# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph00667.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4214.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4214, 691 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920825 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0250+/-0.000181; mu= 13.1684+/- 0.010 mean_var=69.3579+/-13.622, 0's: 37 Z-trim: 39 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.154002 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|7673997|sp|P98192.1|GNPAT_MOUSE RecName: Full=D ( 678) 4415 990.4 0 gi|19683932|gb|AAH25972.1| Glyceronephosphate O-ac ( 678) 4414 990.2 0 gi|74185151|dbj|BAE39176.1| unnamed protein produc ( 678) 4407 988.6 0 gi|74178172|dbj|BAE29873.1| unnamed protein produc ( 678) 4404 987.9 0 gi|14285412|sp|Q9ES71.1|GNPAT_RAT RecName: Full=Di ( 678) 4211 945.1 0 gi|148679838|gb|EDL11785.1| glyceronephosphate O-a ( 617) 3845 863.7 0 gi|62089350|dbj|BAD93119.1| glyceronephosphate O-a ( 693) 3748 842.2 0 gi|109020000|ref|XP_001106100.1| PREDICTED: glycer ( 681) 3715 834.9 0 gi|55729941|emb|CAH91697.1| hypothetical protein [ ( 680) 3712 834.2 0 gi|62897105|dbj|BAD96493.1| glyceronephosphate O-a ( 680) 3695 830.4 0 gi|3913409|sp|O15228.1|GNPAT_HUMAN RecName: Full=D ( 680) 3694 830.2 0 gi|114573162|ref|XP_001151001.1| PREDICTED: glycer ( 680) 3689 829.1 0 gi|12653361|gb|AAH00450.1| Glyceronephosphate O-ac ( 680) 3688 828.9 0 gi|62898169|dbj|BAD97024.1| glyceronephosphate O-a ( 680) 3684 828.0 0 gi|189054342|dbj|BAG36862.1| unnamed protein produ ( 680) 3675 826.0 0 gi|149690809|ref|XP_001494211.1| PREDICTED: simila ( 680) 3672 825.3 0 gi|149043212|gb|EDL96744.1| glyceronephosphate O-a ( 617) 3663 823.3 0 gi|172044184|sp|A4IF87.1|GNPAT_BOVIN RecName: Full ( 680) 3635 817.1 0 gi|73952598|ref|XP_536346.2| PREDICTED: similar to ( 796) 3567 802.0 0 gi|109020002|ref|XP_001106029.1| PREDICTED: glycer ( 647) 3554 799.1 0 gi|114573168|ref|XP_001150602.1| PREDICTED: glycer ( 648) 3533 794.4 0 gi|114573170|ref|XP_001150859.1| PREDICTED: glycer ( 646) 3523 792.2 0 gi|114573172|ref|XP_001150797.1| PREDICTED: glycer ( 622) 3369 758.0 2.3e-216 gi|194388646|dbj|BAG60291.1| unnamed protein produ ( 619) 3266 735.1 1.8e-209 gi|114573166|ref|XP_001150483.1| PREDICTED: glycer ( 619) 3261 734.0 3.9e-209 gi|114573174|ref|XP_001150731.1| PREDICTED: glycer ( 625) 3225 726.0 9.9e-207 gi|126307259|ref|XP_001379250.1| PREDICTED: hypoth ( 691) 3156 710.7 4.4e-202 gi|194042599|ref|XP_001924436.1| PREDICTED: simila ( 614) 2999 675.7 1.3e-191 gi|116284022|gb|AAH03225.1| Gnpat protein [Mus mus ( 585) 2966 668.4 2e-189 gi|148679839|gb|EDL11786.1| glyceronephosphate O-a ( 598) 2966 668.4 2e-189 gi|114573164|ref|XP_001150933.1| PREDICTED: glycer ( 670) 2949 664.7 3e-188 