FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1489.ptfa, 627 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768390 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6341+/-0.00431; mu= 22.1665+/- 0.289
 mean_var=91.1717+/-21.499, 0's: 0 Z-trim: 30  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1343

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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Smith-Waterman score: 697;  27.660% identity (31.643% ungapped) in 564 aa overlap (13-523:84-629)

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       . ..  :...:..:: :::::: . :.::.::.: .:..:  :....: .:::....:..
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       ..:. :  .::.::. .. . : :.: ....  ::. . .:::  ::.:: . : ....:
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       .:  :...: :: :  . ::::.:::.:::..:: : .:.: :..:. . :   : .::.
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       ..:.  ::   ..  .  . :  .:   ...: ..     : .  : .  ::    :   
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          .  .  . ::    :::  :.::...   . :       ::. :  :. .: .::. 
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              :   . :::.     . ::  .:.  .               :.:.     .:
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       .    .  . .: .: ::..        :.    : ::...:  ..   . :: .. :. 
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       ::. :::.:: ::.::: .::.::....:.. : .   .:.... :::.. . .:. ..:
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       .: :.. .:. .:. . : :.: :...  ::. .: ..:  .: .: . . ::   .: .
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       . ..: :.:: .:.....:::..:..: :. : :.:: :. :. ..:  ::  .:. .:.
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         :  .    . :  . .  . ::  .:.   .   :...    .:       :    .:
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mKIAA4 LLGGQTFMCDKLY---LVDQKAKEIIPKADIPSP-RKEFSACAIGCKVYITGG----RGS
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        :  . ::    . :   :       ...::..:..:: .::               .. 
mKIAA4 KLPKVQCYDQCENRWSVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGG--------------DTEF
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       :  :: :.                                                    
mKIAA4 DPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS                             
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                                     : .....:.    :.:. :.....:  :.:
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        :..:::.:: ::.::: . .:::.  .:....::. .:.:.. :.::... :.. .:. 
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       :  .: .::..:: . : :.: ....  ::. . .:::. .: .: ..:. ..:..:. :
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         .: :..:. . . ...:::.:.. .:: : ::.. :.... . :..... .. ..:. 
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        : .  ..::.  ..:  :.   :. ..... :. .:       :  . ::   :.  ..
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           : :    :..  :::. .   :  .. :   . :   :   . .  .: .::.:: 
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          :  .  .:: :. ...::  :.:.    .  .. ::   .:..          :. .
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        ::   .. :. .:  .: :: :....... .. .:: :              ::  :  
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mKIAA1 TVEIYDVNKNEWKMAANIPA-KRYSDPCVRAVVISNSLCVFMRETHLNERAKYVTYQYDL
       .::.:: . : :...:..   .: .  :  ::   :.:   .     .     : : :. 
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mKIAA1 ELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVGKLYPSCLEESPWKPPTYLFSPDGTEEFELDGE
         :.:..   .:  .  . ::..   .::   :::                         
mKIAA4 TTDKWTV---VSSCM--STGRSY---AGKATSSCLLAYSETDISFL              
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mKIAA1 MVALPPV

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        .: : :: :. ..:. :.::.::: .:..:.    ..:..:. ..:. :: . ::..:.
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mKIAA1 VNDSTVEQLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRM
       .: .....  :.: :::.  ::. :. .::. .. .:::..  .:. ..  :. . .. .
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       . ..: :.     :..:  . :  .:::..:.  .:  . .::  ::. . . : .: ..
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mKIAA1 YAIGGDSVGGELNRRTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYV---MT----
       ::.:: :..:::   ::: :. . .::..:. .       :..:    .:.   .:    
mKIAA1 YAVGGRSAAGELA--TVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTF
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        : ..:. : .:.:.. :   : :..    . :::.. ::: :.          :: : .
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       .: . : :. . ..:   : .  .  ::  : ..:. :.. :    .  :.    .. .:
mKIAA1 DVLSCEYYSPTLDQWTPIAAM-LRGQSD--VGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKY
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mKIAA1 DPEKDEWHKVFDLPE----SLGGIRACTLTVFPP---EENPGSPSRESPLSAPSDHS   
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      620       
mKIAA1 GEMVALPPV

