# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph00982.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1611.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1611, 558 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7889929 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9480+/-0.000186; mu= 8.9223+/- 0.010 mean_var=77.1077+/-14.700, 0's: 31 Z-trim: 233 B-trim: 14 in 1/64 Lambda= 0.146058 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|15929737|gb|AAH15291.1| Zinc finger protein 160 ( 650) 3337 713.8 3.7e-203 gi|162135948|ref|NP_663458.2| zinc finger protein ( 650) 3337 713.8 3.7e-203 gi|74228441|dbj|BAE25340.1| unnamed protein produc ( 650) 3337 713.8 3.7e-203 gi|149047059|gb|EDL99779.1| rCG22999, isoform CRA_ ( 557) 3198 684.5 2.2e-194 gi|148706079|gb|EDL38026.1| zinc finger protein 16 (1454) 3181 681.3 5.3e-193 gi|10440398|dbj|BAB15732.1| FLJ00032 protein [Homo ( 705) 2726 585.1 2.3e-164 gi|119592517|gb|EAW72111.1| zinc finger protein 16 ( 782) 2726 585.2 2.4e-164 gi|20138732|sp|Q9HCG1.2|ZN160_HUMAN RecName: Full= ( 818) 2726 585.2 2.5e-164 gi|63102294|gb|AAH94880.1| Zinc finger protein 160 ( 818) 2726 585.2 2.5e-164 gi|109125905|ref|XP_001116703.1| PREDICTED: zinc f ( 782) 2721 584.1 5.1e-164 gi|109125901|ref|XP_001116710.1| PREDICTED: zinc f ( 818) 2721 584.1 5.3e-164 gi|51476882|emb|CAH18407.1| hypothetical protein [ ( 510) 2711 581.8 1.6e-163 gi|75070653|sp|Q5R8X1.1|ZN665_PONAB RecName: Full= ( 613) 2573 552.8 1e-154 gi|158256242|dbj|BAF84092.1| unnamed protein produ ( 678) 2566 551.4 3.1e-154 gi|74761506|sp|Q9H7R5.1|ZN665_HUMAN RecName: Full= ( 613) 2562 550.5 5.2e-154 gi|134254457|ref|NP_079009.3| zinc finger protein ( 678) 2561 550.3 6.5e-154 gi|109125970|ref|XP_001115785.1| PREDICTED: simila ( 738) 2517 541.1 4.2e-151 gi|19584399|emb|CAD28491.1| hypothetical protein [ ( 535) 2409 518.2 2.4e-144 gi|189054400|dbj|BAG37173.1| unnamed protein produ ( 839) 2409 518.4 3.3e-144 gi|23396996|sp|Q96SE7.1|ZN347_HUMAN RecName: Full= ( 839) 2409 518.4 3.3e-144 gi|119592527|gb|EAW72121.1| zinc finger protein 34 ( 839) 2409 518.4 3.3e-144 gi|158261011|dbj|BAF82683.1| unnamed protein produ ( 840) 2409 518.4 3.3e-144 gi|193788445|dbj|BAG53339.1| unnamed protein produ ( 840) 2409 518.4 3.3e-144 gi|119592525|gb|EAW72119.1| zinc finger protein 34 ( 840) 2409 518.4 3.3e-144 gi|109125918|ref|XP_001116755.1| PREDICTED: simila ( 803) 2392 514.8 3.8e-143 gi|109125914|ref|XP_001116762.1| PREDICTED: simila ( 839) 2392 514.8 4e-143 gi|109125916|ref|XP_001116744.1| PREDICTED: simila ( 840) 2392 514.8 4e-143 gi|126324587|ref|XP_001369062.1| PREDICTED: simila ( 614) 2372 510.5 5.9e-142 gi|126334258|ref|XP_001375736.1| PREDICTED: simila ( 919) 2305 496.5 1.4e-137 gi|112180405|gb|AAH33199.1| Zinc finger protein 61 ( 781) 2268 488.6 2.8e-135 gi|121940044|sp|Q08AN1.1|ZN616_HUMAN RecName: Full ( 781) 2268 488.6 2.8e-135 gi|119592465|gb|EAW72059.1| hCG2008146, isoform CR (1443) 2265 488.3 6.7e-135 gi|114586410|ref|XP_526188.2| PREDICTED: zinc fing (1027) 2252 485.4 3.5e-134 gi|126342468|ref|XP_001377073.1| PREDICTED: simila (1093) 2247 484.4 7.6e-134 gi|114678844|ref|XP_001174436.1| PREDICTED: zinc f ( 755) 2244 483.6 9e-134 gi|126329555|ref|XP_001363177.1| PREDICTED: simila ( 780) 2244 483.6 9.2e-134 gi|114678842|ref|XP_512866.2| PREDICTED: zinc fing ( 781) 2244 483.6 9.2e-134 gi|194221431|ref|XP_001916367.1| PREDICTED: simila ( 943) 2242 483.2 1.4e-133 gi|126324567|ref|XP_001368441.1| PREDICTED: simila ( 635) 2236 481.8 2.5e-133 gi|126330148|ref|XP_001380123.1| PREDICTED: simila ( 782) 2235 481.7 3.4e-133 gi|126324559|ref|XP_001368136.1| PREDICTED: simila ( 762) 2226 479.8 1.2e-132 gi|126344492|ref|XP_001375706.1| PREDICTED: hypoth ( 524) 2222 478.8 1.7e-132 gi|126330150|ref|XP_001380148.1| PREDICTED: simila ( 578) 2222 478.8 1.8e-132 gi|148669906|gb|EDL01853.1| mCG58995, isoform CRA_ ( 609) 2222 478.9 1.9e-132 gi|126324611|ref|XP_001369982.1| PREDICTED: simila ( 678) 2220 478.5 2.8e-132 gi|73970462|ref|XP_531880.2| PREDICTED: similar to (1032) 2221 478.9 3.2e-132 gi|126329710|ref|XP_001371307.1| PREDICTED: simila ( 735) 2218 478.1 3.9e-132 gi|109125704|ref|XP_001113891.1| PREDICTED: simila ( 868) 2216 477.7 5.9e-132 gi|90079633|dbj|BAE89496.1| unnamed protein produc ( 470) 2211 476.4 7.9e-132 gi|126330054|ref|XP_001379270.1| PREDICTED: simila ( 761) 2212 476.8 9.6e-132 >>gi|15929737|gb|AAH15291.1| Zinc finger protein 160 [Mu (650 aa) initn: 3337 init1: 3337 opt: 3337 Z-score: 3803.5 bits: 713.8 E(): 3.7e-203 Smith-Waterman score: 3698; 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