FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0751.ptfa, 1297 aa vs ./tmplib.26680 library 1767720 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6204+/-0.00722; mu= 1.9131+/- 0.480 mean_var=285.8544+/-67.407, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0759 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0340 ( 983 res) mbg15521 ( 983) 2743 315 5.5e-86 mKIAA0237 ( 263 res) mbg11214 ( 263) 1255 151 2.4e-37 mKIAA0559 ( 1592 res) mbg01260 (1592) 255 43 0.00069 >>mKIAA0340 ( 983 res) mbg15521 (983 aa) initn: 2821 init1: 1743 opt: 2743 Z-score: 1636.1 bits: 314.6 E(): 5.5e-86 Smith-Waterman score: 3295; 56.760% identity (63.657% ungapped) in 969 aa overlap (1-958:92-966) 10 20 mKIAA0 RKRSPSVSRDQNRRYEQSEEREDYSQYV-- ::..:..: .:: . :. ::. . : mKIAA0 DRNKGAEPSQQALGPEQKQASRSRSEPPRERKKAPGLS-EQNGKGGQKSERKRVPKSVVQ 70 80 90 100 110 120 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 PSDGTMPRSPSDYADRRSQREPQFYEEPGHLNYRDSNRRGHRHSKEYIVDDEDVESRDEY :..:: .: .:. .:: . :. .: : : ... ...:: mKIAA0 PGEGT-----ADERERKERRETRRLEKGRSQDYPD---RLEKREDGRVAEDE-------- 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 ERQRREEEYQARYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANAELED .::.:::::.:::::::::::::: :.:::.::.:::::::::::::.: ..: mKIAA0 -KQRKEEEYQTRYRSDPNLARYPVKAPLEEQQMRMHARVSRARHERRHSDVALPHTEAAA 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 SRISLLRMDRPSRQRSVSERRAAMENQRSYSMERTREAQGQSSYPQRTSNHSPPTPRRSP . : . ....: :. . : : : :.. .. : ..:.:: :: .: mKIAA0 AV---------SAETTAGKR--AQTTARVSPPESPR-ARAPAAQPP--AEHGPPPPRPAP 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 IPLDRPDMRRADSLRKQHHLDPSSAV--RKTKREKMETMLRNDSLSSDQSESVRPPPPRP : . :. : . :::: .:::.::: ::.:::: :.::::::::::::::::: ::.: mKIAA0 GPAEPPEPRVPEPLRKQGRLDPGSAVLLRKAKREKAESMLRNDSLSSDQSESVRPSPPKP 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 HKSKKGGKMRQVSLSSSEEELASTPEYTSCDDVELESESVSEKGDMEYSWLEQASWHSSE :. :.::: ::.:.:::::: .::::::::.::::::::::::::..: ::. :.::: : mKIAA0 HRPKRGGKRRQMSVSSSEEEGVSTPEYTSCEDVELESESVSEKGDLDY-WLDPATWHSRE 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ASPMSLHPVTWQPSKDGDRLIGRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMTESGRLCA .::.: :::::::::.:::::::..:::: ..:..:::.:::::::::::. ::: : mKIAA0 TSPISSHPVTWQPSKEGDRLIGRVILNKRT---TMPKESGALLGLKVVGGKMTDLGRLGA 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 FITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPI ::::::::::::.::::: :::::::::. : ::: ::::::::::: :::::..::::: mKIAA0 FITKVKKGSLADVVGHLRAGDEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPI 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 GDIPRIPDSTHAQLESSSSSFESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFD :::::::.:.: :::::::::::::.:::::: :: ::: :.:.:: : ::::.:::.: mKIAA0 GDIPRIPESSHPPLESSSSSFESQKMERPSISVISPTSPGALKDAPQVLPGQLSVKLWYD 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 KVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTF ::::::::..: : ::: : ::::::::::.:::::::::.::::::::: ::::::::: mKIAA0 KVGHQLIVNVLQATDLPPRVDGRPRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKLLEPKWNQTF 570 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 IYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDVS .:: ::::.:::::::::.::: ::..::::::::::::::::::::::::::::::: : mKIAA0 VYSHVHRRDFRERMLEITVWDQPRVQDEESEFLGEILIELETALLDDEPHWYKLQTHDES 630 