gi|224047788|ref|XP_002190269.1| PREDICTED: simila ( 669) 2945 663.8 5.6e-188 gi|118088257|ref|XP_419589.2| PREDICTED: hypotheti ( 666) 2892 652.0 2e-184 gi|193785805|dbj|BAG51240.1| unnamed protein produ ( 492) 2663 601.0 3.2e-169 gi|115528812|gb|AAI24984.1| LOC100158402 protein [ ( 666) 2595 586.0 1.4e-164 gi|112419361|gb|AAI21964.1| Glyceronephosphate O-a ( 668) 2577 582.0 2.3e-163 gi|56204473|emb|CAI21987.1| glyceronephosphate O-a ( 587) 2543 574.4 3.9e-161 gi|49257620|gb|AAH74254.1| MGC84007 protein [Xenop ( 664) 2535 572.7 1.5e-160 gi|189537915|ref|XP_701136.3| PREDICTED: glycerone ( 668) 2478 560.0 9.6e-157 gi|89268945|emb|CAJ81854.1| glyceronephosphate O-a ( 529) 2073 470.0 9.8e-130 gi|2661037|gb|AAB88177.1| dihydroxyacetone phospha ( 383) 2012 456.3 9.1e-126 gi|189533379|ref|XP_689194.3| PREDICTED: similar t ( 666) 1953 443.4 1.2e-121 gi|220673085|emb|CAX13824.1| novel protein similar ( 656) 1821 414.0 8.2e-113 gi|47222456|emb|CAG12976.1| unnamed protein produc ( 669) 1693 385.6 3e-104 gi|210123421|gb|EEA71122.1| hypothetical protein B ( 627) 1653 376.7 1.4e-101 gi|115928250|ref|XP_795518.2| PREDICTED: hypotheti ( 672) 1499 342.5 2.9e-91 gi|12835520|dbj|BAB23276.1| unnamed protein produc ( 228) 1488 339.7 6.8e-91 gi|47224226|emb|CAG09072.1| unnamed protein produc ( 678) 1455 332.7 2.5e-88 gi|90085126|dbj|BAE91304.1| unnamed protein produc ( 286) 1450 331.3 2.8e-88 gi|210123407|gb|EEA71108.1| hypothetical protein B ( 538) 1367 313.1 1.6e-82 >>gi|7673997|sp|P98192.1|GNPAT_MOUSE RecName: Full=Dihyd (678 aa) initn: 4415 init1: 4415 opt: 4415 Z-score: 5296.2 bits: 990.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 4415; 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81.351% identity (95.888% similar) in 681 aa overlap (14-691:1-681) 10 20 30 40 50 mKIAA4 QTSPGPARDGSRAMDVPSSSSSRFSVGSASPSSV-LLYAKDLKKWDEFEDLLEERRHISD :. ::::.: :::: .:::.: :::.:.:::::::::.::::::.:: gi|109 MESPSSSNSYFSVGPTSPSAVVLLYSKELKKWDEFEDILEERRHVSD 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 FKFAMKCYTPPLYRGITPCKPGDIKSIVLSSEEINYVIKQLSRESLTGVDVLREEASEIL .::::::::: .:.::::::: ::: :::::::.:::::::.::: .:::::::.:::: gi|109 LKFAMKCYTPLVYKGITPCKPTDIKCSVLSSEEIHYVIKQLSKESLQSVDVLREEVSEIL 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 EEMSHKLRIGAIRFFAFVLSKIFKQIFSKVCVNEEGIQKLQRAVQEHPVVLLPSHRSYID .:::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: gi|109 DEMSHKLRLGAIRFFAFTLSKIFKQIFSKVCVNEEGIQKLQRAIQEHPVVLLPSHRSYID 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 FLMLSFILYSYDLPVPVIAAGMDFLGMRVVSELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYV :::::::::.:::::::::::::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 FLMLSFILYNYDLPVPVIAAGMDFLGMKMVGELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 