FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0850.ptfa, 644 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768373 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0440+/-0.00477; mu= 14.5071+/- 0.320
 mean_var=105.1397+/-23.952, 0's: 0 Z-trim: 27  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1251

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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        ::::.  .:... .   ...:.. ...  ....:..:.:::.... .: :. .  ::  
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       :... ::..: ..: :..  ..:.. : ::.  . . ::::...: ..:. ..   ::::
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       .:   ..  ..  :.. . :. :..  :: ::...     . . .:::.:.         
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            ::                     :::                         .  .
mKIAA4 -----PLL--------------------PRE-------------------------YLVQ
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        :  :   .:.  :                            : ....... : :  .. 
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       .  :. .:. : :     ::... : .  . .:.::::: . ..:  .: . . : :  :
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       . . : ...::: :: :  .   . :::  :.:: : ..:  : . :. .::: :: :::
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        :  :. ::.. ....  .. :   ::.: :: . .:  .:: :: .:: .  : .::.:
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       :::::..: :  ::::.. :.  : :: .  ... :: : .  .: .: :.:  :.:. .
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       . :: : :  . .::: : .:.::: .: :  :.  : .::.  .:. :  . : : ..:
mKIAA4 MPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSY-LNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVG
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mKIAA0 VCALNGKLYIVGGSDPYGQKGLKNCDVFDPVTKSWTSCAPLNIRRHQSAVCELGGYLYII
       : .:.:::: ::: :  :.. ::. . ::: :..:: :: .. ::   .:   .: :: :
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mKIAA0 GG--AESWNCL----NTVERYNPENNTWTLIAPMNVARRGAGVAVLDGKLFVGGGFDGSH
       ::  : . :      . ::::.:....:: .: :.:.: ..:: .:  ::.. ::.::. 
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        .. :: :::  ::: ... .   :..: ..::                           
mKIAA4 YLNIVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKI                         
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           640    
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       ...::: ::  .:. .:  :.: .:..  ..  .. ::. .. .  ..:  :.  ..   
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                  ::    ..... ..:  :   :   :  .  . . .   :    . :::
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       :. . .     :.. .:   .. .:..             .. :.  :      .... .
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         ..  :  :.  :  .:.: .. ::.. :: .  . : :::::.:.:  :. : :: : 
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       :: ::: :  :.. :.. . .:: :..:. :::.  ::   .:    :.:: .:: .   
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       : .:   :. ::::.:...:::..::... : ..:: .:  .:.. ::.::.  .. .: 
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       . :  ....::                : . ::              ::      .    
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       .... .  ..                     : :.     :   :.        :.:   
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        ::.:...         . . .: .: :: .  :..    . ..    : :: ::.  . 
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       . . ... :.:... :.:.      : . : .   ...:.: . ::    : :   . :.
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       .:.::..::  . .:.. . .......:. .:. ::.:.. :. ..::.:.:..  ::  
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mKIAA0 KKLKMDRVKQVCGDYLLSRMDVTSCISYRNFASCMGDSRLLNKVDAYIQEHLLQISEEEE
       . :..  : . :  .:.: . . .:.    .:. .  ... . :.... ...  .    :
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       :::::  .:  .: .:    :   .  :.  .  :. :      :   .::....     
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        .  .. :..:        :. ..:  .. : :    :        :  :  ..:  .. 
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        : : ..::.  :   : : ... : ..:: .  .      . ::  .::. ..:  .: 
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       .   :. :....: : ::.::: :. . .:   : :.:  ..:: : .. . .  .::. 
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       :: .     ... . . : :.:  . :: :: :  ..  .::::...:..: ::.. .. 
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         .  :. ::: .:::. . ..  :.: .:: .   :.:                     
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       :.:    :.   .. . ...:   ..      : .      .: .. ..      . :  
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       .::  : .: :.: ::    .:   .   :..:  ..: : .:.  ::   ..  .   :
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