FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1977.ptfa, 649 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768368 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0115+/-0.00596; mu= 12.5108+/- 0.399
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 Lambda= 0.0932

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The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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 initn: 337 init1: 213 opt: 314  Z-score: 236.5  bits: 55.4 E(): 5e-08
Smith-Waterman score: 314;  34.911% identity (35.329% ungapped) in 169 aa overlap (68-236:4-170)

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                                     .:.: .. :  .:.... :::::::.: : 
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       :.  .:.:::  :.. .:    .  :.. :.. :. .:...:::.::... .: .: : :
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          .  :: . :: ::  ::... .: . ..: :. :. .:.   :. .:... .:.  :
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       ..: :: :.: . ::..::                                         
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Smith-Waterman score: 305;  31.556% identity (33.333% ungapped) in 225 aa overlap (5-220:477-698)

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                                     :.: ..       :. .:::     .   .
mKIAA1 RVDHLDKKGQCALVHSALRGHSDILQYLLNCEWSAGPPQPGTLRKSQALQQALTAAASMG
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mKIAA1 EPELLKRSLSMW--HGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNG
       .  ...  :.:   : . ..:. . :     : .::. :. :. .  ..::   ... : 
mKIAA1 HSSVVQSLLGMAEEHEIEVNGT-DTLWGETALTAAAGRGKVEICELLLERGAA-VSRANR
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        :   :. :.  ::  .:.:::. : .::.   .:.::::.::  :. : . :::..:: 
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       :   : .: .::      ::. .:..:.: ::. .  .   : :::  ::  :    : :
mKIAA1 LSSLDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAEIDQTDK-NGRTPLDLAAFYGDAETVLY
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mKIAA1 FLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDE
       ....:. ..  ::::                                             
mKIAA1 LVEKGAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTAVVVTLLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILL
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         ..::  .:.. :  :.: :: :.  ::. .: :::  :...:. : : :   .  . :
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       :. : .: ::.. ::..:.      : :.. .. :: ..::.:: .:::...   . : :
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        :  :  .::  ... .:. :.... ....: :  : : . ::.  : ..          
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       ::  ::.::.  :..::    .:.  :.. .  .. ..: ..:..::..: .: .: :::
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mKIAA1 FHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRD
             :: .::. :.   :..:. .     . :. :: .::  .:: ...::. ::   
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       ..::::  .: : ::. .: .:.:     .:.  . .. .:              :::  
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        :: .   : :   ..:.: :.   ...       .  . : ::  : . . .:     .
mKIAA1 ASSLNGCSPSPVHTMEQKPPQSAPSKMQSLTIRSNSSGGTG-GGDLQPSLRGLPNGPAHA
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       :.: .:              :: .  : ..:: :.    .. .: .   :..:: . :..
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         ..:  :.  .:. ..  .:  :...:. . . :   .: ::  : ..:.:        
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 initn: 447 init1: 202 opt: 294  Z-score: 222.3  bits: 52.7 E(): 3.1e-07
Smith-Waterman score: 295;  23.877% identity (25.964% ungapped) in 423 aa overlap (57-470:623-1020)

