FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0990.ptfa, 821 aa vs ./tmplib.26680 library 1768196 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5172+/-0.00458; mu= 19.3901+/- 0.307 mean_var=97.9363+/-22.266, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1296 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4168 ( 887 res) mfj49300 ( 887) 3523 670 4.1e-193 mKIAA1402 ( 804 res) mbh03967 ( 804) 468 98 3.4e-21 >>mKIAA4168 ( 887 res) mfj49300 (887 aa) initn: 3626 init1: 2072 opt: 3523 Z-score: 3559.3 bits: 669.7 E(): 4.1e-193 Smith-Waterman score: 3542; 61.889% identity (69.476% ungapped) in 879 aa overlap (20-805:2-877) 10 20 30 40 50 mKIAA0 GRAEPAAGTAGQRPGGRRGAGMAARGRRAWLSMLLGLVLGFVLASRLVLPRASEL--KR- : ::.:.:: :.:. :::::::. :: :. ::..:: :: mKIAA4 AATMAVRSRRPWVSVALGLVLGFTAASWLIAPRVAELSEKRR 10 20 30 40 60 70 80 mKIAA0 -------------VGPR-----------RRP----SPEGCR---PG--QEASQPGGA--- .::: :: :: :: : . ::: mKIAA4 RGSSLCSYYGRSATGPRADAQQLLPQPQSRPRLEQSPPPASHELPGPQQPEAAPGGPSFR 50 60 70 80 90 100 90 100 mKIAA0 --------------RGDA-RGAQLWPQGSAAEGVPRDRN--------------------- :: . .:: : . ::.: :.... mKIAA4 SSPWQQPAPLPQRRRGHTPEGATALPGAPAAKGEPEEEDGGAADPRKGGRPGSSHNGSGD 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 mKIAA0 ------------FLFVGVMTAQKYLQTRAVAAYRTWSKTIPGKVEFFSSEGSDTSI---- ::.:::::::::: .::.:: :::.. :::.::::::. : .. mKIAA4 GGAAAPTSGPGDFLYVGVMTAQKYLGSRALAAQRTWARFIPGRVEFFSSQQSPSAALGQP 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 --PIPVVPLRGVDDSYPPQKKSFMMLKYMHDHYLDKYEWFMRADDDVYIKGDRLESFLRS :.::. : :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: :::: mKIAA4 PPPLPVIALPGVDDSYPPQKKSFMMIKYMHDHYLDKYEWFMRADDDVYIKGDKLEEFLRS 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 LNSSEPLFLGQTGLGTTEEMGKLALEPGENFCMGGPGVILSREVLRRMAPHIGKCLREMY ::::.::.:::::::.:::.:::.:::::::::::::.:.::::::::.::::.:::::: mKIAA4 LNSSKPLYLGQTGLGNTEELGKLGLEPGENFCMGGPGMIFSREVLRRMVPHIGECLREMY 290 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 TTHEDVEVGRCVRRFAGVQCVWSYEMQQLFYENYEQNKKGYIRDLHSSKIHRAITLHPNK :::::::::::::::.:.::::::::::::.::::.:.::::.:::.:::: :::::::: mKIAA4 TTHEDVEVGRCVRRFGGTQCVWSYEMQQLFHENYEHNRKGYIQDLHNSKIHAAITLHPNK 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 NPPYQYRLHSYMLSRKIAELRHRTIQLHREIVLMSKYSSTEIQKEDLQLGIPPSFMRFQA : ::::::.:::::::.:::.:::::::: .:::: :..:..::: ::: ::: .:: mKIAA4 RPAYQYRLHNYMLSRKISELRYRTIQLHRESALMSKLSNSEVSKEDQQLGRTPSFNHFQP 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 RQREEILEWEFLTGKYLYSATDGQPPRRGMDSAQREALDDIVMQVMEMINANAKTRGRII :.:.:..:::::::: ::::...::::....: : :::: :.::::::: :::.:::.: mKIAA4 RERNEVMEWEFLTGKLLYSAAENQPPRQSINSILRSALDDTVLQVMEMINENAKSRGRLI 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 DFKEIQYGYRRVNPMYGAEYILDLLLLYKKHKGKKMTVPVRRHAYLQQTFSKMQFVEHEE ::::::::::::.::.:.:::::::::::.:::.:.:::::::::::: ::: : : :: mKIAA4 DFKEIQYGYRRVDPMHGVEYILDLLLLYKRHKGRKLTVPVRRHAYLQQPFSKPFFREVEE 530 540 550 560 570 580 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 LDAQELADRINQDSGSLSFLSNSLKKLVAFQLPGSKTEHKEPKEKKINILIPLSGRFDMF ::...:.. ::. . :.: .::::: : ..: . :.: ::..::.:: ::.:.: mKIAA4 LDVNRLVESINSGTQSFSVISNSLKILSSLQEAKDIGGHNE---KKVHILVPLVGRYDIF 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 VRFMGNFEKTCLIPNLNVKLVILLFNSDSNPDKAKQVELMRDYRVKYPKADMQVLPVSGG .::: :::.:::::. ::::::.::. :.. .. :..::...:. .::.:.:...:..: mKIAA4 LRFMENFESTCLIPKQNVKLVIILFSRDAGQESIKHIELIQEYQSRYPSAEMMLIPMKGE 640 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 FSRALALEVGSSQFNNESLLFFCDVDLVFTAEFLQRCRANTVLGQQIYFPIIFSQYDPKI :::.:.::..::::.:..::.::::::.: ..:::::: ::: :::.:.::::::::::. mKIAA4 FSRGLGLEMASSQFDNDTLLLFCDVDLIFRGDFLQRCRDNTVQGQQVYYPIIFSQYDPKV 700 710 720 730 740 750 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 VYSGKVPSDNHFAFTQKTGFWRNYGFGITCIYKGDLVRVGGFDVSIQGWGLEDVDLFNKV .. . :... :.:...:::::.::.:::::::.::. .::::.::::::::::::.::: mKIAA4 THMRNPPTEGDFVFSKETGFWRDYGYGITCIYKSDLLGAGGFDTSIQGWGLEDVDLYNKV 760 770 780 790 800 810 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 VQAGLKTFRSQEVGVVHIHHPVVCDPNLDPKQYKMCLGSKASTFGSTQQLAEMWLEKNDP . .::. ::::::::::: ::: :::::::::::::::::::::.::.::::.::::. mKIAA4 ILSGLRPFRSQEVGVVHIFHPVHCDPNLDPKQYKMCLGSKASTFASTMQLAELWLEKHLG 820 830 840 850 860 870 810 820 mKIAA0 SYSKGGSHGSARTA mKIAA4 VRDNRTLS 880 >>mKIAA1402 ( 804 res) mbh03967 (804 aa) initn: 412 init1: 155 opt: 468 Z-score: 472.8 bits: 98.4 E(): 3.4e-21 Smith-Waterman score: 680; 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