FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00202.ptfa, 831 aa vs ./tmplib.26680 library 1768186 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6393+/-0.00427; mu= 24.2572+/- 0.287 mean_var=80.4922+/-18.225, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1430 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1560 ( 848 res) mfj43284 ( 848) 1047 226 1.3e-59 >>mKIAA1560 ( 848 res) mfj43284 (848 aa) initn: 1083 init1: 366 opt: 1047 Z-score: 1162.6 bits: 226.1 E(): 1.3e-59 Smith-Waterman score: 1286; 33.588% identity (35.389% ungapped) in 786 aa overlap (69-829:76-846) 40 50 60 70 80 90 mFLJ00 PQTQQRSNHNGQETSLWSSSFGMKMEAITPFLGKYRPFMGRCCQTCTPKSWESLFHRSIM .... :::.:::: .:::.::: .:. :: mKIAA1 GRCKHTSEDWVDCGFKPTFFRSATLKWKESLMSRKRPFVGRCCYSCTPQSWERFFNPSIP 50 60 70 80 90 100 100 110 120 130 140 150 mFLJ00 DLGFCNVILVKEENTRFRGWLVRRLCYFLWSLEQHIPTSFDAS---QKIMENTGVQNLLS .::. ::: ..: .:: ::::.::: :.:. :. . .. :. .... .. ::. .. mKIAA1 SLGLRNVIYINETHTRHRGWLARRLSYILFVQERDVHKGMFATSVTENVLSSSRVQEAIA 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 mFLJ00 GRV----PGAAGEGQ--APELVKKEVQRILGHIQTTPRPFLLRLFSWALLWFLNRLFLNV . : .... : : . ::.....:: .. .: : ..:: .:.:: ..: .: :. mKIAA1 EVAAELNPDGSAQQQSKAIQKVKRKARKILQEMVATVSPGMIRLTGWVLLKLFNSFFWNI 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 mFLJ00 QLHKGQMKMVQKAVQEGSPLVFLSTHKSLLDGFLLPFVLFSQGLGVVRVALDSRTCSPVL :.::::..::. :.. . ::.:: .:.: .: .:: :.:: ... . .: . ::. mKIAA1 QIHKGQLEMVKAATETNLPLLFLPVHRSHIDYLLLTFILFCHNIKAPYIASGNNLNIPVF 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 mFLJ00 RALLRKLGGLFLPPEVNLSLDNSEGILARAVVRATVEELLTSGQPLLIFLEEPPGSPGPR .:..::::.:. ... . :. . :: ::.... : ::: . : : :::: . : . mKIAA1 STLIHKLGGFFIRRRLDETPDGRKDILYRALLHGHVVELLRQQQFLEIFLEGTRSRSG-K 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 mFLJ00 LSALGQAWLGVVIQAVQAGIISDATLVPVAIAYDLVPDAPCNMNHDLAP---LGLWTGAL : . :.::....... : : ..::.:.:: . .. : .. : .::. : mKIAA1 TSCARAGLLSVVVDTLSSNTIPDILVIPVGISYDRIIEGHYNGEQLGKPKKNESLWSVAR 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 mFLJ00 AVFRRLCNCWGCNRRVCVRVHLAQPFSLQEYTIN-ARSCWDSRQTLEHLLQPIVLGECSV .:.: : . .: ::: .::::::.:: . ... .. .::. : : .: : mKIAA1 GVIRMLRKNYGY-----VRVDFAQPFSLKEYLEGQSQKPVSAPLSLEQALLPAILP--SR 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 mFLJ00 VPDTEKE-QEWTPPTGLLLALKEEDQLLVRRLSRHVLSASVASSAVMSTAIMATLLLLKH :. : :. . . : . . :. :..:.: .. : :.::: :.: ::: .: mKIAA1 PNDVADEHQDLSSNESRNPADEAFRRRLIANLAEHILFTASKSCAIMSTHIVACLLLYRH 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 mFLJ00 QKGVVLSQLLGEFSWLTEETLLRGFDVGFSGQLRCLAQHTLSLLRAHVVLLRVHQGD-LV ..:. :: :. .: . ::.: : ::.::::. . ...:...:: :.. .. . : . mKIAA1 RQGIHLSTLVEDFFVMKEEVLARDFDLGFSGNSEDVVMHAIQLLGNCVTITHTSRKDEFF 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 mFLJ00 VVPRPG-PGLTHLARLSMELLPTFLSEAVGACAVRGLLAGRVPPEGPWELQGIELLSQNE ..: :.. .: : .: .:. ::. ::.. ..: : . : . :.::.. mKIAA1 ITPSTTVPSVFELNFYSNGVLHVFIMEAIIACSIYAVLNKRCSGGSAGGLGN--LISQEQ 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 mFLJ00 LYRQILLLLHLLPQDLLLPQPCQSSYCYCQEVLDRLIQCGLL-VAEETPGSRPACDTGRQ : :. : .:: .. . :::. : :.:.. ..:: :.: :::. . ..: mKIAA1 LVRKAASLCYLLSNEGTISLPCQTFYQVCHETVGKFIQYGILTVAEQDDQEDVSPGLAEQ 640 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 mFLJ00 HLSAKL---LWKPSGDFTDSESDDFEEPGGRCF-RLSQQSRCPDFFLFLCRLLSPILKAF . . :: :. .: : .:: : : :. ..::... .:. :: :::.:.:.:. mKIAA1 QWDKKLPELNWR--SDEEDEDSD-FGEEQRDCYLKVSQSKEHQQFITFLQRLLGPLLEAY 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 mFLJ00 AQAATFLH--LGQLPDSEVAYSEKLFQFLQACAQEE-GIF-ECADPNLAISAVWTFKDLG ..:: :.: : .:.:: : .:: ..: . .... ... : : :. .:: :::.: mKIAA1 SSAAIFVHNFSGPVPESE--YLQKLHRYLITRTERNVAVYAESATYCLVKNAVKMFKDIG 760 770 780 790 800 810 800 810 820 830 mFLJ00 VLQEMPSPTGPQLHLSPTFATRDNQDKLEQFIRQFICS :..: . :.:: :: . :..:: ..: .:. mKIAA1 VFKETKQKRVSVLELSSTFLPQCNRQKLLEYILSFVVL 820 830 840 831 residues in 1 query sequences 1768186 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:08:03 2006 done: Mon Mar 27 10:08:04 2006 Scan time: 0.960 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]