FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00044.ptfa, 733 aa vs ./tmplib.26680 library 1768284 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4259+/-0.00386; mu= 18.4545+/- 0.259 mean_var=77.0152+/-17.559, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 3 in 1/35 Lambda= 0.1461 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1511 ( 1207 res) mbg03448 (1207) 3233 692 1.1e-199 mKIAA1577 ( 827 res) mbh02526 ( 827) 1872 405 2.1e-113 >>mKIAA1511 ( 1207 res) mbg03448 (1207 aa) initn: 1990 init1: 1516 opt: 3233 Z-score: 3677.2 bits: 691.7 E(): 1.1e-199 Smith-Waterman score: 3233; 65.629% identity (66.804% ungapped) in 739 aa overlap (1-733:476-1207) 10 20 30 mFLJ00 EEGNYSLDIPNLQPALTSRTGSEDEEEVTA :.:::. ..::. :: :...:.. . .. mKIAA1 IILNPHCKLEEKSCWLQQLQKWSDLDICPLEDGNYGHELPNITNAL-SQSASHSPDSLS- 450 460 470 480 490 500 40 50 60 70 80 mFLJ00 ASPRRTVFSRALQAGELHWNDSHLQRILASD-SCGPTLTGSMGSDKPTFDPQGHPIWLGE ::::::.::... ::::.:::::::..: .:. ... :. .:.:.:: : mKIAA1 -RPRRTVFTRAIEGRELHWQDSHLQRIISSGIYTAPACQRE--NERLLFNSHGQPLWL-E 510 520 530 540 550 90 100 110 120 130 140 mFLJ00 PFPTACARVDTLRAHGYPHKALRLACAIINTLRLQRRHQLESYKQQKKELLQKGATGVTS ::::::::.::.::::..::::. :::::::::...::: ::.:::::::.:.: .:. mKIAA1 HVPTACARVDALRSHGYPKEALRLTVAIINTLRLQQQRQLEIYKHQKKELLQRGTTTITN 560 570 580 590 600 610 150 160 170 180 190 200 mFLJ00 TEGWVGHPLDPIGCLCRALLEACRLEEEPHSLFPDSAPEKRKLAYQHVLVP-GSPG--ES :::::::::::::: .: :::::... . . : :.: .:::: : : :. :: mKIAA1 LEGWVGHPLDPIGCLFLTLTEACRLNDDSYMEMSDMN-ESRLPVYQHVPVASGCPNSNES 620 630 640 650 660 670 210 220 230 240 250 260 mFLJ00 YLALALEVALLGLGQQRALPEGLYAQDKVVRNEEQLLALLEEVELDERLVQVLRKQAGLL ::.:::::::.:.::::..:::::::::: :::::::. :.:..::..:::.:::: :: mKIAA1 YLSLALEVALMGMGQQRVMPEGLYAQDKVCRNEEQLLSQLQELQLDDELVQTLRKQCILL 680 690 700 710 720 730 270 280 290 300 310 320 mFLJ00 LEGGPFSGFGEVIFRESVPMHTCARYLFTALLPHDPDLAFRLALRAMRLPVLETTFPAGE ::::::::.:::: :::::::: :.:::.:::::::::...::::::::::::.. ::. mKIAA1 LEGGPFSGLGEVIHRESVPMHTFAKYLFSALLPHDPDLSYKLALRAMRLPVLENSSSAGD 740 750 760 770 780 790 330 340 350 360 370 380 mFLJ00 -SHPNPLDSIMSNRFPRWFILGHLETRQCELASTMLTAAKGDTKWLHAVLGSVQQNIHSP :::. . :.. .:.:::: :::::..:::::::::::::::: :...: ..:..:::: mKIAA1 TSHPHHMVSVVPSRYPRWFTLGHLESQQCELASTMLTAAKGDTLRLRTLLEAIQKHIHSP 800 810 820 830 840 850 390 400 410 420 430 440 mFLJ00 ALLFKLAQDACKTATPASAPPDTVLLGIALELGLQVMRMTLNTMTWRRREMVRWLVSCAT .:.::::::: : :::... : .::..:::::::::::::.:..:::::::::::.::: mKIAA1 SLIFKLAQDAFKIATPTDSSTDGTLLNVALELGLQVMRMTLSTLNWRRREMVRWLVTCAT 860 870 880 890 900 910 450 460 470 480 490 500 mFLJ00 EIGPPALMSIMKNWYSLFTPVEAVTIVAVTGTTHATLLRLQLDTAGREELWACARTLALQ :.: ::.::...::.::::.::..:::.:...:.:.:::.:: :::: .:::::::: mKIAA1 EVGVRALVSILQSWYTLFTPTEATSIVAATAVSHTTILRLSLDYPQREELASCARTLALQ 920 930 940 950 960 970 510 520 530 540 550 560 mFLJ00 CAMKDPQNCALPALTLCEKNHAAFEAAYQIVLDAAAGGLGHAHLFTVARYMEHRGLPLRA :::::::.::: :::::::.: ::::::::..::::::. :..:::.::::: :: :::: mKIAA1 CAMKDPQSCALSALTLCEKDHIAFEAAYQIAIDAAAGGMTHSQLFTIARYMELRGYPLRA 980 990 1000 1010 1020 1030 570 580 590 600 610 620 mFLJ00 YKLATLALAQLSIAFNQDSHPAVNDVLWACSLSHSLGRHELSAIVPLIIRSIHCAPMLSD .:::.::...:..:.:::.:::.:::::::.::::::..::.:..::...:.::: .::: mKIAA1 FKLASLAMSHLNLAYNQDTHPAINDVLWACALSHSLGKNELAALIPLVVKSVHCATVLSD 1040 1050 1060 1070 1080 1090 630 640 650 660 670 680 mFLJ00 ILRRWTLSAPGLGPLGARRAT-KPLGTDRAPLCQLLDAAVAAYITTSHSRLTHISPRHYG :::: :..::::. . .::.. : ..::.::: :::::.. :::.:.::::::::::::: mKIAA1 ILRRCTVTAPGLAGIPGRRSSGKLMSTDKAPLRQLLDATINAYINTTHSRLTHISPRHYG 1100 1110 1120 1130 1140 1150 690 700 710 720 730 mFLJ00 DFIEFLGKARETFLLAPDGHLQFAQFLENLKQTYKGKKKLMLLVRERFG .:::::.:::::::: :::::::::..:::: :::::::::::::::: mKIAA1 EFIEFLSKARETFLLPQDGHLQFAQFIDNLKQIYKGKKKLMLLVRERFG 1160 1170 1180 1190 1200 >>mKIAA1577 ( 827 res) mbh02526 (827 aa) initn: 2043 init1: 1159 opt: 1872 Z-score: 2128.2 bits: 404.6 E(): 2.1e-113 Smith-Waterman score: 1978; 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