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mKIAA1 EGTE--FPCHKMVLATCSSYFRAMFMSGLSESKQTHVHLRNVDAAALQMIIAYAYTGNLA
         :.  .: :....:. :.::.::: .:..:..   ..:..:. ..:. :: . ::..:.
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mKIAA1 VNDSTVEQLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRM
       .: .:...  :.: :::.  ::. :. .::. .. .:::..  .:. .   :. . .. .
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mKIAA1 VLSQIRIDALS--EVTQRAWFQGLPPNDKSVVVQGL----YKSMPKFFKPRLGMTKEEM-
       ....::.  ..  :. . .    .  .:.. :   :    :. :: :..: .   .  . 
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            .. . .  ..   . . . .  .  . .:  .:   :   : ....    : .:.
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mKIAA1 AGGQVPLKNTKTNHSKTSKLQTAFRTVNCFYWFDAQQNTWFPKTPMLFVRVKPSLVCCEG
       .:::       .:..  .: .::  ::   . :: . : :.  . .   :.   :   .:
mKIAA1 VGGQ-------SNYD--TKGKTAVDTV---FRFDPRYNKWIQVASLNEKRTFFHLSALKG
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mKIAA1 YIYAIGGDSVGGELNRRTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYV---MTLN
       ..::.:: ...:::   ::: :. . .:::.:. .       :..:    .:.   .: .
mKIAA1 FLYAVGGRNAAGELP--TVECYNPRTNEWTYVAKMNEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD
     440       450         460       470       480       490       

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mKIAA1 L----MYCYFPRSDSWVEMAMRQTSRSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVD
            ..:. : .:.:.. :   : :..    . ::... ::: :.          :: :
mKIAA1 TFQKELMCFDPDTDKWTQKAPMTTVRGLHCMCTVGDRLYVIGGNHF---------RGTSD
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mKIAA1 GSSV-TVEIYDVNKNEWKMAANIPAKRYSDPCVRAVVISNSLCVFMRETHLNERAKYVTY
        ..: . : :.   ..:   :..  .  ::  : ..:. :.. :    .  :.    .. 
mKIAA1 YDDVLSCEYYSPILDQWTPIASM-LRGQSD--VGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQ
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mKIAA1 QYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVG-----KLYPSCLEESPWKPPTYLFSPDG
       .:: : ..:     . :    .::    ::.      .  ::  .::: . :        
mKIAA1 KYDPEKNEWHKVFDLPE----SLGGIRACTLTVYPPEEATPSPSRESPLSGP        
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mKIAA1 TEEFELDGEMVALPPV

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        :::.:: ::. ... ....:.:.     .. : :..: .:.... ..:::.:.......
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       . : :.:  .: .   . :  .: :...: ::. .:..:. ..: :: . :: .. . : 
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        :  :: ....:.: .:  .:.:.::.. :: : :... :.. .  .:.:: . .:. .:
mKIAA1 EVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRAQYAAELLAAVR
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mKIAA1 ID------ALSEVTQRAWFQGLPPNDKSVVVQGLYKSMPKF--------FKPRLGMTKEE
       .        :. : ..  ...       :     :. .:.          .:::.    :
mKIAA1 LPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAE
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mKIAA1 MMIFI---EASSENPCSLYSSVCYSPQAEKVYKLCSPPADLHKVGTVVTPDNDIYIAGGQ
       .....   .  . .  :: . .:..:: .: : : : :   ..  .::.  ..::..::.
mKIAA1 VIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGM
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                    : .  :   : :..   .  ..:   . :   : . . .  .: ::.
mKIAA1 ------------ESGVTLA--DVWCYM---SLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYT
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mKIAA1 IGGDSVGGELNRRTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVM--------TL
       .:: .:.:....  ::::::  ..:  :.::: : . .::.:    :::.        . 
mKIAA1 LGGLGVAGNVDH--VERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAA
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mKIAA1 NLMYCYFPRSDSWVEMAMRQTSRSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSS
       ...  : :....:  .   . . ..: :....  .: .:: . :  . :  :        
mKIAA1 GVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAY-ARATTIYDPEKGNIKAG
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mKIAA1 VTVEIYDVNKNEWKMAANIPAKRYSDPCVRAVVISNSLCVFMRETHLNERAKYVTYQYDL
                                                                   
