# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpg00645.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1767.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1767, 687 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7921152 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9943+/-0.000181; mu= 13.0863+/- 0.010 mean_var=65.6030+/-12.798, 0's: 30 Z-trim: 32 B-trim: 13 in 1/65 Lambda= 0.158348 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148706627|gb|EDL38574.1| mCG15592 [Mus musculus (1152) 4345 1002.0 0 gi|205830494|sp|A8C756.1|THADA_MOUSE RecName: Full (1938) 4345 1002.2 0 gi|149268930|ref|XP_619495.3| PREDICTED: thyroid a (1946) 4345 1002.2 0 gi|149269510|ref|XP_922063.2| PREDICTED: similar t (1948) 4345 1002.2 0 gi|149050528|gb|EDM02701.1| rCG61319 [Rattus norve (1151) 4008 925.0 0 gi|109477886|ref|XP_233829.4| PREDICTED: similar t (2281) 4008 925.2 0 gi|206557758|sp|A8C752.1|THADA_CERAE RecName: Full (1953) 3603 832.7 0 gi|119620706|gb|EAX00301.1| hCG16399, isoform CRA_ (1222) 3590 829.5 0 gi|158261069|dbj|BAF82712.1| unnamed protein produ (1953) 3590 829.7 0 gi|74749519|sp|Q6YHU6.1|THADA_HUMAN RecName: Full= (1953) 3590 829.7 0 gi|114577169|ref|XP_001141732.1| PREDICTED: thyroi (1953) 3585 828.5 0 gi|205830492|sp|A8C750.1|THADA_CANFA RecName: Full (1948) 3504 810.0 0 gi|194220771|ref|XP_001499013.2| PREDICTED: simila (1951) 3463 800.7 0 gi|34493760|gb|AAO46786.1| death receptor interact (1097) 3101 717.8 5e-204 gi|34493762|gb|AAO46787.1| death receptor interact (1063) 3090 715.3 2.8e-203 gi|34493764|gb|AAO46788.1| death receptor interact (1063) 3083 713.7 8.4e-203 gi|126304489|ref|XP_001382195.1| PREDICTED: simila (1956) 3028 701.3 8.3e-199 gi|205830493|sp|A8C754.1|THADA_CHICK RecName: Full (1930) 2875 666.3 2.7e-188 gi|114577173|ref|XP_001141556.1| PREDICTED: thyroi (1648) 2830 656.0 3e-185 gi|224047212|ref|XP_002196030.1| PREDICTED: thyroi (1930) 2817 653.1 2.6e-184 gi|119620707|gb|EAX00302.1| hCG16399, isoform CRA_ (1148) 2655 615.9 2.4e-173 gi|10437960|dbj|BAB15133.1| unnamed protein produc (1148) 2655 615.9 2.4e-173 gi|34493766|gb|AAO46789.1| death receptor interact ( 958) 2483 576.6 1.4e-161 gi|34533465|dbj|BAC86709.1| unnamed protein produc ( 524) 2303 535.3 2.1e-149 gi|77415325|gb|AAI05977.1| THADA protein [Homo sap ( 836) 1851 432.2 3.7e-118 gi|119620705|gb|EAX00300.1| hCG16399, isoform CRA_ ( 773) 1477 346.7 1.8e-92 gi|47221716|emb|CAG10188.1| unnamed protein produc ( 333) 1225 288.9 2e-75 gi|210108738|gb|EEA56628.1| hypothetical protein B (1823) 1173 277.5 2.9e-71 gi|31127146|gb|AAH52885.1| Thada protein [Mus musc ( 668) 1143 270.3 1.5e-69 gi|149538970|ref|XP_001513110.1| PREDICTED: simila (1056) 1021 242.6 5.3e-61 gi|148877339|gb|AAI46093.1| LOC514187 protein [Bos ( 573) 1006 239.0 3.5e-60 gi|156218208|gb|EDO39110.1| predicted protein [Nem ( 923) 1006 239.1 5.1e-60 gi|62702228|gb|AAX93154.1| unknown [Homo sapiens] ( 169) 943 224.2 2.9e-56 gi|19343989|gb|AAH25773.1| THADA protein [Homo sap ( 674) 944 224.9 7.4e-56 gi|10438074|dbj|BAB15162.1| unnamed protein produc ( 674) 943 224.7 8.6e-56 gi|194671405|ref|XP_001789355.1| PREDICTED: simila ( 554) 898 214.3 9.2e-53 gi|212507181|gb|EEB11180.1| conserved hypothetical (1825) 881 210.8 3.5e-51 gi|108869050|gb|EAT33275.1| conserved hypothetical (1325) 784 188.5 1.3e-44 gi|12964788|gb|AAK11318.1|AF323176_1 death recepto ( 643) 752 181.0 1.1e-42 gi|34532325|dbj|BAC86389.1| unnamed protein produc ( 937) 747 180.0 3.4e-42 gi|190584069|gb|EDV24139.1| hypothetical protein T ( 323) 726 174.9 4e-41 gi|194166920|gb|EDW81821.1| GK25461 [Drosophila wi (1455) 715 172.8 7.6e-40 gi|194150172|gb|EDW65863.1| GJ18663 [Drosophila vi (1735) 714 172.6 1e-39 gi|193904713|gb|EDW03580.1| GH11312 [Drosophila gr (1710) 707 171.0 3.1e-39 gi|193664360|ref|XP_001952456.1| PREDICTED: simila (1415) 698 168.9 1.1e-38 gi|193908665|gb|EDW07532.1| GI15808 [Drosophila mo (1743) 691 167.4 3.9e-38 gi|221126869|ref|XP_002159347.1| PREDICTED: simila (1165) 659 159.9 4.5e-36 gi|210108595|gb|EEA56488.1| hypothetical protein B (1756) 641 156.0 1.1e-34 gi|210093601|gb|EEA41801.1| hypothetical protein B (1570) 634 154.3 3e-34 gi|46097614|gb|EAK82847.1| hypothetical protein UM (2675) 626 152.7 1.6e-33 >>gi|148706627|gb|EDL38574.1| mCG15592 [Mus musculus] (1152 aa) initn: 4345 init1: 4345 opt: 4345 Z-score: 5354.9 bits: 1002.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 4345; 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