FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA3011.ptfa, 496 aa vs ./tmplib.26680 library 1768521 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0393+/-0.00511; mu= 11.5966+/- 0.339 mean_var=170.0774+/-42.449, 0's: 0 Z-trim: 53 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0983 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 425 72 1e-13 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 407 70 8.6e-13 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 404 69 1.1e-12 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 381 66 8e-12 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 379 66 1e-11 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 372 64 1.8e-11 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 372 65 2.2e-11 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 372 65 2.3e-11 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 364 63 4.1e-11 mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 364 63 4.6e-11 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 356 62 9.4e-11 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 359 63 1e-10 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 351 62 1.6e-10 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 344 61 3.8e-10 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 341 60 4.1e-10 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 339 60 5.9e-10 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 336 59 6.3e-10 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 330 59 1.3e-09 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 312 56 7.4e-09 mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 297 54 3.6e-08 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 287 53 1.2e-07 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 282 52 1.9e-07 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 261 49 1.5e-06 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 256 48 1.9e-06 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 243 45 2.5e-06 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 250 47 3.1e-06 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 235 45 1.9e-05 mFLJ00134 ( 174 res) mbg08825 ( 174) 208 41 0.00011 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 215 42 0.00011 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 213 42 0.00014 mKIAA0048 ( 622 res) mid07066 ( 622) 210 42 0.00019 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 207 41 0.00027 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 206 42 0.00042 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 199 40 0.00049 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 197 40 0.0006 mKIAA0390 ( 1303 res) mbh01388 (1303) 200 41 0.00077 mKIAA0354 ( 674 res) mph01349 ( 674) 195 40 0.00086 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 193 39 0.00091 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 196 40 0.00099 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 193 39 0.0011 mKIAA0414 ( 491 res) mbg10164 ( 491) 190 39 0.0012 mKIAA4190 ( 168 res) mfj21107 ( 168) 175 36 0.0027 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 179 37 0.0033 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 181 38 0.0062 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 174 37 0.0066 mFLJ00306 ( 118 res) mif03013 ( 118) 162 34 0.0078 mKIAA1862 ( 1098 res) mbg03386 (1098) 173 37 0.0099 >>mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 (450 aa) initn: 1330 init1: 239 opt: 425 Z-score: 338.7 bits: 72.0 E(): 1e-13 Smith-Waterman score: 486; 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