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mKIAA1 SEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRGELDLNKKNGG
                                     : .::. :. .: .  ...:   . . :  
mKIAA1 SYLLDLPEKDEEEVERAQINSFDSLWGETALTAAAGRGKLDVCRLLLEQGAA-VAQPNRR
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mKIAA1 GWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAEL
       : . :. .   ::  :: :::  :..::.   .:.::::.:.: :. . . ::: ::: .
mKIAA1 GAVPLFSTVRQGHWQIVDLLLTHGADVNMADKQGRTPLMMAASEGHLGTVDFLLAQGASI
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mKIAA1 EMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYF
        . : .: :::      :: ..:. :...:: ..  .   : :::  ::  :   .::..
mKIAA1 ALMDKEGLTALSWACLKGHLSVVRSLVDNGAATDHADK-NGRTPLDLAAFYGDAEVVQFL
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mKIAA1 LNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMK---IVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSS
       ..::. ..  :.::     : :  :  .   .:.:..  . .  ..:   :.       .
mKIAA1 VDHGAMIEHVDYSGMRP--LDRAVGCRNTSVVVTLLKKGAKIGCQTLPSRPR-------G
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mKIAA1 DESWPVPQRQRPCQKKGLS--IHEGPRALAKITAIGLGGKTQTTYEQVPPRGY----VTF
         .: .   .   .   ::  ..::     :  .   . . : . .. : .:.     ::
mKIAA1 PATWAMATSKPDIMIILLSKLMEEGDMFYKKGKVKEAAQRYQYALKKFPREGFGEDLKTF
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mKIAA1 TSSDENTMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTFCASLGPVWRSSSSDGLARAQ
            . . . . : : ...    ..  ...   . . .. :  . .  . ::  .: : 
mKIAA1 RELKVSLLLNLSRCRRKMNDFGMAEEFATKALELKPK-SYEAYYARARAKRSSRQFAAAL
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mKIAA1 GLSSEASIESNEDSDHARKSSVRKQTRSYLKNKSRHGNSDGHWPSSTGPASIPGSEPQTE
          .:: :.   .. . ..  .:      .... :. ... .      : . :   :. :
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mKIAA1 KSPYSGPQQDLATLLEQIGCLKYLQVFEEQDIDLRIFLTLTESDLKEIGITLFGPKRKMT
         :   ::..    ...:   .::    :::..                           
mKIAA1 TEPE--PQHEDIYSVQDIFEEEYL----EQDVENVSIGLQTEARPSQGLPVIQSPPSSPA
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mKIAA1 HRDSAYISSSPLGSHQVFDFRSNSSVGSPTRQGYQSTSPALSPTHQNSHYRPSPPHTSPA
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>>mKIAA1785  ( 617 res)   mph01357                        (617 aa)
 initn: 259 init1: 188 opt: 280  Z-score: 216.2  bits: 50.2 E(): 6.7e-07
Smith-Waterman score: 280;  33.929% identity (34.337% ungapped) in 168 aa overlap (76-243:72-237)

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mKIAA1 ATPLLMAARYGHLDMVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASAAGHLKVVQS
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mKIAA1 LLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAELEMKDIHGWTALFHCTSAGH
       ::. :.:::  :  ..:::  :   :.  :. .:... :.::... :: : :.     ::
mKIAA1 LLNHGASVNNTTLTNSTPLRAACFDGHLEIVKYLVEHKADLEVSNRHGHTCLMISCYKGH
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mKIAA1 QQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQYFLNHGVKVDTRDHSGATACM
       ......:::.::..: :. : : : : . : ::   :....: . .:.. .:  : :  .
mKIAA1 KEIAQYLLEKGADVN-RKSVKGNTALHDCAESGSLDIMKMLLMYCAKME-KDGYGMTPLL
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mKIAA1 LARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDESWPVPQRQRPCQKKGLSIHE
        :   :: .:: ..  :.                                          
mKIAA1 SASVTGHTNIVDFLTHHAQTSKTERINALELLGATFVDKKRDLLGALKYWKKAMNMRYSD
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>>mKIAA1306  ( 1347 res)   mbg04314                       (1347 aa)
 initn: 310 init1: 189 opt: 274  Z-score: 208.5  bits: 49.9 E(): 1.8e-06
Smith-Waterman score: 361;  27.088% identity (30.435% ungapped) in 491 aa overlap (57-502:40-521)

