# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph01602.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1822.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1822, 636 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7908735 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8493+/-0.000202; mu= 10.6496+/- 0.011 mean_var=125.5663+/-24.205, 0's: 34 Z-trim: 61 B-trim: 592 in 1/66 Lambda= 0.114456 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|74195055|dbj|BAE28276.1| unnamed protein produc ( 727) 4466 749.0 1.3e-213 gi|109730179|gb|AAI13774.1| Hedgehog interacting p ( 791) 4466 749.0 1.3e-213 gi|123792821|sp|Q14DK5.1|HIPL1_MOUSE RecName: Full ( 791) 4466 749.0 1.3e-213 gi|148686770|gb|EDL18717.1| mCG18356 [Mus musculus ( 791) 4456 747.4 4.2e-213 gi|166218135|sp|Q96JK4.2|HIPL1_HUMAN RecName: Full ( 782) 3794 638.0 3.3e-180 gi|118092160|ref|XP_421358.2| PREDICTED: similar t ( 788) 3306 557.5 6.1e-156 gi|134026300|gb|AAI34905.1| LOC100002738 protein [ ( 820) 3135 529.3 2e-147 gi|189530759|ref|XP_001337342.2| PREDICTED: simila ( 850) 3135 529.3 2e-147 gi|224051709|ref|XP_002200273.1| PREDICTED: simila ( 787) 3116 526.1 1.7e-146 gi|194038099|ref|XP_001925214.1| PREDICTED: simila ( 670) 3023 510.7 6.4e-142 gi|74216132|dbj|BAE23730.1| unnamed protein produc ( 600) 2995 506.0 1.5e-140 gi|126290507|ref|XP_001374683.1| PREDICTED: simila ( 782) 2742 464.3 6.6e-128 gi|124375938|gb|AAI32878.1| HHIP-like 1 [Homo sapi ( 608) 2663 451.2 4.7e-124 gi|37181454|gb|AAQ88540.1| ARAR9245 [Homo sapiens] ( 608) 2661 450.8 5.9e-124 gi|223648196|gb|ACN10856.1| HHIP-like protein 1 pr ( 822) 2578 437.3 9.6e-120 gi|94733564|emb|CAK04105.1| novel protein [Danio r ( 788) 2503 424.9 5e-116 gi|125844135|ref|XP_687401.2| PREDICTED: si:ch211- ( 838) 2503 424.9 5.2e-116 gi|126307114|ref|XP_001376005.1| PREDICTED: simila ( 732) 2351 399.7 1.7e-108 gi|194227342|ref|XP_001489641.2| PREDICTED: HHIP-l ( 787) 2345 398.8 3.6e-108 gi|149641585|ref|XP_001512074.1| PREDICTED: simila ( 768) 2321 394.8 5.5e-107 gi|125842833|ref|XP_688873.2| PREDICTED: similar t ( 814) 2316 394.0 1e-106 gi|74006205|ref|XP_536153.2| PREDICTED: hypothetic ( 696) 2312 393.3 1.4e-106 gi|76669880|ref|XP_613279.2| PREDICTED: similar to ( 766) 2311 393.2 1.7e-106 gi|109498329|ref|XP_229754.4| PREDICTED: hypotheti ( 712) 2308 392.6 2.3e-106 gi|1234787|gb|AAC59865.1| up-regulated by thyroid ( 995) 2306 392.5 3.6e-106 gi|166218133|sp|Q9D2G9.2|HIPL2_MOUSE RecName: Full ( 717) 2300 391.3 5.8e-106 gi|50740230|ref|XP_419401.1| PREDICTED: similar to ( 765) 2292 390.0 1.5e-105 gi|114572791|ref|XP_525070.2| PREDICTED: hypotheti ( 724) 2284 388.7 3.6e-105 gi|49113217|gb|AAH07638.1| HHIP-like 2 [Homo sapie ( 724) 2266 385.7 2.9e-104 gi|10435980|dbj|BAB14717.1| unnamed protein produc ( 529) 2185 372.2 2.5e-100 gi|149040937|gb|EDL94894.1| similar to RIKEN cDNA ( 492) 2075 354.0 6.9e-95 gi|12859987|dbj|BAB31831.1| unnamed protein produc ( 497) 2068 352.8 1.5e-94 gi|47212352|emb|CAF93906.1| unnamed protein produc ( 895) 2063 352.3 4e-94 gi|210094800|gb|EEA42975.1| hypothetical protein B ( 586) 1788 306.7 1.4e-80 gi|210094809|gb|EEA42984.1| hypothetical protein B ( 552) 1786 306.3 1.7e-80 gi|210094801|gb|EEA42976.1| hypothetical protein B ( 564) 1727 296.6 1.5e-77 gi|210094810|gb|EEA42985.1| hypothetical protein B ( 566) 1723 295.9 2.4e-77 gi|115735484|ref|XP_794447.2| PREDICTED: similar t (1074) 1665 286.6 2.8e-74 gi|15929541|gb|AAH15201.1| HHIPL2 protein [Homo sa ( 256) 1286 223.4 7.3e-56 gi|194038095|ref|XP_001925022.1| PREDICTED: simila ( 378) 1272 221.3 4.7e-55 gi|198428877|ref|XP_002125570.1| PREDICTED: simila ( 689) 1258 219.2 3.5e-54 gi|156227806|gb|EDO48608.1| predicted protein [Nem ( 581) 1206 210.6 1.2e-51 gi|47210600|emb|CAF93516.1| unnamed protein produc ( 357) 1167 203.9 7.5e-50 gi|210111871|gb|EEA59659.1| hypothetical protein B ( 446) 1084 190.3 1.2e-45 gi|221111859|ref|XP_002168279.1| PREDICTED: simila ( 616) 1037 182.7 3.2e-43 gi|210096168|gb|EEA44318.1| hypothetical protein B ( 322) 999 176.1 1.6e-41 gi|148847883|gb|EDL62215.1| protein up-regulated b ( 659) 938 166.4 2.7e-38 gi|87290201|gb|EAQ82089.1| protein up-regulated by ( 404) 919 163.0 1.7e-37 gi|223892352|gb|EEF58827.1| protein up-regulated b ( 421) 871 155.1 4.4e-35 gi|171915227|ref|ZP_02930697.1| protein up-regulat ( 393) 852 151.9 3.7e-34 >>gi|74195055|dbj|BAE28276.1| unnamed protein product [M (727 aa) initn: 4466 init1: 4466 opt: 4466 Z-score: 3991.6 bits: 749.0 E(): 1.3e-213 Smith-Waterman score: 4466; 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