987.0 bits: 748.0 E(): 2.3e-213 Smith-Waterman score: 4126; 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