FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1611.ptfa, 558 aa vs ./tmplib.26680 library 1768459 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2053+/-0.0047; mu= 9.2557+/- 0.314 mean_var=139.9516+/-35.709, 0's: 0 Z-trim: 68 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1084 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 1955 319 1.4e-87 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 1824 298 1.8e-81 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 1762 288 1.1e-78 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 1726 283 8.3e-77 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 1688 277 4.9e-75 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 1621 266 5e-72 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 1617 265 8.2e-72 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 1596 262 7.8e-71 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 1590 261 1.5e-70 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 1574 259 8.2e-70 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 1472 243 6.1e-65 mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 1472 243 6.1e-65 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 1455 240 3.8e-64 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 1454 240 5.1e-64 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 1406 232 6.8e-62 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 1323 219 5.2e-58 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 1289 214 2.6e-56 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 1265 210 3.1e-55 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 1211 202 1e-52 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 967 164 4.5e-41 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 876 149 6.6e-37 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 866 148 1.8e-36 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 866 148 2.1e-36 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 817 140 4.6e-34 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 804 138 1.6e-33 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 647 114 5.3e-26 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 584 104 4e-23 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 491 90 1.5e-18 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 489 90 2.2e-18 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 477 87 3.9e-18 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 415 76 1.3e-15 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 404 76 1.9e-14 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 391 74 4.4e-14 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 391 74 5e-14 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 374 71 2.8e-13 mKIAA3011 ( 496 res) mph01327 ( 496) 364 69 8e-13 mKIAA1951 ( 392 res) mid22012 ( 392) 352 67 2.6e-12 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 337 65 1.5e-11 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 320 62 9.1e-11 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 300 60 1e-09 mKIAA0048 ( 622 res) mid07066 ( 622) 288 58 3.4e-09 mKIAA0360 ( 1055 res) mbh00193 (1055) 287 58 5.2e-09 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 275 56 1.5e-08 mKIAA0569 ( 1248 res) mbg07960 (1248) 276 56 1.9e-08 mKIAA0414 ( 491 res) mbg10164 ( 491) 267 54 2.9e-08 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 269 55 3.6e-08 mKIAA1483 ( 492 res) mth00273 ( 492) 263 54 4.5e-08 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 245 51 3.3e-07 mKIAA0211 ( 1292 res) mpm11220 (1292) 245 51 5.5e-07 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 234 50 1.8e-06 >>mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 (919 aa) initn: 3872 init1: 1947 opt: 1955 Z-score: 1664.7 bits: 318.6 E(): 1.4e-87 Smith-Waterman score: 1973; 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