FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1948.ptfa, 463 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768554 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9638+/-0.00465; mu= 11.7992+/- 0.311
 mean_var=128.5173+/-32.670, 0's: 0 Z-trim: 64  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1131

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mKIAA0961  ( 486 res)   mph04182                   ( 486) 2238  377 1.6e-105
mKIAA1559  ( 504 res)   mbp01052                   ( 504) 2111  356 2.9e-99
mKIAA1611  ( 558 res)   mph00982                   ( 558) 1574  269 7.4e-73
mKIAA1431  ( 833 res)   mfj27243                   ( 833) 1519  260 4.7e-70
mKIAA1852  ( 736 res)   mej02019                   ( 736) 1471  252   1e-67
mKIAA0326  ( 885 res)   mib10041                   ( 885) 1443  248 2.6e-66
mKIAA0628  ( 508 res)   msj08164                   ( 508) 1427  245 1.2e-65
mKIAA4236  ( 919 res)   mfj05191                   ( 919) 1407  242 1.6e-64
mKIAA4196  ( 437 res)   mfj00049                   ( 437) 1403  241 1.6e-64
mKIAA1710  ( 461 res)   mbg19468                   ( 461) 1397  240 3.3e-64
mKIAA1396  ( 481 res)   mfj16154                   ( 481) 1280  221 1.9e-58
mKIAA3006  ( 617 res)   mbg05721                   ( 617) 1278  220 2.8e-58
mKIAA1588  ( 617 res)   mbp00262                   ( 617) 1260  217 2.1e-57
mKIAA4218  ( 601 res)   mpm12334                   ( 601) 1248  216 8.1e-57
mKIAA4229  ( 450 res)   mfj48069                   ( 450) 1114  193 2.6e-50
mKIAA4205  ( 653 res)   mfj21207                   ( 653) 1052  184 3.6e-47
mKIAA4237  ( 519 res)   mfj17080                   ( 519) 1020  178 1.2e-45
mKIAA1954  ( 643 res)   mpj01436                   ( 643) 1002  175   1e-44
mKIAA1874  ( 435 res)   mbg02924                   ( 435)  953  167 2.1e-42
mKIAA1015  ( 831 res)   mbh00453                   ( 831)  899  159 1.4e-39
mKIAA1141  ( 886 res)   mef00011                   ( 886)  852  151 2.9e-37
mKIAA4222  ( 543 res)   mkg04188                   ( 543)  804  143   5e-35
mFLJ00187  ( 488 res)   mbg06919                   ( 488)  747  134   3e-32
mKIAA0441  ( 699 res)   mbp07087                   ( 699)  719  129 8.6e-31
mKIAA0924  ( 617 res)   mbp20088                   ( 617)  647  117 2.8e-27
mKIAA0426  ( 508 res)   mpm11025                   ( 508)  632  115 1.4e-26
mKIAA0478  ( 1234 res)   mib07095                  (1234)  558  103 9.7e-23
mKIAA1703  ( 891 res)   mfj09089                   ( 891)  540  100 6.2e-22
mKIAA0236  ( 1852 res)   mbg02771                  (1852)  486   92 4.2e-19
mKIAA1020  ( 642 res)   mpm09294                   ( 642)  449   85 1.5e-17
mKIAA0287  ( 1618 res)   mbg03130                  (1618)  404   78 4.1e-15
mKIAA4234  ( 105 res)   mph00083                   ( 105)  388   74 5.4e-15
mKIAA3011  ( 496 res)   mph01327                   ( 496)  364   71   2e-13
mFLJ00416  ( 522 res)   msj08249                   ( 522)  362   71 2.5e-13
mKIAA1388  ( 523 res)   mbg09616                   ( 523)  324   65 1.9e-11
mKIAA0760  ( 1400 res)   mbg03730                  (1400)  328   66 2.1e-11
mFLJ00107  ( 1371 res)   mfj24090                  (1371)  324   65 3.2e-11
mKIAA0296  ( 1541 res)   mpf00724                  (1541)  318   64 6.8e-11
mKIAA4227  ( 539 res)   mng13251                   ( 539)  303   61   2e-10
mKIAA1951  ( 392 res)   mid22012                   ( 392)  299   60 2.7e-10
mKIAA1084  ( 1013 res)   mpf00327                  (1013)  291   60 1.1e-09
mKIAA1803  ( 705 res)   mfj24209                   ( 705)  274   57 6.3e-09
mKIAA0414  ( 491 res)   mbg10164                   ( 491)  271   56 7.3e-09
mKIAA1572  ( 463 res)   mfj40003                   ( 463)  270   56 7.9e-09
mKIAA0048  ( 622 res)   mid07066                   ( 622)  267   55 1.3e-08
mKIAA0352  ( 686 res)   meh01314                   ( 686)  255   54 5.4e-08
mKIAA0198  ( 506 res)   mpm05258                   ( 506)  253   53 5.7e-08
mKIAA0569  ( 1248 res)   mbg07960                  (1248)  248   53 1.7e-07
mKIAA1993  ( 527 res)   meh02016                   ( 527)  238   51 3.2e-07
mKIAA1675  ( 707 res)   mia50030                   ( 707)  230   49 9.2e-07


