FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1387.ptfa, 865 aa vs ./tmplib.26680 library 1768152 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9494+/-0.00502; mu= 10.7153+/- 0.336 mean_var=126.8078+/-29.716, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1139 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA2010 ( 848 res) meh00005 ( 848) 2963 499 1.1e-141 >>mKIAA2010 ( 848 res) meh00005 (848 aa) initn: 3365 init1: 2022 opt: 2963 Z-score: 2636.1 bits: 498.8 E(): 1.1e-141 Smith-Waterman score: 4042; 73.778% identity (76.704% ungapped) in 839 aa overlap (37-861:19-839) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 PLQSRCHHRRCRHYRLSRVRDTGEVSEEVAAGTVGPEA-TMSDTRRRVKVYTLNEDRQWD : .:: : ::.:::::::::::::::::: mKIAA2 GPGVPRLRPPAFSGHCPWATRAGPPAGTMTDTRRRVKVYTLNEDRQWD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 DRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNTAYQKQQDTLIVWSEAENYDL ::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA2 DRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNTAYQKQQDTLIVWSEAENYDL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 ALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEERFEEMPETSHLIDLPACELS :::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::::..: .: ..::.:::: mKIAA2 ALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEERFDDM--SSPGLELPSCELS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 KLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQACENLENTEGLHHLYEIIRG .:::::.::.: : ::.:::::::::::::::::::.::..::.::: ::::::::::.: mKIAA2 RLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVCEDLENIEGLHHLYEIIKG 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 ILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHREFLTKTAKFKEVIPITDSELR :..::...:::::::.::::::.:::::::.:.::..:::::::::::::::::.: ::. mKIAA2 IFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPTLSQPRKHREFLTKTAKFKEVIPISDPELK 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 QKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKVEIVSMLQEDEKFLSEVFAQL ::::::::::::::..::::::::::.:::: :::::::::::.:::::::::...:::: mKIAA2 QKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEIVGMLQEDEKFLTDLFAQL 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 TDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLAKLGILPALEIVMGMDDLQVR ::::::..::.:::::.::::::::::::::::::::::...:::::::...:::: ::: mKIAA2 TDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNMGILPALEVILGMDDTQVR 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 SAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDVLLINVVIEQMICDTDPELGGAVQLMGL ::::::::::::..::::::::::::::.:::.::::..::.:::::::::::::::::: mKIAA2 SAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGL 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 LRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLTNTSEDKCEKDNMLGSNTTNT ::::.::::::::.:::::.:::.:::.:::::::::::.::.::: ::. mKIAA2 LRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEDKPSKDD--------- 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 ICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALR .::::::::.:::::::::::::::::::.:::.:::::::: :::.:::::::: mKIAA2 -----FQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALR 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 FMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLT : :.::::::::::::: :. :::::..:.:.::.::::.:::.::.::::::::::::: mKIAA2 FKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLT 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 AHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQ-NQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEE ::..::..::::...::::::::: ..::...:: : ::.:. ::::..:.::::..::. mKIAA2 AHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLED 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 DEEMWFN--EDDDEEGKAVITPVEKSKTEDDFPDSYEKFMETKKAKESEDKENLPKRASS .:::::: ::: :.:.::..: .:.:..::. : :::: :: ::::.:: : : : mKIAA2 EEEMWFNTDEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLS 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 mKIAA1 G----GFKFTFSHSPSATNGTNSTNSKSVV----SQTTPASSNVASS--KTTSLATSVTA : .::...: : . :: :..... :. : .:.: . .: :.:: ....: mKIAA2 GRQSPSFKLSLS-SGTKTNLTSQSSATSLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKSTSQTAAIT- 760 770 780 790 800 810 840 850 860 mKIAA1 TKGNLVGLVDYPDDEEEDEEEESSPRKRPRLGS :::.::::::::::.:.:.:.:.. : mKIAA2 TKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPVSKKAKFES 820 830 840 865 residues in 1 query sequences 1768152 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:43:13 2006 done: Mon Mar 27 10:43:14 2006 Scan time: 0.920 Display time: 0.080 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]