FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1977.ptfa, 649 aa vs ./tmplib.26680 library 1768368 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0115+/-0.00596; mu= 12.5108+/- 0.399 mean_var=189.5189+/-44.900, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0932 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1250 ( 1693 res) mbg07525 (1693) 314 55 5e-08 mKIAA1728 ( 1313 res) mbg03474 (1313) 305 54 9.9e-08 mFLJ00246 ( 1454 res) mpm02140 (1454) 304 54 1.2e-07 mKIAA1223 ( 600 res) mfj51380 ( 600) 295 52 1.6e-07 mKIAA1148 ( 1589 res) mfj27189 (1589) 294 53 3.1e-07 mKIAA1785 ( 617 res) mph01357 ( 617) 280 50 6.7e-07 mKIAA1306 ( 1347 res) mbg04314 (1347) 274 50 1.8e-06 mKIAA0957 ( 713 res) mfj01140 ( 713) 270 49 1.8e-06 mKIAA0946 ( 465 res) mbx00001 ( 465) 223 42 0.00012 mKIAA1139 ( 1224 res) mpg00286 (1224) 228 44 0.00012 mKIAA1981 ( 296 res) mic06024 ( 296) 217 41 0.00016 mKIAA0229 ( 1198 res) mpf00455 (1198) 217 42 0.00034 mKIAA1758 ( 1565 res) mic23055 (1565) 217 42 0.0004 mKIAA0172 ( 934 res) mbh02656 ( 934) 213 41 0.00043 mKIAA1334 ( 992 res) mpm09174 ( 992) 211 41 0.00054 mKIAA0379 ( 377 res) mtj01105 ( 377) 198 39 0.0011 mKIAA1146 ( 342 res) mbg10449 ( 342) 196 39 0.0012 mFLJ00040 ( 638 res) mpm09196 ( 638) 183 37 0.0057 >>mKIAA1250 ( 1693 res) mbg07525 (1693 aa) initn: 337 init1: 213 opt: 314 Z-score: 236.5 bits: 55.4 E(): 5e-08 Smith-Waterman score: 314; 34.911% identity (35.329% ungapped) in 169 aa overlap (68-236:4-170) 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 MWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNGGGWTALMYASYI .:.: .. : .:.... :::::::.: : mKIAA1 HIHIVEELLKCGA-NLEHRDMGGWTALMWACYK 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 GHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAELEMKDIHGWTAL :. .:.::: :.. .: . :.. :.. :. .:...:::.::... .: .: : : mKIAA1 GRTDVVELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPL 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 FHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRD . :: . :: :: ::... .: . ..: :. :. .:. :. .:... .:. : mKIAA1 VWAARKGHLECVKHLLAMGADVD-QEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTD 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 HSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDESWPVPQRQRPCQ ..: :: :.: . ::..:: mKIAA1 KDGNTALMIASKEGHIEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYA 160 170 180 190 200 210 >>mKIAA1728 ( 1313 res) mbg03474 (1313 aa) initn: 494 init1: 203 opt: 305 Z-score: 231.1 bits: 54.0 E(): 9.9e-08 Smith-Waterman score: 305; 31.556% identity (33.333% ungapped) in 225 aa overlap (5-220:477-698) 10 20 mKIAA1 GASRCRWRVA-------REPEALQAMSELSDEAS :.: .. :. .::: . . mKIAA1 RVDHLDKKGQCALVHSALRGHSDILQYLLNCEWSAGPPQPGTLRKSQALQQALTAAASMG 450 460 470 480 490 500 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 EPELLKRSLSMW--HGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNG . ... :.: : . ..:. . : : .::. :. :. . ..:: ... : mKIAA1 HSSVVQSLLGMAEEHEIEVNGT-DTLWGETALTAAAGRGKVEICELLLERGAA-VSRANR 510 520 530 540 550 560 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 GGWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAE : :. :. :: .:.:::. : .::. .:.::::.:: :. : . :::..:: mKIAA1 RGVPPLFCAARQGHWQVVRLLLDRGCDVNLSDKQGRTPLMVASCEGHLSTVEFLLSKGAA 570 580 590 600 610 620 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 LEMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQY : : .: .:: ::. .:..:.: ::. . . : ::: :: : : : mKIAA1 LSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAEIDQTDK-NGRTPLDLAAFYGDAETVLY 630 640 650 660 670 680 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 FLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDE ....:. .. :::: mKIAA1 LVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTAVVVTLLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILL 690 700 710 720 730 740 >>mFLJ00246 ( 1454 res) mpm02140 (1454 aa) initn: 289 init1: 289 opt: 304 Z-score: 229.9 bits: 54.0 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 307; 33.000% identity (34.737% ungapped) in 200 aa overlap (43-239:430-622) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 PEALQAMSELSDEASEPELLKRSLSMWHGLGAQ-GSPEE-LDVPLDLHTAASIGQHEVVK ::: . : . .. :: : :: :. :.. mFLJ00 QEHKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTL--AACGGHVELAA 400 410 420 430 440 450 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 ECVQRGELDLNKKNGGGWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSC ..:: .:.. : :.: :: :. ::. .: ::: :...:. : : : . . : mFLJ00 LLIERGA-NLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACC 460 470 480 490 500 510 140 150 160 170 180 mKIAA1 GNES-IAYFLLQQGAELEMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYT :. : .: ::.. ::..:. : :.. .. :: ..::.:: .:::... . : : mFLJ00 GGFSEVADFLIKAGADIELGCS---TPLMEASQEGHLELVKYLLAAGANVHATTAT-GDT 520 530 540 550 560 570 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 PLMEAAASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKS : : .:: ... .:. :.... ....: : : : . ::. : .. mFLJ00 ALTYACENGHTDVADVLLQAGAHLEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRA 580 590 600 610 620 630 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 LYRSPEKYEDLSSSDESWPVPQRQRPCQKKGLSIHEGPRALAKITAIGLGGKTQTTYEQV mFLJ00 TANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDY 640 650 660 670 680 690 >>mKIAA1223 ( 600 res) mfj51380 (600 aa) initn: 752 init1: 201 opt: 295 Z-score: 227.3 bits: 52.2 E(): 1.6e-07 Smith-Waterman score: 308; 26.440% identity (30.240% ungapped) in 382 aa overlap (71-428:67-424) 50 60 70 80 90 mKIAA1 GLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQ---RGELDLNKKNGGGWTALMYASYI .::: ... ...... : .:: :. mKIAA1 EALIEQGARTNEIDNDGRIPFILASQEGHYDCVQILLENKSNIDQRGYDGRNALRVAALE 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 GHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAELEMKDIHGWTAL :: ::.::. :..:: .:. :.. . .. ..: ..:..::..: .: .: ::: mKIAA1 GHRDIVELLFSHGADVNYKDADGRPTLYILALENQLTMAEYFLENGANVEASDAEGRTAL 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 FHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRD :: .::. :. :..:. . . :. :: .:: .:: ...::. :: mKIAA1 HVSCWQGHVEMVRVLIACHADVNAADN-EKRSALQSAAWQGHVKVVQLLIEHGAVVDHTC 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 HSGATACMLARQFGHMKIV-ALME-----THSPVLPKSLYRSP------------EKYED ..:::: .: : ::. .: .:.: .:. . .. .: ::: mKIAA1 NQGATALCIAAQEGHVDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMRVAAKNGHSQIIKLLEKY-G 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 LSSSDESWPVP---QRQRPCQKKGLSIHEGPRALAKITAIGLGGKTQTTYEQVPPRGYVT :: . : : ..:.: :. ... . . : :: : . . .: . mKIAA1 ASSLNGCSPSPVHTMEQKPPQSAPSKMQSLTIRSNSSGGTG-GGDLQPSLRGLPNGPAHA 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 FTSSDENTMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTFCASLGPVWRSSSSDGLARA :.: .: :: . : ..:: :. .. .: . :..:: . :.. mKIAA1 FSSPSE--------------SPDSTVDRQKSSLSNN---SLKSSKNSSLRTTSSTATAQT 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 QGLSSEASIESNEDSDHARKSSVRKQTRSYLKNKSRHGNSDGHWPSSTGPASIPGSEPQT ..: :. .:. .. .: :...:. . . : .: :: : ..:.: mKIAA1 VPIDSFHSLSFTEQIQQ--HSLPRSRSRQSVVSPSSTTQSLGH--SHNSPSSEFEWSQVK 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 EKSPYSGPQQDLATLLEQIGCLKYLQVFEEQDIDLRIFLTLTESDLKEIGITLFGPKRKM mKIAA1 PSLKSTKSNKGGKSDNSSKSGSAGKKAKQNSSSQPKVLEYEMTQFDKRGPVAKSGSSPPK 440 450 460 470 480 490 >>mKIAA1148 ( 1589 res) mfj27189 (1589 aa) initn: 447 init1: 202 opt: 294 Z-score: 222.3 bits: 52.7 E(): 3.1e-07 Smith-Waterman score: 295; 23.877% identity (25.964% ungapped) in 423 aa overlap (57-470:623-1020) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 SEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNGG : .::. :. .: . ...: . . : mKIAA1 SYLLDLPEKDEEEVERAQINSFDSLWGETALTAAAGRGKLDVCRLLLEQGAA-VAQPNRR 600 610 620 630 640 650 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 GWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAEL : . :. . :: :: ::: :..::. .:.::::.:.: :. . . ::: ::: . mKIAA1 GAVPLFSTVRQGHWQIVDLLLTHGADVNMADKQGRTPLMMAASEGHLGTVDFLLAQGASI 660 670 680 690 700 710 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 EMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYF . : .: ::: :: ..:. :...:: .. . : ::: :: : .::.. mKIAA1 ALMDKEGLTALSWACLKGHLSVVRSLVDNGAATDHADK-NGRTPLDLAAFYGDAEVVQFL 720 730 740 750 760 770 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 LNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMK---IVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSS ..::. .. :.:: : : : . .:.:.. . . ..: :. . mKIAA1 VDHGAMIEHVDYSGMRP--LDRAVGCRNTSVVVTLLKKGAKIGCQTLPSRPR-------G 780 790 800 810 820 270 280 290 300 310 mKIAA1 DESWPVPQRQRPCQKKGLS--IHEGPRALAKITAIGLGGKTQTTYEQVPPRGY----VTF .: . . . :: ..:: : . . . : . .. : .:. :: mKIAA1 PATWAMATSKPDIMIILLSKLMEEGDMFYKKGKVKEAAQRYQYALKKFPREGFGEDLKTF 830 840 850 860 870 880 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 TSSDENTMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTFCASLGPVWRSSSSDGLARAQ . . . . : : ... .. ... . . .. : . . . :: .: : mKIAA1 RELKVSLLLNLSRCRRKMNDFGMAEEFATKALELKPK-SYEAYYARARAKRSSRQFAAAL 890 900 910 920 930 940 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 GLSSEASIESNEDSDHARKSSVRKQTRSYLKNKSRHGNSDGHWPSSTGPASIPGSEPQTE .:: :. .. . .. .: .... :. ... . : . : :. : mKIAA1 EDLKEA-IKLCPNNREIQRLLMR------VEEECRQMQQQQQQQPPPPPQQPPQELPEEE 950 960 970 980 990 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 KSPYSGPQQDLATLLEQIGCLKYLQVFEEQDIDLRIFLTLTESDLKEIGITLFGPKRKMT : ::.. ...: .:: :::.. mKIAA1 TEPE--PQHEDIYSVQDIFEEEYL----EQDVENVSIGLQTEARPSQGLPVIQSPPSSPA 1000 1010 1020 1030 1040 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 SAIARWHSSARPPSDALELAYADRLETEMQELAIQLHKCCEEAEALRGQVSQEQELRAVV mKIAA1 HRDSAYISSSPLGSHQVFDFRSNSSVGSPTRQGYQSTSPALSPTHQNSHYRPSPPHTSPA 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>mKIAA1785 ( 617 res) mph01357 (617 aa) initn: 259 init1: 188 opt: 280 Z-score: 216.2 bits: 50.2 E(): 6.7e-07 Smith-Waterman score: 280; 33.929% identity (34.337% ungapped) in 168 aa overlap (76-243:72-237) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 GSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNGGGWTALMYASYIGHDTIVHL : .... .. : : :: :: .:. mKIAA1 ATPLLMAARYGHLDMVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASAAGHLKVVQS 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 LLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAELEMKDIHGWTALFHCTSAGH ::. :.::: : ..::: : :. :. .:... :.::... :: : :. :: mKIAA1 LLNHGASVNNTTLTNSTPLRAACFDGHLEIVKYLVEHKADLEVSNRHGHTCLMISCYKGH 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 QQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRDHSGATACM ......:::.::..: :. : : : : . : :: :....: . .:.. .: : : . mKIAA1 KEIAQYLLEKGADVN-RKSVKGNTALHDCAESGSLDIMKMLLMYCAKME-KDGYGMTPLL 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 LARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDESWPVPQRQRPCQKKGLSIHE : :: .:: .. :. mKIAA1 SASVTGHTNIVDFLTHHAQTSKTERINALELLGATFVDKKRDLLGALKYWKKAMNMRYSD 220 230 240 250 260 270 >>mKIAA1306 ( 1347 res) mbg04314 (1347 aa) initn: 310 init1: 189 opt: 274 Z-score: 208.5 bits: 49.9 E(): 1.8e-06 Smith-Waterman score: 361; 27.088% identity (30.435% ungapped) in 491 aa overlap (57-502:40-521) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 SEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNGG :: :: :. :... .. .. .. :.. mKIAA1 LQRPRPGKAKLLGSTKKINVNFQDPDGFSALHHAALNGNTELISLLLE-AQAAVDIKDNK 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 GWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAEL : : ::.. :. ..:.:.:: .::::. ::. :: ::.. :. ... .:::. .. mKIAA1 GMRPLHYAAWQGRKEPMKLVLKAGSAVNVPSDEGHIPLHLAAQHGHYDVSEMLLQHQSNP 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 mKIAA1 EMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYT-------PLMEAAASGH : : : : : :. .:..:: :. : . :: : : :: :: .:: mKIAA1 CMVDNSGKTPLDLACEFGRVGVVQLLLSSNMCAALLEPRPGDTTDPNGTSPLHLAAKNGH 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 EIIVQYFLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALM-ETHSPVLPKSLYRSP--EK :.. .:. :. .. . .:: :: : :. ..: :. .. . .. : . . mKIAA1 IDIIRLLLQAGIDINRQTKSG-TALHEAALCGKTEVVRLLLDSGINAQVRNTYSQTALDI 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 YEDLSSSDESWPVPQRQRPCQKKGLSIHEGPRALAK--ITAIGL-GGKTQTTYEQVPPRG .....:. : . : : . .:... . .:.... .: :. :: : : mKIAA1 VHQFTTSQASKEIKQLLREASA-ALQVRATKDYCNNYDLTSLNVKAGDIITVLEQ-HPDG 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 mKIAA1 YVTFTSSDENTMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTF---CASLGP------V : : .. . : : ..: :. ..: . ::. .:::: . mKIAA1 RWKGCIHD-NRTGNDRVGY--FPSSLGEAIVKRAGSRTGSEPSPPQGGGSLGPSAPPEEI 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 W--RSSSSDGLARAQGLSSEASIESNED-SDHARKSSVRKQTRSYLKNKSRHGNSDGHWP : :. . : :. .::. :. .:. . :: . .: : . :..:: .: : : mKIAA1 WVLRKPFAGG-DRSGSLSNVAGGRSTGGHALHAGSEGV-KLLATVLSQKSVSESSPGDSP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 -----SSTG------PAS----IPGSEP----QTEKSPYSGPQQDLATLLEQIGCLKYLQ .:.: ::. . : .: .. .. : . .::. : .:: .: . mKIAA1 VKPPEGSSGAARSQPPAAHAGQVYGEQPPKKLESASASASEGKANLAVWLSMIGLAQYYK 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 VFEEQDIDLRIFLT-LTESDLKEIGITLFGPKRKMTSAIARWHSSARPPSDALELAYADR :. .. . :.: .: ::.::::: .: ..:. :. . mKIAA1 VLVDNGYENIDFITDITWEDLQEIGITKLGHQKKLMLAVRKLAELQKAEYSKYEGGPLRR 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 LETEMQELAIQLHKCCEEAEALRGQVSQEQELRAVVESCLLEQDSARKDIHAQLQEAQTL mKIAA1 KTPQSLEMMAIESPPPSEPAAAECQSPKMTTFQDSELSGELQAALSGPAEAGAAAVEKSS 550 560 570 580 590 600 >>mKIAA0957 ( 713 res) mfj01140 (713 aa) initn: 246 init1: 167 opt: 270 Z-score: 208.4 bits: 