FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1013.ptfa, 989 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768028 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1394+/-0.00467; mu= 7.1082+/- 0.308
 mean_var=185.1011+/-43.372, 0's: 0 Z-trim: 7  B-trim: 4 in 1/35
 Lambda= 0.0943

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mKIAA1294  ( 667 res)   mbg00518                   ( 667)  679  105   3e-23
mKIAA1548  ( 789 res)   mpm02067                   ( 789)  239   45 3.5e-05
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>>mKIAA1294  ( 667 res)   mbg00518                        (667 aa)
 initn: 609 init1: 338 opt: 679  Z-score: 509.7  bits: 105.2 E(): 3e-23
Smith-Waterman score: 1043;  35.714% identity (40.780% ungapped) in 644 aa overlap (362-931:1-638)

             340       350       360       370       380       390 
mKIAA1 MDLTETGTQRGSKLVTLEAKSQFIMASNGSLISSGSQDSEGMEEQKREKILELKKKEKLL
                                     :.:::::.:.. .  :.. .  ::.... :
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                                             10        20        30

             400       410       420       430       440        450
mKIAA1 QEKLLQKVEELKKICLREAELTGRMPKEYPLNIGEKPPQVRRRVGTTFKLDDN-LLPTEE
       .: : :..::::..:::::::::..: ::::. ::.:: ::::.::.::::.. .::  :
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mKIAA1 DPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLASEPDLCKTVKKKRKQDYTDAVKRLQEIENSINEYR
       .  :..:: .: ::....:::..:::.:.. : .::.:: .: .:.:.::::::.::: :
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              520       530       540       550       560          
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       :. ::::.:.:..:  .  : ::.:::::. . .: .:: . .   : . ::.   ::  
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mKIAA1 -------PPKSL-GIERIHFRK---------------SSINEQF--MDTRHSREMLSTH-
              ::.:: :....:...               ::..: .  .  : :.   :.: 
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     210       220       230       240       250       260         

                               610       620             630       
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                         .:: ..: .  ..  :::.:: : .:. .      :  . : 
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mKIAA1 ---SSSQHCRQRSGSLESQSHLL-SEMDSDKPFFTLSKSQRSSSTEILDDGSSYTSQSSS
          : . : :.::.:::::..:: :: :. .: :   ... :.... .:: :: ::.:::
mKIAA1 RLHSLALHFRHRSSSLESQGKLLGSENDTGSPDFYTPRTRSSNGSDPMDDCSSCTSHSSS
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           700        710         720          730       740       
mKIAA1 EYYCVTPAA-SPYYTTQTLDT--RARGRRRSKKHS---VSTSNSGSMPNLAQKDPLRN--
       :.:   ::  .  :.: . :.  .:: :.:.....   .....:::::::: ..   .  
mKIAA1 EHY--YPAQMNANYSTLAEDSPSKARQRQRQRQRAAGALGSASSGSMPNLAARSGAASTG
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mKIAA1 -GVYSKGQDPPPSGYYIAGYPPYAECDLYYSGGYVYENDTEGQYSVNPSYRSSAHY--GY
        ::: ..:. : : : :  :: : : .         :.: ::.:::. ....:  :  : 
mKIAA1 GGVYLHSQSQPSSQYRIKEYPLYIEGSATPVVVRSLESDQEGHYSVKAQFKTSNSYTAGG
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mKIAA1 DRQRDYSRSFHEDEVDRVPHNPYATLRLPRKAAVKSEHITKNIHKALVAEHLRGWYQR--
         ....  .  : .. :.  .    :: : . .  . :  :.  .: :...:: ::::  
mKIAA1 LFKESWRGGGDEGDAGRLTPSRSQILRTP-SLGRDGAH-DKGSGRAAVSDELRQWYQRST
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mKIAA1 ASGQKDQGHSPQTSFDSDRGSQRCLGFAGLQVPCSPSSRASSYSSVSSTNASGNWRTQLT
       :: .. .  :  .: .:: :::   .  .  :  :  .:  .. ...:.    . :..  
mKIAA1 ASHKEHSRLSHTSSTSSDSGSQYSTSSQSTFVAHSRVTRMPQMCKATSAALPQSQRSSTP
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mKIAA1 ---IGLSEYENPVHSPYTSYYGSIYNPLSSPSRQYAETTPLDGTDGSQLEDNLEGSEQRL
          :: .   .: :                                              
mKIAA1 SSEIGATPPSSPHHILTWQTGEATENSPIMDGSESPTHQSTDE                 
          630       640       650       660                        

>>mKIAA1548  ( 789 res)   mpm02067                        (789 aa)
 initn: 326 init1: 130 opt: 239  Z-score: 185.4  bits: 45.5 E(): 3.5e-05
Smith-Waterman score: 370;  27.796% identity (29.897% ungapped) in 313 aa overlap (15-326:95-386)