>>mKIAA0961  ( 486 res)   mph04182                        (486 aa)
 initn: 4882 init1: 2128 opt: 2238  Z-score: 1986.7  bits: 377.0 E(): 1.6e-105
Smith-Waterman score: 2238;  68.293% identity (68.750% ungapped) in 451 aa overlap (11-459:34-483)

                                   10        20        30        40
mKIAA1                     TMGDPGRTNSETKDETNQVFSENGIYEMNLSQWKIMERIG
                                     :..  .: .. :.. ::.::: :.:: :: 
mKIAA0 SKPDVITLLEQGKEPWMIVRAEKRRWSRDLESRYSSNGLLPEKNTYEINLSPWEIMGRIQ
            10        20        30        40        50        60   

               50        60        70         80         90        
mKIAA1 NSGLKSLLLKNGWESRRKQERQEDPQEGYLSQV-RHTSERVSSYEKR-ALTTRQRIHFVE
         : ..  : . .: .  .: ::. .. :. .: . :: .   :.:: ...  :.    :
mKIAA0 RRGPEDSPLGKDFEYKIFEE-QENSHRVYFRHVIKTTSGKRPPYRKRTSVSLYQKTPNGE
            70        80         90       100       110       120  

      100       110       120       130       140       150        
mKIAA1 KPYECNECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYE
       :::::.::::::.::::::::.::::::::::::::: :::: :::.::::.:...::::
mKIAA0 KPYECGECGKAFKVRQQLTFHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQCAHLNRHQRIHASDKLYE
            130       140       150       160       170       180  

      160       170       180       190       200       210        
mKIAA1 CKECGQAFIYGPELRAHQKLHTGEKPYTCRECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCQEC
       ::.:.. :  . .::.::. :.::::: :.:::::::::::: ::::::::::::.: ::
mKIAA0 CKKCAKIFTCSSDLRGHQRSHVGEKPYDCKECGKAFRVRGQLMLHQRIHTGEKPYACTEC
            190       200       210       220       230       240  

      220       230       240       250       260       270        
mKIAA1 GKAFRQLAHLTRHQKLNVVDRLYECKECGKDFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKDCGKAF
       ::.:::.:::::::.::  .  .::::::. :::..:::.:::::::::::.::.:::::
mKIAA0 GKSFRQVAHLTRHQRLNSGSSRHECKECGRAFLCSTGLRLHHKLHTGEKPYDCKECGKAF
            250       260       270       280       290       300  

      280       290       300       310       320       330        
mKIAA1 RVRQQLTLHQRSHTGEKPYECTECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYS
       :::::::::.: ::::::..: :::::::::::: ::.:::::::::::::: : : :::
mKIAA0 RVRQQLTLHERIHTGEKPFDCKECGKTFSRGYHLTLHQRIHTGEKPYECKECRKFFRRYS
            310       320       330       340       350       360  

      340       350       360       370       380       390        
mKIAA1 QLISHQSIHIGVKPYDCKDCGKAFRLLSQLTQHQSVHAGEKPYSCKECGKSFRLRQKLAL
       .:::::.:::: ::::::.:::::::.::::::::.: :::::.: :: :.::: ..:. 
mKIAA0 ELISHQGIHIGEKPYDCKECGKAFRLFSQLTQHQSIHFGEKPYKCMECEKTFRLLSQLTQ
            370       380       390       400       410       420  

