# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mph00578.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1948.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1948, 463 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7893150 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7581+/-0.000185; mu= 10.7950+/- 0.010 mean_var=76.1373+/-14.515, 0's: 38 Z-trim: 234 B-trim: 14 in 1/65 Lambda= 0.146986 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81911355|sp|Q6P9Y7.1|ZFP82_MOUSE RecName: Full= ( 530) 3226 694.2 2e-197 gi|148692099|gb|EDL24046.1| zinc finger protein 82 (1357) 3216 692.5 1.7e-196 gi|149056371|gb|EDM07802.1| rCG54648 [Rattus norve ( 987) 2988 644.0 4.9e-182 gi|74762511|sp|Q8N141.1|ZFP82_HUMAN RecName: Full= ( 532) 2849 614.3 2.4e-173 gi|109124516|ref|XP_001112876.1| PREDICTED: simila ( 574) 2836 611.5 1.7e-172 gi|22760718|dbj|BAC11308.1| unnamed protein produc ( 532) 2835 611.3 1.9e-172 gi|194215358|ref|XP_001494637.2| PREDICTED: simila (1539) 2827 610.1 1.3e-171 gi|194675164|ref|XP_001788291.1| PREDICTED: simila ( 548) 2822 608.6 1.3e-171 gi|73947801|ref|XP_867605.1| PREDICTED: similar to ( 745) 2615 564.8 2.6e-158 gi|73947799|ref|XP_867596.1| PREDICTED: similar to (1751) 2485 537.6 9.4e-150 gi|154425583|gb|AAI51290.1| LOC100124429 protein [ ( 534) 2390 516.9 4.8e-144 gi|194215367|ref|XP_001493771.2| PREDICTED: simila ( 592) 2382 515.3 1.7e-143 gi|73947797|ref|XP_867586.1| PREDICTED: similar to ( 939) 2383 515.7 2e-143 gi|6686181|sp|Q9Y2G7.1|ZFP30_HUMAN RecName: Full=Z ( 519) 2270 491.5 2.1e-136 gi|114676933|ref|XP_001165552.1| PREDICTED: zinc f ( 518) 2268 491.1 2.9e-136 gi|114676931|ref|XP_001165619.1| PREDICTED: zinc f ( 519) 2268 491.1 2.9e-136 gi|75073966|sp|Q9BE27.1|ZFP30_MACFA RecName: Full= ( 519) 2254 488.1 2.2e-135 gi|148692112|gb|EDL24059.1| zinc finger protein 30 ( 486) 2252 487.6 2.9e-135 gi|148692113|gb|EDL24060.1| zinc finger protein 30 ( 548) 2252 487.7 3.1e-135 gi|66773972|sp|Q60585.2|ZFP30_MOUSE RecName: Full= ( 533) 2251 487.5 3.6e-135 gi|456269|emb|CAA82913.1| zinc finger protein 30 [ ( 548) 2251 487.5 3.6e-135 gi|73947805|ref|XP_867624.1| PREDICTED: similar to (1980) 2241 485.9 3.9e-134 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2241 486.1 5e-134 gi|149056388|gb|EDM07819.1| rCG54037 [Rattus norve ( 548) 2219 480.7 4e-133 gi|194675168|ref|XP_001790692.1| PREDICTED: simila ( 621) 2199 476.5 8.3e-132 gi|73947795|ref|XP_853558.1| PREDICTED: similar to (1186) 2195 475.9 2.3e-131 gi|20140808|sp|Q9HCL3.2|ZFP14_HUMAN RecName: Full= ( 533) 2187 473.9 4.3e-131 gi|158259667|dbj|BAF85792.1| unnamed protein produ ( 533) 2186 473.7 5e-131 gi|114677086|ref|XP_512623.2| PREDICTED: zinc fing ( 660) 2184 473.3 7.8e-131 gi|85681855|sp|P10755.2|ZFP14_MOUSE RecName: Full= ( 501) 2110 457.5 3.4e-126 gi|118764097|gb|AAI28773.1| LOC499124 protein [Rat ( 501) 2024 439.3 1.1e-120 gi|26337507|dbj|BAC32439.1| unnamed protein produc ( 457) 1875 407.7 3.2e-111 gi|205831220|sp|A2VDQ7.1|ZN420_BOVIN RecName: Full ( 687) 1799 391.7 3e-106 gi|149722053|ref|XP_001494018.1| PREDICTED: zinc f ( 688) 1752 381.8 3e-103 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 1750 381.5 5.7e-103 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 1750 381.6 6.1e-103 gi|71153480|sp|Q8TAQ5.1|ZN420_HUMAN RecName: Full= ( 688) 1744 380.1 9.8e-103 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 1742 379.9 2e-102 gi|33417243|gb|AAH55817.1| Zfp420 protein [Mus mus ( 578) 1738 378.7 2.1e-102 gi|126324551|ref|XP_001367025.1| PREDICTED: simila ( 849) 1739 379.1 2.4e-102 gi|26337635|dbj|BAC32503.1| unnamed protein produc ( 578) 1733 377.6 4.4e-102 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 1731 377.6 1e-101 gi|109461612|ref|XP_001078762.1| PREDICTED: simila (1321) 1716 374.4 9.5e-101 gi|109458488|ref|XP_574414.2| PREDICTED: similar t (1396) 1716 374.4 9.9e-101 gi|194386410|dbj|BAG59769.1| unnamed protein produ ( 434) 1707 372.0 1.6e-100 gi|126324559|ref|XP_001368136.1| PREDICTED: simila ( 762) 1709 372.7 1.8e-100 gi|194215442|ref|XP_001497806.2| PREDICTED: zinc f ( 849) 1708 372.5 2.3e-100 gi|73946821|ref|XP_862028.1| PREDICTED: similar to ( 930) 1705 371.9 3.8e-100 gi|73946823|ref|XP_862054.1| PREDICTED: similar to (1014) 1705 372.0 4e-100 gi|126324549|ref|XP_001366977.1| PREDICTED: hypoth ( 745) 1703 371.4 4.3e-100 >>gi|81911355|sp|Q6P9Y7.1|ZFP82_MOUSE RecName: Full=Zinc (530 aa) initn: 3226 init1: 3226 opt: 3226 Z-score: 3700.6 bits: 694.2 E(): 2e-197 Smith-Waterman score: 3226; 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