49.0 E(): 1.8e-06 Smith-Waterman score: 293; 24.432% identity (26.875% ungapped) in 528 aa overlap (57-566:15-512) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 SEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRG-ELDLNKKNG : :: :: : : . ...: .. ..:. mKIAA0 FMSQQDAVAALSERLLIAAYKGQTENVVQLINKGAKVAVTKH-- 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 GGWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAE : : : :. :: ..:..::.:: ...: :: : :. :: : :...: mKIAA0 -GRTPLHLAANKGHLSVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEILTALIREGCA 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 LEMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQY :. .: : ::: . . : .: .:.:...:::. .:. . : : : : ..: .. mKIAA0 LDRQDKDGNTALHEAAWHGFSQSAKLLVKAGANVLARNKA-GNTALHLACQNSHSQSTRI 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 FLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDE .: : ..: ....: : .: ...:...: : : ... :: . ..: mKIAA0 LLLGGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSVVRL-------LLNAFCSVHEKNQ---AGDT 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 SWPVPQRQRPCQKKGLSIHEGPRALAKITAIGLGGKT--QTTYEQVPPRGYVTFTSSDEN . : .:: ... .: : : .. .:.: .:. . :. . .:.. . mKIAA0 ALHVAAALN--HKKVVKVLL--EAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVALLLTKAPQI 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 TMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTFCASLGPVWRSSSSDGLARAQGLSS-- :.: : ..:. . ..: :.: : : : :..: . :.. . mKIAA0 LRFSRGRSLRKRRERLKEE--RRAQSVPRDE--VAQSKGSV---SAGDTPSSEQAVPQKE 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 mKIAA1 EASIESNEDSDHARKSSVRKQTR---SYLKNKSRHGNSD-GHWP---SSTGPASIPGSEP :: . :.. ::. :...: : :.. . .... :: : : . . mKIAA0 EARRDCPPASQEPRKDERRRKSRPEVSALSDPTPAADQQPGHQKNLHSHHHPKKKSRHRC 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 QTEKSPYSGPQQDLATLLE-QIGCLKYLQVFEEQ---DIDLRIFLTLTESDLKEIGITLF . :.. .: :: . . : : .:. . . . . . :. ..:: : mKIAA0 WSPPPPHGFRAYQLYTLYRGEDG--KVMQAPIKGCRCEPLINKLENQLEATVEEIRAELG 380 390 400 410 420 430 500 510 520 530 540 mKIAA1 GPKRKMTSAIARWHSSARPPSDALELAYADRLETEMQELA--IQLHKCCEEAEALRGQVS . . :... ... .:... .:. ...:: .: : .: : :. :. . :.: mKIAA0 SVQDKVNAKLGQMESKTQHQMCVLDKLMVERLSAERTECMNRLQQHAAAEKQEGEKRQMS 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 QEQELRAVVESCLLEQDSARKDIHAQLQEAQTLAQDAALVLDQLRACQAELSARLRQHHS .::.: :.:. .: mKIAA0 LVDELKAW---CMLKIQSLELRLSGESRTFRAKSTPPPSDSTPAVDQPVVAAGPGAASDS 500 510 520 530 540 550 >>mKIAA0946 ( 465 res) mbx00001 (465 aa) initn: 208 init1: 140 opt: 223 Z-score: 176.1 bits: 42.4 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 223; 25.641% identity (26.178% ungapped) in 195 aa overlap (48-240:122-314) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 AMSELSDEASEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGE :.. .: : :: :: .. ..:: ...: mKIAA0 YSTWDIVKATQYGIYERCRELVEAGYDVRQPDKENVTL-LHWAAINNRIDLVKYYISKGA 100 110 120 130 140 150 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 LDLNKKNGG-GWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIA . ... .: . : : .:. :: ..: :.. :.. .. :: . . ::.. :. ::. mKIAA0 I-VDQLGGDLNSTPLHWATRQGHLSMVVQLMKYGADPSLIDGEGCSCIHLAAQFGHTSIV 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 YFLLQQGAELEMKDIHGWTALFHCTSAGHQ-QMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAA .:. .: ...: : .: : :. . :. . ...:: ....:. . . : : :. mKIAA0 