640 650 660 670 680 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 SLPLPRPSPYLPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCEDGVGVVS--DYRHNGRDL :::::.:::..:::..:::: ...::::.:::::..:::. .::.::: :: ..:. mKIAA0 SLPLPQPSPFMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRASARES 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 QSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSAPPPQRNVEQGHRGTRATGHYN ...::.:::: ...: : : :::: : :: :: :..: ::.... : :: mKIAA0 KATTLTVPEQQRTTHHRSRSVSPHRGDDQGRPRSRLPNVPL-QRSLDEIH-PTR------ 750 760 770 780 790 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 TISRMDRHRVMDDHYSSDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLERTTTRSRSSERPDTNL : : :....:. :: :::: .: :. : .:: mKIAA0 ------RSRSPTRHHDASRS----LAD----HRSRHAE-----------SQYSSEPD--- 800 810 820 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 MRSMPSLMTGRSAPPSPALSRSHPRTGSVQTSPSSTPGTGRRGRQLPQLPPK-GTLERSA :.: . . .:. :..: .::::::::.: . :..:... mKIAA0 --------------------RTHRQGSPTQSPPADTSFGSRRGRQLPQVPVRSGSIEQAS 830 840 850 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 MDIEERNRQMKL--NKYKQV--AGSDPRLEQDYHSKYRSGWDPHRGADTVSTKSSDSDVS . .:::.::::. ...::. .::. .:... .::: : .:. :..:.:::::::: mKIAA0 LVVEERTRQMKMKVHRFKQTTGSGSSQELDHEQYSKYNIHKDQYRSCDNASAKSSDSDVS 870 880 890 900 910 920 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 DVSAVSRTSSASRFSSTSYMSVQSERPRGNRKISFSPLVQDHGAQTPVQPPLIPLGPDLN ::::.::.::.::.::::.:: ::::::: .:: :: mKIAA0 DVSAISRASSTSRLSSTSFMSEQSERPRG--RISSLTLVLLMMALPYKFVQKSRLF 930 940 950 960 970 980 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 VFTSKMQNRQMGVSGKNLTKSTSISGDMCSLEKNDGSQSDTAVGALGTSGKKRRSSIGAK >>mKIAA0237 ( 263 res) mbg11214 (263 aa) initn: 1253 init1: 917 opt: 1255 Z-score: 762.7 bits: 151.1 E(): 2.4e-37 Smith-Waterman score: 1255; 71.591% identity (71.863% ungapped) in 264 aa overlap (1032-1295:1-263) 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA0 SISGDMCSLEKNDGSQSDTAVGALGTSGKKRRSSIGAKMVAIVGLSRKSRSASQLSQTEG ::::.::::::::::.. :.:. :: : :: mKIAA0 RRSSLGAKMVAIVGLTQWSKSTLQLPQPEG 10 20 30 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 GGKKLRSTVQRSTETGLAVEMRNWMTRQASRESTDGSMNSYSSEGNLIFPGVRLASDSQF . :::::...::::::.:::::. .:::.:::::::: :: ::::..::: .::...::: mKIAA0 ATKKLRSNIRRSTETGIAVEMRSRVTRQGSRESTDGSTNSNSSEGTFIFP-TRLGAESQF 40 50 60 70 80 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 SDFLDGLGPAQLVGRQTLATPAMGDIQVGMMDKKGQLEVEIIRARGLVVKPGSKTLPAPY :::::::::::.::::::::: :::.....::..::::::.:.::::. :::::.::: : mKIAA0 SDFLDGLGPAQIVGRQTLATPPMGDVHIAIMDRSGQLEVEVIEARGLTPKPGSKSLPATY 90 100 110 120 130 140 1190 1200 1210 1220 1230 1240 mKIAA0 VKVYLLDNGVCIAKKKTKVARKTLEPLYQQLLSFEESPQGRVLQIIVWGDYGRMDHKSFM .:.:::.::.:.::::::::.:: .::::: : :.:.:::.:::.:::::::::::: :: mKIAA0 IKAYLLENGACVAKKKTKVAKKTCDPLYQQALLFDEGPQGKVLQVIVWGDYGRMDHKCFM 150 160 170 180 190 200 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA0 GVAQILLDELELSNMVIGWFKLFPPSSLVDPTLAPLTRRASQSSLESSTGPSYSRS :.:::.::::.:: : ::.:::: ::..: ::. :::: :::::::.:.:: : mKIAA0 GMAQIMLDELDLSAAVTGWYKLFPTSSVADSTLGSLTRRLSQSSLESATSPSCS 210 220 230 240 250 260 >>mKIAA0559 ( 1592 res) mbg01260 (1592 aa) initn: 385 init1: 158 opt: 255 Z-score: 162.1 bits: 42.6 E(): 0.00069 Smith-Waterman score: 464; 26.149% identity (32.155% ungapped) in 696 aa overlap (118-734:921-1565) 