      400       410       420       430       440       450        
mKIAA1 HQSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKV
       ::::::::::..:::: :::::.:::::: :::::::::.: :::::::::::::.: ..
mKIAA0 HQSIHTGEKPYDCKECGKAFRLHSSLIQHQRIHSGEKPYKCTECKKAFRQHSHLTYHQRI
            430       440       450       460       470       480  

      460   
mKIAA1 HTVKV
       :    
mKIAA0 HKNL 
            

>>mKIAA1559  ( 504 res)   mbp01052                        (504 aa)
 initn: 2092 init1: 2092 opt: 2111  Z-score: 1874.5  bits: 356.3 E(): 2.9e-99
Smith-Waterman score: 2111;  64.080% identity (64.365% ungapped) in 451 aa overlap (11-460:53-502)

                                   10        20        30        40
mKIAA1                     TMGDPGRTNSETKDETNQVFSENGIYEMNLSQWKIMERIG
                                     :.. .:.   :..:: :.   ::...:.: 
mKIAA1 EEWEFLDPAQKNLYRDVMWETYSNFISLDLESRFKTDTSSSDKGICEVYSLQWELIEKIK
             30        40        50        60        70        80  

               50        60        70        80         90         
mKIAA1 NSGLKSLLLKNGWESRRKQERQEDPQEGYLSQVRHTSERVSSYEKRA-LTTRQRIHFVEK
       : . ..  :..  : ..:   :..:::::..:.. :::.:. :::.. :.  ::..  ::
mKIAA1 NLSPQGSGLSDDQECKHKTGLQKEPQEGYFGQLKITSEKVT-YEKHSFLSEYQRVQNEEK
             90       100       110       120        130       140 

     100       110       120       130       140       150         
mKIAA1 PYECNECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYEC
        :::.:: :.:  :. :. : :::::::::.:::::. ::: ::: ::..::.::: :::
mKIAA1 FYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQPFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYEC
             150       160       170       180       190       200 

     160       170       180       190       200       210         
mKIAA1 KECGQAFIYGPELRAHQKLHTGEKPYTCRECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCQECG
       :.::.::    ::  ::.:::::::: :.::::::::. ::. ::::::::::: :.:::
mKIAA1 KDCGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKECG
             210       220       230       240       250       260 

     220       230       240       250       260       270         
mKIAA1 KAFRQLAHLTRHQKLNVVDRLYECKECGKDFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKDCGKAFR
       :.::: .::::::.:.. ..::::::::: :.::  ::::.:.: ::::: ::::::.::
mKIAA1 KTFRQCTHLTRHQRLHTSEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYACKDCGKSFR
             270       280       290       300       310       320 

     280       290       300       310       320       330         
mKIAA1 VRQQLTLHQRSHTGEKPYECTECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQ
       . ::::.::  ::::::::: ::::::    .:. :.:::: :.:::: ::::.:: :::
mKIAA1 ICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTHERPYECLECWKTFSSYSQ
             330       340       350       360       370       380 

     340       350       360       370       380       390         
mKIAA1 LISHQSIHIGVKPYDCKDCGKAFRLLSQLTQHQSVHAGEKPYSCKECGKSFRLRQKLALH
       ::::::::.: .::.:..::::::::::::::::.:.::::: :.:: : ::: ..:. :
mKIAA1 LISHQSIHVGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECQECRKPFRLLSQLTQH
             390       400       410       420       430       440 

     400       410       420       430       440       450         
mKIAA1 QSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKVH
       .::::::::.:::.: ::::: : : :: :::.:::::.:::::::::::::::.: :.:
mKIAA1 RSIHTGEKPYECKDCGKAFRLYSFLSQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIH
             450       460       470       480       490       500 