KTMLRCGYAPVEFFLEGTRSRAAKTLTPKFG-LLNIVMEPFFKREVFDTYFVPISISYDK ::::: :::::::::::::::.::::::::: ::::::::::::::::::.::::::::: gi|109 KTMLRNGYAPVEFFLEGTRSRSAKTLTPKFGSLLNIVMEPFFKREVFDTYLVPISISYDK 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 ILEESLYAYEILGVPKPKESTTGLLKARRILSENFGSIHVYFGDPVSLRSLAAGRLNRNT ::::.::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:.. gi|109 ILEETLYVYELLGVPKPKESTTGLLKARRILSENFGSIHVYFGDPVSLRSLAAGRMSRSS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 YNLVPRCIPQKQPEDVQAFVTEVAYKMQLLQIENLALSPWLLVVTILLQNQLSMDFDALV :::::: ::::: ::..::::::::::.:::.::..:::: :.:..::::. :::::::: gi|109 YNLVPRYIPQKQSEDMHAFVTEVAYKMELLQVENMVLSPWTLIVAVLLQNRPSMDFDALV 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 EKTLWLKGVTQVFGGFLLWPDNKLPEEVVQSSILLHSNLASLVKDQVVLKMNSGSSQVVN ::::::::.::.:::::.::::. :::::.:::::::.::::.:::.::..::.:.::. gi|109 EKTLWLKGLTQAFGGFLIWPDNEPAEEVVQASILLHSNIASLVRDQVILKVDSGDSEVVD 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 GLVPEHIALLMCSAYRNQLLNIFARPSLVALALHMTPGLRKEDVFSCFSFLRNVFSDEFI ::. .::.:::::::::::::::.::::::.::.::::.:::::.::: :::.::.:::: gi|109 GLIFQHITLLMCSAYRNQLLNIFVRPSLVAMALQMTPGFRKEDVYSCFRFLRDVFADEFI 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 FLPGNTLRDFEEGCYLLCKAEAMQMAGKDIILTDKGTAVLQFLTSLFKPFVESYQLLCRY :::::::.:::::::::::.::.:.. :::..:.::..::.:: .::::::::::..:.: gi|109 FLPGNTLKDFEEGCYLLCKSEAIQVTTKDILVTEKGNTVLEFLIGLFKPFVESYQIICKY 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 LL-HEEDYFGEKEYLVAARKFTRQLLDQGSSQCYDALSSELQKNALAAFVRLGVVEKKKV :: .:::.:.:..::.:.:::: ::::::.:::::.:::..::::::: ::::::::::. gi|109 LLSEEEDHFSEEQYLAAVRKFTSQLLDQGTSQCYDVLSSDVQKNALAACVRLGVVEKKKI 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 mKIAA4 DSKYVYYVNGPATSKLEEMLGCKKPIGKPATAKL ... .. :: :::.::::::::: ::::::.::: gi|109 NNNCIFNVNEPATTKLEEMLGCKTPIGKPAAAKL 650 660 670 680 >>gi|55729941|emb|CAH91697.1| hypothetical protein [Pong (680 aa) initn: 3239 init1: 3239 opt: 3712 Z-score: 4452.0 bits: 834.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 3712; 81.176% identity (95.735% similar) in 680 aa overlap (14-691:1-680) 10 20 30 40 50 mKIAA4 QTSPGPARDGSRAMDVPSSSSSRFSVGSASPSSV-LLYAKDLKKWDEFEDLLEERRHISD :. :: .: :::: .:::.: :::.:.:::::::::.::::::.:: gi|557 MESSSSPNSYFSVGPTSPSAVVLLYSKELKKWDEFEDILEERRHVSD 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 FKFAMKCYTPPLYRGITPCKPGDIKSIVLSSEEINYVIKQLSRESLTGVDVLREEASEIL .::::::::: .:.::::::: ::: ::.::::.:::::::.::: .:::::::.:::: gi|557 LKFAMKCYTPLVYKGITPCKPIDIKCSVLNSEEIHYVIKQLSKESLQSVDVLREEVSEIL 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 EEMSHKLRIGAIRFFAFVLSKIFKQIFSKVCVNEEGIQKLQRAVQEHPVVLLPSHRSYID .:::::::.::::::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: gi|557 DEMSHKLRLGAIRFFAFTLSKVFKQIFSKVCVNEEGIQKLQRAIQEHPVVLLPSHRSYID 