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mKIAA1 LQRPRPGKAKLLGSTKKINVNFQDPDGFSALHHAALNGNTELISLLLE-AQAAVDIKDNK
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mKIAA1 GWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAEL
       :   : ::.. :.   ..:.:.:: .::::. ::. :: ::.. :. ... .:::. .. 
mKIAA1 GMRPLHYAAWQGRKEPMKLVLKAGSAVNVPSDEGHIPLHLAAQHGHYDVSEMLLQHQSNP
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mKIAA1 EMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYT-------PLMEAAASGH
        : :  : : :      :.  .:..:: :.  : . ::  : :       ::  :: .::
mKIAA1 CMVDNSGKTPLDLACEFGRVGVVQLLLSSNMCAALLEPRPGDTTDPNGTSPLHLAAKNGH
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         :.. .:. :. .. . .:: ::   :   :. ..: :. ..   .  .. : .   . 
mKIAA1 IDIIRLLLQAGIDINRQTKSG-TALHEAALCGKTEVVRLLLDSGINAQVRNTYSQTALDI
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mKIAA1 YEDLSSSDESWPVPQRQRPCQKKGLSIHEGPRALAK--ITAIGL-GGKTQTTYEQVPPRG
        .....:. :  . :  :  .  .:...       .  .:.... .:   :. ::  : :
mKIAA1 VHQFTTSQASKEIKQLLREASA-ALQVRATKDYCNNYDLTSLNVKAGDIITVLEQ-HPDG
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mKIAA1 YVTFTSSDENTMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTF---CASLGP------V
              : :   .. . :    : ..:  :. ..: .  ::.     .::::      .
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mKIAA1 W--RSSSSDGLARAQGLSSEASIESNED-SDHARKSSVRKQTRSYLKNKSRHGNSDGHWP
       :  :.  . :  :. .::. :. .:.   . :: . .: :   . :..::   .: :  :
mKIAA1 WVLRKPFAGG-DRSGSLSNVAGGRSTGGHALHAGSEGV-KLLATVLSQKSVSESSPGDSP
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mKIAA1 -----SSTG------PAS----IPGSEP----QTEKSPYSGPQQDLATLLEQIGCLKYLQ
            .:.:      ::.    . : .:    .. ..  :  . .::. : .::  .: .
mKIAA1 VKPPEGSSGAARSQPPAAHAGQVYGEQPPKKLESASASASEGKANLAVWLSMIGLAQYYK
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mKIAA1 VFEEQDIDLRIFLT-LTESDLKEIGITLFGPKRKMTSAIARWHSSARPPSDALELAYADR
       :. ..  .   :.: .:  ::.::::: .: ..:.  :. .                   
mKIAA1 VLVDNGYENIDFITDITWEDLQEIGITKLGHQKKLMLAVRKLAELQKAEYSKYEGGPLRR
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mKIAA1 LETEMQELAIQLHKCCEEAEALRGQVSQEQELRAVVESCLLEQDSARKDIHAQLQEAQTL
                                                                   
mKIAA1 KTPQSLEMMAIESPPPSEPAAAECQSPKMTTFQDSELSGELQAALSGPAEAGAAAVEKSS
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>>mKIAA0957  ( 713 res)   mfj01140                        (713 aa)
 initn: 246 init1: 167 opt: 270  Z-score: 208.4  bits: 49.0 E(): 1.8e-06
Smith-Waterman score: 293;  24.432% identity (26.875% ungapped) in 528 aa overlap (57-566:15-512)

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mKIAA1 SEPELLKRSLSMWHGLGAQGSPEELDVPLDLHTAASIGQHEVVKECVQRG-ELDLNKKNG
                                     :  ::  :: : : . ...: .. ..:.  
mKIAA0                 FMSQQDAVAALSERLLIAAYKGQTENVVQLINKGAKVAVTKH--
                               10        20        30        40    

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mKIAA1 GGWTALMYASYIGHDTIVHLLLEAGVSVNVPTPEGQTPLMLASSCGNESIAYFLLQQGAE
        : : :  :.  :: ..:..::.:: ...:     :: :  :.  ::  :   :...:  
mKIAA0 -GRTPLHLAANKGHLSVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEILTALIREGCA
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mKIAA1 LEMKDIHGWTALFHCTSAGHQQMVKFLLESGANANVREPVYGYTPLMEAAASGHEIIVQY
       :. .:  : ::: . .  : .: .:.:...:::. .:. . : : :  :  ..:   .. 
mKIAA0 LDRQDKDGNTALHEAAWHGFSQSAKLLVKAGANVLARNKA-GNTALHLACQNSHSQSTRI
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mKIAA1 FLNHGVKVDTRDHSGATACMLARQFGHMKIVALMETHSPVLPKSLYRSPEKYEDLSSSDE
       .:  : ..: ....: :   .: ...:...: :       : ...    :: .   ..: 
mKIAA0 LLLGGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSVVRL-------LLNAFCSVHEKNQ---AGDT
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mKIAA1 SWPVPQRQRPCQKKGLSIHEGPRALAKITAIGLGGKT--QTTYEQVPPRGYVTFTSSDEN
       .  :       .:: ...    .: :  : .. .:.:  .:.  .  :.  . .:.. . 
mKIAA0 ALHVAAALN--HKKVVKVLL--EAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVALLLTKAPQI
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mKIAA1 TMESEGLCYRDVTSPINEQDVESSSSSSREEPTFCASLGPVWRSSSSDGLARAQGLSS--
          :.:   :     ..:.  . ..:  :.:     : : :   :..:  .  :.. .  
mKIAA0 LRFSRGRSLRKRRERLKEE--RRAQSVPRDE--VAQSKGSV---SAGDTPSSEQAVPQKE
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       ::  .    :.. ::.  :...:   : :.. .  .... ::     :   : .    . 
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