AYLIAKGQDVDMMDQNGMTPLMWAAYRTHSVDPTRLLLTFNVSVNLGDKYHKNTALHWAV 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 ASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPE .:. ... .:. : .::... .: .: ::.: .. .. .. mKIAA0 LAGNTTVISLLLEAGGNVDAQNVKGESALDLAKQRKNVWMINHLQEARQAKGYDNPSFLR 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 KYEDLSSSDESWPVPQRQRPCQKKGLSIHEGPRALAKITAIGLGGKTQTTYEQVPPRGYV mKIAA0 KLKADKEFRQKVMLGTPFLVIWLVGFIADLDIDSWLIKGLMYGGVWATVQFLSKSFFDHS 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA1139 ( 1224 res) mpg00286 (1224 aa) initn: 306 init1: 130 opt: 228 Z-score: 175.5 bits: 43.7 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 246; 23.282% identity (27.293% ungapped) in 524 aa overlap (57-515:76-587) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 SEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNGG :: :: :. :.. .. .. .. :... mKIAA1 VAKVKAAKTKLLGSTKRLNINYQDADGFSALHHAALGGSLELIALLLE-AQATVDIKDSN 50 60 70 80 90 100 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 GWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAEL : : ::.. :. :.:::.:...::. . .:: :: ::.. :. .. .:::. .. mKIAA1 GMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAAVNAASLDGQIPLHLAAQYGHYEVSEMLLQHQSNP 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 mKIAA1 EMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLES--------GANANVREPVYGYTPLMEAAASG . . : : :. .....::.: : . .: : ::: :: .: mKIAA1 CLVNKLKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHLCVALLEGEAKDPCDPNYT-TPLHLAAKNG 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 HEIIVQYFLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALM-ETHSPVLPKSLYRSP--E :. ... .:. :.... . ..: :: : .:. ..: :. : : .. : . . mKIAA1 HREVIRQLLKAGIEINRQTKTG-TALHEAALYGKTEVVRLLLEGGVDVNIRNTYNQTALD 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 mKIAA1 KYEDLSSSDESWPVPQRQRPCQ--------KKGLSIHEGPRALAKITAIGLGGKTQTTYE .....:. : . : : . : ..:. : :: .. : : . :. : mKIAA1 IVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDFWNLHD-PTAL-NVRA----GDVITVLE 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 QVPP---RGYVTFT--SSDENTMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTFCASLG : : .:.. . ..:. . :. . :.. .. .. :. . .:.: mKIAA1 QHPDGRWKGHIHESQRGTDRVGYFPPGIV-EVVSKRVGIPVARLPSAPTPLRPSFSRISQ 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 mKIAA1 PVWRS---SSSDGLARAQGLSSEASI-ESNEDSDHARKSSVRKQTRSYLKNKSRHGNSDG :. . : : ::: .. . : .... .:.:. : .... .:.. : mKIAA1 PAADDPLPSVPYGQLPRVGLSPDSPAGDRNSVGSEGSVGSIRSAG-SGQSSEGTNGHGTG 400 410 420 430 440 450 420 430 440 mKIAA1 -------HWPSSTGPASIPG---SEPQTEKS--PYSG------------PQQDLA----- ::.. ..:: : . : : .: :.: : mKIAA1 LLIENAQPLPSASEDQGLPGLHAPSPADNLSHRPLAGYRSGEIFTQDVRPEQLLEGKDAQ 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 ---TLLEQIGCLKYLQVFEEQDIDLRIFLTLTESDLKEIGITLFGPKRKMTS-----AIA . : .. : : . :. . .: :: ::.: : ..:..: .:: mKIAA1 AIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLTAIGVTKPGHRKKIASEIAQLSIA 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 RWHSSARPPSDALELAYADRLETEMQELAIQLHKCCEEAEALRGQVSQEQELRAVVESCL .: . : : :: mKIAA1 EWLPN-YIPVDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVADLTWEELQEIGVNKLGHQKK 580 590 600 610 620 630 649 residues in 1 query sequences 1768368 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:56:55 2006 done: Mon Mar 27 10:56:56 2006 Scan time: 0.800 Display time: 0.300 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]