mKIAA1 PNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHG
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>>mKIAA0795  ( 588 res)   mfj41092                        (588 aa)
 initn: 581 init1: 417 opt: 511  Z-score: 537.7  bits: 109.6 E(): 8.3e-25
Smith-Waterman score: 568;  27.059% identity (31.797% ungapped) in 510 aa overlap (21-523:41-481)

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mKIAA1 MVLATCSSYFRAMFMSGLSESKQTHVHLRNVDAAALQMIIAYAYTGNLAVNDSTVEQLYE
       .:::.   ::.::: . . : :: .. ....: .::. .: .::.::::.....:..:  
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mKIAA1 TACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRMVEHKFTAVYRQ
        : :::.... . :  .: .... .::. . .::. . :  : ..:. .....:. :  .
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mKIAA1 EAFMQLSHDLLIDILSSDNLNVEKEETVREAAMLWLEYNTESRSQYLSSVLSQIRIDALS
       : :. :  . .....: :.:::..:: : :::. :..:. :.:.  :  .::.::.    
mKIAA0 EEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPCLPELLSNIRLPLC-
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mKIAA1 EVTQRAWFQGLPPNDKSVVVQGLYKSMPKFFKPRLGMTKEEMMIFIEASSENPCSLYSSV
           :  :     .:. :  . : .   :  .  .  .:.  ..      . :       
mKIAA0 ----RPQFL----SDR-VQQDDLVRCCHKC-RDLVDEAKDYHLM----PERRP-------
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mKIAA1 CYSPQAEKVYKLCSPPADLHKVGTVVTPDNDIYIAGGQVPLKNTKTNHSKTSKLQTAFRT
        . :  .   . :.  : :            :: .::                :..:  .
mKIAA0 -HLPAFRTRPRCCTSIAGL------------IYAVGG----------------LNSAGDS
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       .:    ::   : :    ::  .: . ...  .: .:::::    :.:   ::: :. : 
mKIAA0 LNVVEVFDPIANRWEKCHPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGG--YDGQLRLSTVEAYNPET
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mKIAA1 DEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVM-------TLNLMYCYFPRSDSWVEMAMRQTSR
       : :: :. .    .  ..::.   :::        .:: .  : :..:.:. ..  ...:
mKIAA0 DTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLNSVETYSPETDKWTVVTPMSSNR
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mKIAA1 SFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSSVTVEIYDVNKNEWKMAANIPAKR
       : :....:  .:.  ::     ..:... :        .:: :. .   :. ::..  ::
mKIAA0 SAAGVTVFEGRIYVSGG-----HDGLQIFS--------SVEHYNHHTATWHPAASMLNKR
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>>mFLJ00127  ( 641 res)   msk07274                        (641 aa)
 initn: 452 init1: 289 opt: 507  Z-score: 533.2  bits: 108.9 E(): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 571;  27.367% identity (30.636% ungapped) in 581 aa overlap (16-566:54-602)

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mFLJ00 LRLVTMEASKQMRVSRPYKISESSKVYHWPDHSTAVLQRLNEQRLHGLFCDVVLVVEEQQ
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mKIAA1 FPCHKMVLATCSSYFRAMFMSGLSESKQTHVHLRNVDAAALQMIIAYAYTGNLAVNDSTV
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mFLJ00 VPAHRNLLAVCSDYFNSMFTLGMREAFQKEVELVGTSYVGLKAVVDFLYSSELELDGSNI
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mKIAA1 EQLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRMVEHKFT
       . . ::: .::.  :.. : ::: .... .: . :  .:...: ..:      .:  .:.
mFLJ00 DYILETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDSFVLSHFS
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mKIAA1 AVYRQEAFMQ-LSHDLLIDILSSDNLNVEKEETVREAAMLWLEYNTESRSQYLSSVLSQI
       ..     :.: .: . :   ::: ... . :  . ..:. ::  . : :  .   :: .:
mFLJ00 TLSFTPDFLQSISVQKLCVYLSSGQVQHKWEYDLLQVALQWLTQQPE-REVHTRRVLENI
           210       220       230       240       250        260  