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 FLMLSFILYSYDLPVPVIAAGMDFLGMRVVSELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYV ::::::.::.:::::::::::::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 FLMLSFLLYNYDLPVPVIAAGMDFLGMKMVGELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 KTMLRCGYAPVEFFLEGTRSRAAKTLTPKFGLLNIVMEPFFKREVFDTYFVPISISYDKI ::::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: gi|557 KTMLRNGYAPVEFFLEGTRSRSAKTLTPKFGLLNIVMEPFFKREVFDTYLVPISISYDKI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 LEESLYAYEILGVPKPKESTTGLLKARRILSENFGSIHVYFGDPVSLRSLAAGRLNRNTY :::.::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:..: gi|557 LEETLYVYELLGVPKPKESTTGLLKARRILSENFGSIHVYFGDPVSLRSLAAGRMSRSSY 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 NLVPRCIPQKQPEDVQAFVTEVAYKMQLLQIENLALSPWLLVVTILLQNQLSMDFDALVE ::::: ::::: ::..::::::::::.::::::..:::: :.:..::::. ::::::::: gi|557 NLVPRYIPQKQSEDMHAFVTEVAYKMELLQIENMVLSPWTLIVAVLLQNRPSMDFDALVE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 KTLWLKGVTQVFGGFLLWPDNKLPEEVVQSSILLHSNLASLVKDQVVLKMNSGSSQVVNG :::::::.::.:::::.::::: :::::.:::::::.::::::::.::..::.:.::.: gi|557 KTLWLKGLTQAFGGFLIWPDNKPAEEVVQASILLHSNIASLVKDQVILKVDSGDSEVVDG 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 LVPEHIALLMCSAYRNQLLNIFARPSLVALALHMTPGLRKEDVFSCFSFLRNVFSDEFIF :. .::.:::::::::::::::.::::::.::.::::.:::::.::: :::.::.::::: gi|557 LIFQHITLLMCSAYRNQLLNIFVRPSLVAIALQMTPGFRKEDVYSCFRFLRDVFADEFIF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 LPGNTLRDFEEGCYLLCKAEAMQMAGKDIILTDKGTAVLQFLTSLFKPFVESYQLLCRYL ::::::.:::::::::::.::.:.. :::..:.::..::.:: .::::::.:::..:.:: gi|557 LPGNTLKDFEEGCYLLCKSEAIQVTTKDILVTEKGNTVLEFLIGLFKPFVKSYQIICKYL 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 L-HEEDYFGEKEYLVAARKFTRQLLDQGSSQCYDALSSELQKNALAAFVRLGVVEKKKVD : .:::.:.:..::.:.:::: ::::::. ::::.:::..::::::: ::::::::::.. gi|557 LSEEEDHFSEEQYLAAVRKFTSQLLDQGTYQCYDVLSSDVQKNALAACVRLGVVEKKKIN 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 mKIAA4 SKYVYYVNGPATSKLEEMLGCKKPIGKPATAKL ..:.. :: :::.::::::::: :::::::::: gi|557 NNYIFNVNEPATTKLEEMLGCKTPIGKPATAKL 650 660 670 680 >>gi|62897105|dbj|BAD96493.1| glyceronephosphate O-acylt (680 aa) initn: 3220 init1: 3220 opt: 3695 Z-score: 4431.6 bits: 830.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 3695; 81.029% identity (95.882% similar) in 680 aa overlap (14-691:1-680) 10 20 30 40 50 mKIAA4 QTSPGPARDGSRAMDVPSSSSSRFSVGSASPSSV-LLYAKDLKKWDEFEDLLEERRHISD :. :::.:.:::: .:::.: :::.:.:::::::::.::::::.:: gi|628 MESSSSSNSHFSVGPTSPSAVVLLYSKELKKWDEFEDILEERRHVSD 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 FKFAMKCYTPPLYRGITPCKPGDIKSIVLSSEEINYVIKQLSRESLTGVDVLREEASEIL .::::::::: .:.::::::: ::: ::.::::.:::::::.::: .:::::::.:::: gi|628 