FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1013.ptfa, 989 aa vs ./tmplib.26680 library 1768028 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1394+/-0.00467; mu= 7.1082+/- 0.308 mean_var=185.1011+/-43.372, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 4 in 1/35 Lambda= 0.0943 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1294 ( 667 res) mbg00518 ( 667) 679 105 3e-23 mKIAA1548 ( 789 res) mpm02067 ( 789) 239 45 3.5e-05 mKIAA0338 ( 907 res) mbg08118 ( 907) 222 43 0.00019 mKIAA4056 ( 844 res) mfj33372 ( 844) 195 40 0.0023 >>mKIAA1294 ( 667 res) mbg00518 (667 aa) initn: 609 init1: 338 opt: 679 Z-score: 509.7 bits: 105.2 E(): 3e-23 Smith-Waterman score: 1043; 35.714% identity (40.780% ungapped) in 644 aa overlap (362-931:1-638) 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 MDLTETGTQRGSKLVTLEAKSQFIMASNGSLISSGSQDSEGMEEQKREKILELKKKEKLL :.:::::.:.. . :.. . ::.... : mKIAA1 LLSSGSQESDSSQSAKKDMLAALKSRQEAL 10 20 30 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 QEKLLQKVEELKKICLREAELTGRMPKEYPLNIGEKPPQVRRRVGTTFKLDDN-LLPTEE .: : :..::::..:::::::::..: ::::. ::.:: ::::.::.::::.. .:: : mKIAA1 EETLRQRLEELKRLCLREAELTGKLPVEYPLDPGEEPPIVRRRIGTAFKLDEQKILPKGE 40 50 60 70 80 90 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 DPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLASEPDLCKTVKKKRKQDYTDAVKRLQEIENSINEYR . :..:: .: ::....:::..:::.:.. : .::.:: .: .:.:.::::::.::: : mKIAA1 EAELERLEREFAIQSQITEAARRLASDPNVSKKLKKQRKTSYLNALKKLQEIENAINENR 100 110 120 130 140 150 520 530 540 550 560 mKIAA1 IRCGKKPSQKAAVVPPEDIIPSESSSLSDTTTYDDPNDSFTLAGQRPSSVPHS---PRIL :. ::::.:.:..: . : ::.:::::. . .: .:: . . : . ::. :: mKIAA1 IKSGKKPTQRASLVIDDGNIASEDSSLSDALVLED-EDSQVTSTISPLQSPHKGLPPRPP 160 170 180 190 200 570 580 590 600 mKIAA1 -------PPKSL-GIERIHFRK---------------SSINEQF--MDTRHSREMLSTH- ::.:: :....:... ::..: . . : :. :.: mKIAA1 SSHNRPPPPQSLEGLRQLHYHRTDYDKSPLKPKMWSESSLDEPYEKVKKRSSHGHSSSHK 210 220 230 240 250 260 610 620 630 mKIAA1 ------------------SSPYKTLERRPQGGRSMPTTPVL-TRNAY-----SSSHLEPD .:: ..: . .. :::.:: : .:. . : . : mKIAA1 RFPSTGSCTEAGVSSSLQNSPIRSLPHW-NSQSSMPSTPDLRVRSPHYVHSTRSVDISPT 270 280 290 300 310 320 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 ---SSSQHCRQRSGSLESQSHLL-SEMDSDKPFFTLSKSQRSSSTEILDDGSSYTSQSSS : . : :.::.:::::..:: :: :. .: : ... :.... .:: :: ::.::: mKIAA1 RLHSLALHFRHRSSSLESQGKLLGSENDTGSPDFYTPRTRSSNGSDPMDDCSSCTSHSSS 330 340 350 360 370 380 700 710 720 730 740 mKIAA1 EYYCVTPAA-SPYYTTQTLDT--RARGRRRSKKHS---VSTSNSGSMPNLAQKDPLRN-- :.: :: . :.: . :. .:: :.:..... .....:::::::: .. . mKIAA1 EHY--YPAQMNANYSTLAEDSPSKARQRQRQRQRAAGALGSASSGSMPNLAARSGAASTG 390 400 410 420 430 440 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 -GVYSKGQDPPPSGYYIAGYPPYAECDLYYSGGYVYENDTEGQYSVNPSYRSSAHY--GY ::: ..:. : : : : :: : : . :.: ::.:::. ....: : : mKIAA1 GGVYLHSQSQPSSQYRIKEYPLYIEGSATPVVVRSLESDQEGHYSVKAQFKTSNSYTAGG 450 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 DRQRDYSRSFHEDEVDRVPHNPYATLRLPRKAAVKSEHITKNIHKALVAEHLRGWYQR-- .... . : .. :. . :: : . . . : :. .: :...:: :::: mKIAA1 LFKESWRGGGDEGDAGRLTPSRSQILRTP-SLGRDGAH-DKGSGRAAVSDELRQWYQRST 510 520 530 540 550 560 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 ASGQKDQGHSPQTSFDSDRGSQRCLGFAGLQVPCSPSSRASSYSSVSSTNASGNWRTQLT :: .. . : .: .:: ::: . . : : .: .. ...:. . :.. mKIAA1 ASHKEHSRLSHTSSTSSDSGSQYSTSSQSTFVAHSRVTRMPQMCKATSAALPQSQRSSTP 570 580 590 600 610 620 930 940 950 960 970 mKIAA1 ---IGLSEYENPVHSPYTSYYGSIYNPLSSPSRQYAETTPLDGTDGSQLEDNLEGSEQRL :: . .: : mKIAA1 SSEIGATPPSSPHHILTWQTGEATENSPIMDGSESPTHQSTDE 630 640 650 660 >>mKIAA1548 ( 789 res) mpm02067 (789 aa) initn: 326 init1: 130 opt: 239 Z-score: 185.4 bits: 45.5 E(): 3.5e-05 Smith-Waterman score: 370; 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