FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0778.ptfa, 1022 aa vs ./tmplib.26680 library 1767995 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2061+/-0.00374; mu= 20.5739+/- 0.250 mean_var=88.6843+/-20.138, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1362 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4139 ( 1059 res) mfj21022 (1059) 5623 1116 0 mKIAA0703 ( 810 res) mbp06179 ( 810) 512 112 4.8e-25 mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 ( 915) 512 112 5.2e-25 mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061) 455 100 1.3e-21 mKIAA1825 ( 1100 res) mfj34163 (1100) 157 42 0.00057 mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093) 148 40 0.0019 >>mKIAA4139 ( 1059 res) mfj21022 (1059 aa) initn: 2911 init1: 2911 opt: 5623 Z-score: 5968.0 bits: 1115.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 5769; 85.547% identity (86.905% ungapped) in 1024 aa overlap (14-1022:37-1059) 10 20 30 40 mKIAA0 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:..:::::.:::::::: :::.:::::::: .:.::::.::.:::.::. mKIAA0 PKHKVKIIKALQESGAIVAMTGDGVNDSVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEAANMILVDDD 570 580 590 600 610 620 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 FASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGT :..:...::::. :: :.:. . . :...: .. . : . :.: ::... :: ... mKIAA0 FSAIMSAVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSIAALSLITLSTVCNLPSPLNAMQILWVNIIM 630 640 650 660 670 680 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 DMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGG-FFTYFVIL : :: ::. : .. : ..: :: : : ..:. :: . . ..: .:: .: .. . mKIAA0 DGPPAQSLGVEPVDRDALRRPPR-SVGDTILNRALILRVLMSAAVI--IGGTLFIFWREI 690 700 710 720 730 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 AENGFLPSRLLGIRLDWDDRTTNDLEDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWAD :: mKIAA0 PANGTSTPRTTTMAFTCFVFFDLFNALSCRSQTKLIFEIGFFRNRMFLYSVLGSLLGQLA 740 750 760 770 780 790 >>mKIAA1347 ( 915 res) mtj01524 (915 aa) initn: 1121 init1: 475 opt: 512 Z-score: 541.4 bits: 111.6 E(): 5.2e-25 Smith-Waterman score: 1299; 32.586% identity (36.078% ungapped) in 847 aa overlap 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:.::::.::. . .:.. . .. :. .::. .. . . .. . ..:. ..: . mKIAA1 GKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLV-G 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 LILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGST .:: . :: . ... :: .:::: .::: :.: . ::..: .::.: ::::: mKIAA1 WLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCC 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 STICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALSRIAGLCNR ..::::::::::.:.:::.:. .. .: :..: :. ... . . . . . :. : mKIAA1 NVICSDKTGTLTKNEMTVTHILTSDGLH-AEVT----GVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNP 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 mKIAA0 AVFK---AGQE-NISVSKRDT-AGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNST :: . :: : .: . .: : .:.::. . .. : ..: : :: ::.: mKIAA1 AVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIA-LAMKMGLDGLQQDYIRK-AEYPFSSE 400 410 420 430 440 450 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 NKYQL--SIHE-REDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYM .:.. .:. ..: :. . :::: :... :.: .:. . : ....: .:. mKIAA1 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