FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1869.ptfa, 774 aa vs ./tmplib.26680 library 1768243 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1456+/-0.00804; mu= -7.6986+/- 0.531 mean_var=370.6431+/-89.518, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0666 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1479 ( 1009 res) mbg01940 (1009) 1677 176 2.4e-44 mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 ( 794) 676 79 1.8e-15 mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 ( 755) 601 72 2.6e-13 mKIAA0331 ( 574 res) mph02015 ( 574) 584 70 6.8e-13 mKIAA4225 ( 868 res) mfj58259 ( 868) 502 63 2.1e-10 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 373 50 1.1e-06 mKIAA4231 ( 1467 res) mfj06028 (1467) 246 38 0.0077 >>mKIAA1479 ( 1009 res) mbg01940 (1009 aa) initn: 1690 init1: 1199 opt: 1677 Z-score: 888.6 bits: 175.6 E(): 2.4e-44 Smith-Waterman score: 1839; 40.930% identity (47.891% ungapped) in 860 aa overlap (1-766:165-993) 10 20 30 mKIAA1 QQEGEELSGQARCPFDATQSTVAIFAEGSL . .:::.:: ::::::: :..::.::.:.: mKIAA1 VFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLRTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKL 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 YSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVYALEHGEHVYFFFREVSVE ::::.::: :::::.:::.: ::. ::::::..::::..:.:.:..:::::::..:: mKIAA1 YSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREIAVE 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 DARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQSLTGP ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: :::::::::: ::::::::.: mKIAA1 HNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSITDI 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 VNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDDIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDKVP ....: .. :::::: ::::::::::: .::::. :.:.::::.. :..:: : ::::: mKIAA1 IQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVP 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 mKIAA1 SPRPGSCAGVGAAASFSSSQDLPDDVLLFIKAHPLLDPAVPPATHQPLLTLTS-RALLTQ .:::: :: : : ....: :.:::.: :::.:::.: :::: . .: .: : : :: mKIAA1 KPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDDTLAFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTA 380 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 VAVDGMAGPHRNTTVLFLGSNDGTVLKVLPPGGQSLGSEPIVLEEIDAYSHARCSGKRSP . :: :::..: ::.:.::. :.::::: . .. ..::::.::. :.::.. mKIAA1 IEVDRSAGPYQNYTVIFVGSEAGVVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNPAKCSAES-- 440 450 460 470 480 490 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 RAARRIIGLELDTEGHRLFVAFPGCIVYLSLSRCARHGACQRSCLASLDPYCGWHRSRGC . :....:.:: . : :.::: .:.: . :::: :.:.:..::.:: :::::: . : mKIAA1 EEDRKVVSLQLDKDHHALYVAFSSCVVRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGVC 500 510 520 530 540 550 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 MSIR-G--PGGTDVDLT-GNQESTEH-GDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLSPASASRS . : ::: . : :: : : ::: .::: ... . ... mKIAA1 ERVTLGMLPGGYEQDTEYGN---TAHLGDC---------------HGVRWEVQSGESNQM 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 IPIPLLLACVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRANRRRSKDIETPGLPRPLSLRSLARL . . .:..:: :::.::: ..:. : : : ::. :: :. : :.:.: mKIAA1 VHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSS-GSFAKL 600 610 620 630 640 650 510 520 530 540 mKIAA1 HGGGPEPPPPPKDGDAAQTPQLYTTFLP-----PPDG----------GSPPELACLPTPE .: : ... ..:.::...: ::. :.::::: ::::: mKIAA1 NGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNTDTKSMAVDHRGQPPELAALPTPE 660 670 680 690 700 710 550 560 570 580 590 mKIAA1 TTPELPVKHLRASGGPWEW-NQNGNNASEG----PGRPPRGCSGAGGPAPRVLVRP---- .:: : : :.: . : ...: . .: :. :: . : : ..: : mKIAA1 STPVLHQKTLQAMKSHSEKAHSHGASRKEHPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATH 720 730 740 750 760 770 600 610 620 mKIAA1 -----------------------PPPGCPGQ-----AVEV-TTLEELLRYLHGPQP-PRK : .. .:. .::..::..:. :. :. mKIAA1 DYNTSFSNSNAHKAEKKLQSMDHPLTKSSSKREHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKA 780 790 800 810 820 830 630 640 650 660 670 mKIAA1 --GSEPLAS--------APFTSRPP-ASEPGASLFVDSSPMPRDGVPPLRLDVP-----P : .: .:.. :: . . :::. : .::.. : :.::: : mKIAA1 ILGEIHMAHQTLMLDPVGPMAEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNS-PTKRVDVPTTPGVP 840 850 860 870 880 890 680 690 700 710 720 mKIAA1 -------EGKRAAPSGRPALSAPAPRL----GVGGSRRLPFPTHRAPPGLLTRVPSGGPA .: . : : ..:: : :: ::. :. : .:.:. . mKIAA1 MTSLERQRGYHKNSSQRHSISAVPKNLNSPNGVLLSRQ---PSMNR--GGYMPTPTGAKV 900 910 920 930 940 730 740 750 760 770 mKIAA1 RY-SGGP-GRHLL-YLGRPEGHRGR-SLKRVDVKSPLSPKPPLASPPQPAPHGGHFNF : .: : . :: :.: .. . .: :. .: : :: . ::.:. mKIAA1 DYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDV--PPKPSFVPQTTSVRP 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 LNKYTY >>mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 (794 aa) initn: 664 init1: 166 opt: 676 Z-score: 369.9 bits: 79.3 E(): 1.8e-15 Smith-Waterman score: 835; 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