LKFAMKCYTPLVYKGITPCKPIDIKCSVLNSEEIHYVIKQLSKESLQSVDVLREEVSEIL 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 EEMSHKLRIGAIRFFAFVLSKIFKQIFSKVCVNEEGIQKLQRAVQEHPVVLLPSHRSYID .:::::::.::::: ::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: gi|628 DEMSHKLRLGAIRFCAFTLSKVFKQIFSKVCVNEEGIQKLQRAIQEHPVVLLPSHRSYID 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 FLMLSFILYSYDLPVPVIAAGMDFLGMRVVSELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYV ::::::.::.:::::::::::::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::: gi|628 FLMLSFLLYNYDLPVPVIAAGMDFLGMKMVGELLRMSGAFFMRRTFGGNKLYWAVFSEYV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 KTMLRCGYAPVEFFLEGTRSRAAKTLTPKFGLLNIVMEPFFKREVFDTYFVPISISYDKI ::::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: gi|628 KTMLRNGYAPVEFFLEGTRSRSAKTLTPKFGLLNIVMEPFFKREVFDTYLVPISISYDKI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 LEESLYAYEILGVPKPKESTTGLLKARRILSENFGSIHVYFGDPVSLRSLAAGRLNRNTY :::.::.::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:..: gi|628 LEETLYVYELLGVPKPKESTTGLLKARKILSENFGSIHVYFGDPVSLRSLAAGRMSRSSY 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 NLVPRCIPQKQPEDVQAFVTEVAYKMQLLQIENLALSPWLLVVTILLQNQLSMDFDALVE ::::: ::::: ::..::::::::::.::::::..:::: :.:..::::. ::::::::: gi|628 NLVPRYIPQKQSEDMHAFVTEVAYKMELLQIENMVLSPWTLIVAVLLQNRPSMDFDALVE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 KTLWLKGVTQVFGGFLLWPDNKLPEEVVQSSILLHSNLASLVKDQVVLKMNSGSSQVVNG :::::::.::.:::::.::::: :::: .:::::::.::::::::.::..::.:.::.: gi|628 KTLWLKGLTQAFGGFLIWPDNKPAEEVVPASILLHSNIASLVKDQVILKVDSGDSEVVDG 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 LVPEHIALLMCSAYRNQLLNIFARPSLVALALHMTPGLRKEDVFSCFSFLRNVFSDEFIF :. .::.:::::::::::::::.::::::.::.::::.:::::.::: :::.::.::::: gi|628 LMLQHITLLMCSAYRNQLLNIFVRPSLVAVALQMTPGFRKEDVYSCFRFLRDVFADEFIF 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 LPGNTLRDFEEGCYLLCKAEAMQMAGKDIILTDKGTAVLQFLTSLFKPFVESYQLLCRYL ::::::.:::::::::::.::.:.. :::..:.::..::.::..::::::::::..:.:: gi|628 LPGNTLKDFEEGCYLLCKSEAIQVTTKDILVTEKGNTVLEFLVGLFKPFVESYQIICKYL 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 mKIAA4 L-HEEDYFGEKEYLVAARKFTRQLLDQGSSQCYDALSSELQKNALAAFVRLGVVEKKKVD : .:::.:.:..::.:.:::: ::::::.:::::.:::..::::::: ::::::::::.. gi|628 LSEEEDHFSEEQYLAAVRKFTSQLLDQGTSQCYDVLSSDVQKNALAACVRLGVVEKKKIN 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 mKIAA4 SKYVYYVNGPATSKLEEMLGCKKPIGKPATAKL .. .. :: :::.::::::::: :::::::::: gi|628 NNCIFNVNEPATTKLEEMLGCKTPIGKPATAKL 650 660 670 680 691 residues in 1 query sequences 2727779818 residues in 7921681 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Wed Mar 18 03:25:14 2009 done: Wed Mar 18 03:33:12 2009 Total Scan time: 1055.230 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]