FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0224.ptfa, 1224 aa vs ./tmplib.26680 library 1767793 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4414+/-0.00662; mu= 5.9095+/- 0.440 mean_var=241.0433+/-58.194, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0826 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 2486 311 1e-84 mKIAA0134 ( 1167 res) mbh02208 (1167) 858 117 2.5e-26 mKIAA0577 ( 1048 res) mbg07362a (1048) 840 114 1e-25 mKIAA1517 ( 937 res) mbp07073 ( 937) 537 78 7.2e-15 mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 ( 425) 510 75 4.1e-14 mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417) 513 76 6.8e-14 mKIAA0890 ( 1057 res) mbg06494 (1057) 426 65 7.5e-11 mFLJ00419 ( 729 res) msh04045 ( 729) 211 39 0.0031 >>mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264 aa) initn: 2472 init1: 1021 opt: 2486 Z-score: 1613.2 bits: 310.6 E(): 1e-84 Smith-Waterman score: 2601; 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