FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1948.ptfa, 463 aa vs ./tmplib.26680 library 1768554 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9638+/-0.00465; mu= 11.7992+/- 0.311 mean_var=128.5173+/-32.670, 0's: 0 Z-trim: 64 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1131 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 2238 377 1.6e-105 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 2111 356 2.9e-99 mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 1574 269 7.4e-73 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 1519 260 4.7e-70 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 1471 252 1e-67 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 1443 248 2.6e-66 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 1427 245 1.2e-65 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 1407 242 1.6e-64 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 1403 241 1.6e-64 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 1397 240 3.3e-64 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 1280 221 1.9e-58 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 1278 220 2.8e-58 mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 1260 217 2.1e-57 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 1248 216 8.1e-57 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 1114 193 2.6e-50 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 1052 184 3.6e-47 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 1020 178 1.2e-45 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 1002 175 1e-44 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 953 167 2.1e-42 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 899 159 1.4e-39 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 852 151 2.9e-37 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 804 143 5e-35 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 747 134 3e-32 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 719 129 8.6e-31 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 647 117 2.8e-27 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 632 115 1.4e-26 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 558 103 9.7e-23 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 540 100 6.2e-22 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 486 92 4.2e-19 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 449 85 1.5e-17 mKIAA0287 ( 1618 res) mbg03130 (1618) 404 78 4.1e-15 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 388 74 5.4e-15 mKIAA3011 ( 496 res) mph01327 ( 496) 364 71 2e-13 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 362 71 2.5e-13 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 324 65 1.9e-11 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 328 66 2.1e-11 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 324 65 3.2e-11 mKIAA0296 ( 1541 res) mpf00724 (1541) 318 64 6.8e-11 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 303 61 2e-10 mKIAA1951 ( 392 res) mid22012 ( 392) 299 60 2.7e-10 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 291 60 1.1e-09 mKIAA1803 ( 705 res) mfj24209 ( 705) 274 57 6.3e-09 mKIAA0414 ( 491 res) mbg10164 ( 491) 271 56 7.3e-09 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 270 56 7.9e-09 mKIAA0048 ( 622 res) mid07066 ( 622) 267 55 1.3e-08 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 255 54 5.4e-08 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 253 53 5.7e-08 mKIAA0569 ( 1248 res) mbg07960 (1248) 248 53 1.7e-07 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 238 51 3.2e-07 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 230 49 9.2e-07 >>mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 (486 aa) initn: 4882 init1: 2128 opt: 2238 Z-score: 1986.7 bits: 377.0 E(): 1.6e-105 Smith-Waterman score: 2238; 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