     460   
mKIAA1 TVKV
       .   
mKIAA1 SGT 
           

>>mKIAA1611  ( 558 res)   mph00982                        (558 aa)
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mKIAA1 SRRKQERQEDPQEGYLSQVRHTSERVSSYEKRALTTRQRIHFVEKPYECNECGKAFRVRQ
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mKIAA1 QLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGQAFIYGPELRA
       .::.:.: :::::::.:.::: .: . ..:. :: .:.::: :.:.:::..:  . .:  
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       : ..::::::: : :::::: : ..:: :: :::::::: :.::::.: : .::. :. .
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       .  .. :.:.:::: :   :.:  : ..:::::::.:..::::: ::..:  ::  ::::
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       :::.::::::.::.   : .:.:::::::::.:.:: :::. .:.: .:: :: : ::: 
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       : .:::.:   :.:..:: .:.:::::.:.::::.: . ..:. ::.:::::::..:.::
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mKIAA1 RKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKVHTVKV           
        :.:  :: : .: : :.:::::.:..: :::  .: :: :  .::              
mKIAA1 GKVFTQNSHLASHRRTHTGEKPYQCNKCDKAFSVRSSLTTHQAIHTGEKPYTCSECGKVF
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mKIAA1 SRSSNLTSHQRLHVGQK
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 initn: 3598 init1: 1420 opt: 1519  Z-score: 1350.1  bits: 259.9 E(): 4.7e-70
Smith-Waterman score: 1548;  55.291% identity (55.438% ungapped) in 378 aa overlap (84-460:396-773)

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mKIAA1 QQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRL-HSGEKLYECKECGQAFIYGPEL
       .... :.: :::.::::: ::: :: :.. :.:: :  :.::: ..: .::.::     :
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         :...:::::::::. : :.::  ..::.::::::::::: :. : ::: . : ::.::
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       ...  .. ..:::::: :  .  :  : ..::::::.:: .:::.: . .::. ::: ::
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       :::::::  : :.:..  ::  :.. :::::::::::: ::::. ..::.:: .: : ::
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mKIAA1 YDCKDCGKAFRLLSQLTQHQSVHAGEKPYSCKECGKSFRLRQKLALHQSIHTGEKPFECK
       : : .:::::   :. :::. .:.:..:: : ::::.:. ...:  :.  ::::::.::.
mKIAA1 YKCLECGKAFGDNSSCTQHRRLHTGQRPYECVECGKTFKTKSSLICHRRCHTGEKPYECS
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mKIAA1 ECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKVHTVKV         
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mKIAA1 AFRQTAHFAHHQQIHSGKSPAHHSLPSTSNPVDLFSKFVWNPSSLPSS
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>>mKIAA1852  ( 736 res)   mej02019                        (736 aa)
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        :.: ::: :::::..:: ::  ..::  : :.:.::: : :.:::..: .. .: .::.
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mKIAA1 LHTGEKPYTCRECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCQECGKAFRQLAHLTRHQKLNVV
        ::::::. : ::::.:   ..:  :.:.::::::. :.:: ::::. . :..:.. .  
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mKIAA1 DRLYECKECGKDFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKDCGKAFRVRQQLTLHQRSHTGEKPY
        . :.: ::::.:  .: : .:.. :::::::.:..:::::: :. :: :.  :.: :::
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       ::..:::. :.  ::. :.: :::::::::..: :.::.  .:..:. :: : ::: :..
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       : ..:   :.:  :. .:.::::: :.::::.:   ..: .:   ::::::..:..:.::
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       :  ::::: : :.::::: . :..: .::  :: : .: : :.    
mKIAA1 FCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICNQCGRAFSGHSALLQHQKNHSEEKL
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mKIAA1 FVEKPYECNECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEK
        .:::: ::::::.:   ..:  :.::::::.:  :.::: .: :..::..::: :.:::
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mKIAA1 LYECKECGQAFIYGPELRAHQKLHTGEKPYTCRECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVC
        :.: .::. : .. .:  ::. ::::::: : :: :::    .:  ::: ::::::: :
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mKIAA1 QECGKAFRQLAHLTRHQKLNVVDRLYECKECGKDFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKDCG
        :: .:: . . : .::  .. .. :.: :::: :  . .:  :.:.:.:::::.: .::
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mKIAA1 KAFRVRQQLTLHQRSHTGEKPYECTECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFS
       :.:   ..:: :::.::::::::: ::::.:...  :: :.: :  : :..:  : :.:.
mKIAA0 KSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFT
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         . :. ::  : : .:: : .:::.: . :.: .:: .: ::.:: : .::::: . . 
mKIAA0 LSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSST
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mKIAA1 LALHQSIHTGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHH
       :  :: :::::::..:..: :.:  .: :::: : :.:::::.: :: :.: : :.:  :
mKIAA0 LIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITH
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       ...:                                                        
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