FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1406.ptfa, 838 aa vs ./tmplib.26680 library 1768179 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7784+/-0.00427; mu= 17.1064+/- 0.287 mean_var=87.3793+/-19.528, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1372 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4122 ( 790 res) mbg19439a ( 790) 196 49 2.1e-06 mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 ( 748) 189 48 5.3e-06 mKIAA0695 ( 738 res) mbg01635 ( 738) 153 41 0.00074 mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 ( 792) 141 38 0.004 >>mKIAA4122 ( 790 res) mbg19439a (790 aa) initn: 167 init1: 80 opt: 196 Z-score: 207.3 bits: 49.3 E(): 2.1e-06 Smith-Waterman score: 213; 20.032% identity (23.091% ungapped) in 634 aa overlap (159-739:78-680) 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 DAFGLLESRLDPYLHSLELLEKWTRLGLLMGAGAQGLREKVHTMLRGVLFFSTPRTFQEM :::. . : :. : . :. mKIAA4 RQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGL-----EL 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 VQRLYGRFLRVYMQSKRK-GEGGTDPELEGELDSRYARRRYYRLLQSPLCAGCGSD--KQ .:: .::. :. . : :: : . ... :. . . .:: . .. mKIAA4 YKRLK-EFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 mKIAA1 QC-WCRQALEQFNQLSQVLHRLSLLERVCAEAVTTTLHQVTRER---------------- .: :... .. .:. : : :.. . ......:. . .:: mKIAA4 ECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQS 170 180 190 200 210 220 290 300 310 320 330 mKIAA1 ------MEDR--CRGE----YERSFLREFHKWIERVVGWLGKVFLQDNPTRPTSPEAGNT :: .: :..:: .: :: . :::.::. .: mKIAA4 YVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEAR 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 mKIAA1 LRRWRCHVQRFFY--------RIYATLRIEELFSIIR-DFPDSRPA--IEDLKYCLERTD : . . .:: ... : . ::. . :.. .: . : ::: . .. mKIAA4 LLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVS 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 QRQQLLVSLKVALETRLLHPG---VNTCDIITLYISAIKALRVLDPSMVILEVACEPIRR . :. : :: :::.. . : .. : .: ::.: . : mKIAA4 RIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALN----------DPKMYVQTV------- 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 YLRTREDTVRQIVAGLTGDSDGTGDLAVELSK--TDPACLETGQDSEDDSGEPEDWVPDP : ... .......:. .. : .. .. : . .:.: . : : : mKIAA4 -LDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMAQSS-SKSPELLARYCDS 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 mKIAA1 VDADPVKSSSKRRSSDIISLLVSIYG---SKDLFINEYRSLLADRLLHQFSFSPEREIRN . :. . . : .. .. .. .::.: . : ..:: ::.:: : : . : mKIAA4 LLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASM 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 VELLKLRFGEAPMHFCEVMLKDMADSRRINANIREEDEKRPVEEQPPFGV-YAV-ILSSE . :: : . :..:.. :. .: :. :. . .. :. . ... .::: mKIAA4 ISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLN-----EQFKKHLTNSEPLDLDFSIQVLSSG 510 520 530 540 550 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 FWPPFKDEKLEVPEDIRAALDVYCKKYEKLKAMRTLSWKHTLGLVTMDVELADRTLSVAV :: .. . .: ... . . . : . .. : :.: . :. . .. .. . mKIAA4 SWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQA 560 570 580 590 600 610 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 TPVQAVVLLYFQNQASWTLEELSKVVKMPVALLRRRMSVWLQQGVLREEPPGTFSVIEEE . : ..:: .... ..:...:. ... . .: . ... :.. .: : .. .: : : mKIAA4 STFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENA-NVDEVE 620 630 640 650 660 670 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 RPQDRDNMVLIDSDDESDSGMASQADQKEEELLLFWAYIQAMLTNLESLSLERIYSMLRM .: mKIAA4 LKSDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMR 680 690 700 710 720 730 >>mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 (748 aa) initn: 131 init1: 89 opt: 189 Z-score: 200.1 bits: 47.9 E(): 5.3e-06 Smith-Waterman score: 189; 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