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 YERQRREEEYQARYRSDPNLARYPVKPQPYEEQMRIHAEVSRARHERRHSDVSLANAELE .: . .. ::.: : :.: . .. mKIAA0 KNITDQQKFMGSSLGSGLGTLGNTIRSALQDEADKPYSSGSRSRPSSRPSSVYGLDLSIK 900 910 920 930 940 950 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 -DSRISLLRMD-RPSRQRSVSERRAAMENQRSYSMERTREAQGQ-SSYPQRTSNHSPPTP :: : ::. . .. .:: ... . . . ...:. : . ..:: .: mKIAA0 RDSSSSSLRLKAQEAEALDVSFGHSSSSARTKPTSLPISQSRGRIPIVAQNSEEESPLSP 960 970 980 990 1000 1010 210 220 230 240 250 mKIAA0 RRSPIPLDR------PDMRRADSLRKQHHLDPSSAVRKTKREKMETMLRNDSLSSDQSES .:. . : : . ::. : : :: ...:. :. . . : . mKIAA0 VGQPMGMARAAAGPLPPIS-ADT-RDQFG---SSHSLPEVQQHMREESRTRGYDRDIAFI 1020 1030 1040 1050 1060 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 VRPPPPRPHKSKKGGKMRQVSLSSSEEELASTPEYTSCDDVELESESVSEKGDMEYSWLE . :. . : .::: . .: : : : . :: :.: : mKIAA0 MDDFQHAMSDSEVAVAMYDVSLVPKAYHLRR--EET--DWFDKPRESRLENGHGLDRKLP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 QASWHSSEASPMSLH--PVTWQPSKDGDRLI--GRILLNKRLKDGSVPRDSGAMLGLKVV . :: :.: : . . .: .. .:: ... :: .: :: ::...: mKIAA0 ERLVHSR---PLSQHQEQILQMNGKTMHYIFPHARIKITRDSKDHTV---SGNGLGIRIV 1130 1140 1150 1160 1170 380 390 400 410 420 mKIAA0 GGKMT--ESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEWNGRLLQGATFEEVYNII--- ::: .::.. :.:.:. :. :. :.: : .:::::: : . :.::: .:: mKIAA0 GGKEIPGHSGEIGAYIAKILPGGSAEHSGKLIEGMQVLEWNGIPLTSKTYEEVQSIINQQ 1180 1190 1200 1210 1220 1230 430 440 450 460 470 mKIAA0 --------------LESKPEPQ-VELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQL--ESSSSSFESQKM : .. .:: .:: . : . : :: : .. :.... . mKIAA0 SGEAEICVRLDLNMLSDSENPQHLELHEPPKVVDKAKSPGVDPKQLAAELQKVSLQQSPL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 480 490 mKIAA0 DRPSI-----------------SVTSPMSPG----------------MLRDVPQFLSGQL :. :: :: .:: . . . . ..:.. mKIAA0 VMSSVVEKGAHAHSGPTSAGSSSVPSPGQPGSPSVSKKKHGGSKPTDVSKTASHPITGEI 1300 1310 1320 1330 1340 1350 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 SIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYFLPDR---------SDKNKRR .... .: .:. ::. :: :..: :... .:.::.:.:: : : . ::: mKIAA0 QLQINYD-LGN-LIIHILQARNLVPRDNNGYSDPFVKVYLLPGRGQVMVVQNASVEYKRR 1360 1370 1380 1390 1400 1410 560 570 580 590 600 mKIAA0 TKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIELE-TA :: :.:.:.:.:::: ::. . ... .. ::.:.:: : ..::::.::.: :. mKIAA0 TKYVQKSLNPEWNQTVIYKSISMEQLMKKTLEVTVWDYDRFSS--NDFLGEVLIDLSSTS 1420 1430 1440 1450 1460 1470 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 LLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPRPSPYLPRRQLHGES-PTRRLQRSKRISDSEVSDYDCE ::. :.:: :: . . . ::.: .. :.: . : mKIAA0 HLDNTPRWY----------PLKEQTESIE----HGKSHSSQNSQQSPKPS---------- 1480 1490 1500 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 DGVGVVSDYRHNGRDLQSSTLSVPEQVMSSNHCSPSGSPHRVDVIGRTRSWSPSAPPPQR :... :. :. ..:: .. ..: ::..: . :. :: .:: . mKIAA0 ----VIKSRSHGIFPDPSKDMQVP--TIEKSHSSPGSSKSSSE--GHLRSHGPSRSQSKT 1510 1520 1530 1540 1550 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 NVEQGHRGTRATGHYNTISRMDRHRVMDDHYSSDRDRDCEAADRQPYHRSRSTEQRPLLE .: : : mKIAA0 SVAQTHLEDAGAAIAAAEAAVQQLRIQPSKRRK 1560 1570 1580 1590 1297 residues in 1 query sequences 1767720 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:27:53 2006 done: Mon Mar 27 10:27:54 2006 Scan time: 1.180 Display time: 0.210 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]