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mKIAA1 RIDALSE--VTQR---AWFQGLP--PNDKSVVVQGLYK-----SMPKFFKPRLGMTKEEM
       :.  . :  . ::   :  . ::   : .. : ....      ..: .   :  . .:: 
mFLJ00 RFPLFPEDILLQRVKLAMCSLLPSEANGEGFVEEAMHYHNSLVAQPVLQTKRTLLRSEEC
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mKIAA1 MIFIEASSENPC-SLYSSVCY-SPQAEKVYKLCSPPADL-HKVGTVVTPDNDIYIAGGQV
       ..:. .   . :  : ...:: . . :.  :  : ::   :.  .:.   . :.::::. 
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mKIAA1 PLKNTKTNHSKTSKLQTAFRTVNCFYWFDAQQNTWFPKTPMLFVRVKPSLVCCEGYIYAI
          :  .  :            : .: .: ... :.  . :   ::   :.  : .. :.
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mKIAA1 GGDSVGGELNRRTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYV----------MT
       :: . .: :.  .:: :. . . ::.:. ::      :... .: .:.          . 
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mKIAA1 LNLMYCYFPRSDSWVEMAMRQTSRSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGS
        ::. ::  :.: : :     :.:.. :  ..::.:. :::     .:  :.    : : 
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mKIAA1 SVTVEIYDVNKNEW-KMAANIPAKRYSDPCV---RAVVISNSLCVFMRETHLNERAKYVT
          :: :. . :.: ..:  . :.  :   :   :  ....    .  :.    ::  : 
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mKIAA1 YQYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVGKLYPSCLEESPWKPPTYLFSPDGTEEF
         :: : .:::                                                 
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mKIAA1 PCHKMVLATCSSYFRAMFMSGLSESKQTHVHLRNVDAAALQMIIAYAYTGNLAVNDSTVE
       : :..::.. :.:: ::: . . :..: ......:.  .:  .: ::::: : ......:
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mKIAA1 QLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRMVEHKFTA
        :  :::.::. .:.. : ..:.:...  ::. . ::::  .: .:.. :. .. ..:  
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       : :.. :. :  . .  .:.::..:. .:::. .: . :.... :.: . :: .:. ::.
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         :.     .. . : :.     .: ..    :. .:.    . .::    :  .  .. 
mKIAA4 PLLAPQFLADMENNALFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFA
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       ... .  .  .:.    . .   .. .: :...    . :..:  :. .:..::.  ::.
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mKIAA1 VGGELNRRTVERYDTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVM-------TLNLMYCY
         . ::  ::::.: .  .:..:. .    .  ...:.   .:..        :. . :.
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mKIAA1 FPRSDSWVEMAMRQTSRSFASAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSSVTVEIY
        :....:.  :. .  :. .......  .. ::: : : .:.  : :   :     :: :
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       : . . :  .:.. ..: .   : . .....: .   .  .:.::     ..  :: . .
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       .:.    .       :::   :.:                                    
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       :..::: . ..: :..::.. :.:: ::: : . :.:: .......:  ::  .. .:::
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mKIAA1 GNLAVNDSTVEQLYETACFLQVEDVLQRCREYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQS
       : : ....:.:.:  .::.::. .:.. : ..:.: ..  ::. . .:::  .: :: . 
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       :::.:: .  . ::  ::::.: ....::.:. .  : .  ......  .: .       
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mKIAA1 CLSSMEYYDPHTNKWSMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRL----LD
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mKIAA1 TYQYDLELDRWSLRQHISERVLWDLGRDFRCTVGKLYPSCLEESPWKPPTYLFSPDGTEE
         .:: . ..:.  :  :     ..::   :.:                           
mKIAA1 MESYDPQTNEWT--QMAS----LNIGRAGACVVVIKQP                      
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mKIAA1 FELDGEMVALPPV




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1768390 residues in 2168 library sequences
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]