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mKIAA1                 MSLNHGLEMTEGRHCQVHLLDDRRLELLVQPKLLSRELLDLVAS
                                     :.: :::   . . .  :  ..::.: .  
mKIAA1 RKHAEKERLREAQRAATHIPAAGDAKSIITCRVSLLDGTDVSVDLPKKAKGQELFDQIMY
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mKIAA1 HFNLKEKEYFGITFIDDTGQENWLQLDHRVLEHDLPKKPGPTLLHFAVRFYIESISFLKD
       :..: :..:::. :.:..   .::.  . . ..   :  .:  ::. :.::    . :..
mKIAA1 HLDLIESDYFGLRFMDSAQVAHWLDGTKSIKKQ--VKIGSPYCLHLRVKFYSSEPNNLRE
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mKIAA1 KNTVELFFLNAKACVHKGQIEVDSETIFKLAALVLQESKGDYTSDENARKDLKTLPVFPT
       . :  :: :. :  . .:..:   .:  .:::  ::   :::   :.. . .. .   : 
mKIAA1 ELTRYLFVLQLKQDILSGKLECPFDTAVQLAAYNLQAELGDYDLAEHSPELVSEFRFVPI
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mKIAA1 KTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKGLTRGQAVVQYMKIVEALPTYGVHYYAVKDKQGLPW
       .:  :.  ::     ..:.. . .: : .:: ..:.. .. :  ::: ...:: ..:  .
mKIAA1 QT--EEMELA-----IFEKWKEYRGQTPAQAETNYLNKAKWLEMYGVDMHVVKARDGNDY
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mKIAA1 WLGISYKGIGQYDLQDKVKPRKLFQWKQLENLYFREKKFA-VEVHDPRRISVSRRTFGQS
        ::..  :.  .. . :.    :: : ..  : :...:.. : :.:  . . ...::   
mKIAA1 SLGLTPTGVLVFEGETKIG---LFFWPKITRLDFKKNKLTLVVVEDDDQGKEQEHTF---
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mKIAA1 GLFVQTWYANSSLIKSIWVMAISQHQFYLDRKQSKAKIPSARSLDDIAMDLTETGTQRGS
        .:      . .  : .:  :. .: :.  : .. ..  : ::                 
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           350       360       370       380       390       400   
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 initn: 260 init1: 162 opt: 222  Z-score: 172.2  bits: 43.2 E(): 0.00019
Smith-Waterman score: 378;  22.486% identity (25.257% ungapped) in 547 aa overlap (15-552:127-622)

                               10        20        30        40    
mKIAA1                 MSLNHGLEMTEGRHCQVHLLDDRRLELLVQPKLLSRELLDLVAS
                                     :.: :::  . :  :. .  .. :.:::  
mKIAA0 SEADGLSERTTPSKAQKSPQKIAKKFKSAICRVTLLDASEYECEVEKHGRGQVLFDLVCE
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mKIAA1 HFNLKEKEYFGITFIDDTGQENWLQLDHRVLEHDLPKKPGPTLLHFAVRFYIESISFLKD
       :.:: ::.:::.:: :  .:.:::. .... ..    . .:  . :.:.::  . . : .
mKIAA0 HLNLLEKDYFGLTFCDADSQKNWLDPSKEIKKQ---IRSSPWNFAFTVKFYPPDPAQLTE
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mKIAA1 KNTVELFFLNAKACVHKGQIEVDSETIFKLAALVLQESKGDYTSDENARKDLKTLPVFPT
         :   . :. .: .  :..  .  :   :.. ..:   ::: ..:.. . .. :   :.
mKIAA0 DITRYYLCLQLRADIITGRLPCSFVTHALLGSYAVQAELGDYDAEEHVGNYVSELRFAPN
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          170       180       190       200       210       220    
mKIAA1 KTLQEHPSLAYCEDRVIEHYLKIKGLTRGQAVVQYMKIVEALPTYGVHYYAVKDKQGLPW
       .: .        :.:..: .   .:.: :.: ..... .. :  :::  . .::..:.  
mKIAA0 QTRE-------LEERIMELHKTYRGMTPGEAEIHFLENAKKLSMYGVDLHHAKDSEGIDI
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mKIAA1 WLGISYKGIGQYDLQDKVKPRKLFQWKQLENLYFREKKFAVEVHDPRRISVSRRTFGQSG
        ::.  .:.  :  .:...  . : : .. .. .....: .... : .    . :.: . 
mKIAA0 MLGVCANGLLIY--RDRLRINR-FAWPKILKISYKRSNFYIKIR-PGEYEQFESTIGFK-
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               :    : .: . : .: :.  :  :    :  ...  ..  .  .: ::  .
mKIAA0 ------LPNHRSAKRLWKVCIEHHTFF--RLVSPE--PPPKGFLVMGSKFRYSGRTQAQT
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mKIAA1 KLVT--LEAKSQFIMASNGSLISSGSQDSEGMEEQKREKILELKKKEKLLQEKLLQKVEE
       . ..  ..  . :.  :...  .  :.. .: : ..  .. :   ..    :   .: :.
mKIAA0 RQASALIDRPAPFFERSSSKRYTM-SRSLDGAEFSRPASVSE---NHDAGPEG--DKRED
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              .::  ::  .    .. . : ....     .: ...  : ...  :.. :. .
mKIAA0 -------DAESGGRRSEAEEGEV-RTPTKIKE-----LKPEQETTPRHKQEFLDKPEDVL
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