FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00098.ptfa, 1091 aa vs ./tmplib.26680 library 1767926 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5967+/-0.00452; mu= 18.1018+/- 0.302 mean_var=84.0679+/-19.520, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 152 in 1/35 Lambda= 0.1399 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1176 ( 1164 res) mbg06148 (1164) 4906 1001 0 >>mKIAA1176 ( 1164 res) mbg06148 (1164 aa) initn: 5066 init1: 3125 opt: 4906 Z-score: 5345.6 bits: 1001.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 5318; 72.364% identity (76.392% ungapped) in 1100 aa overlap (49-1091:66-1164) 20 30 40 50 60 70 mFLJ00 EARADGAGDEAAERTEEPESPESVDQTSPTPGDGNPRENSPFINNVEVERESYFEGKNMA ::::::.:.:::::....:. ..:.::: mKIAA1 EAAQPSRARRRAATMLNNLTDCEDGDGGANPGDGNPKESSPFINSTDTEKGREYDGRNMA 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 mFLJ00 LFEEEMDSNPMVSSLLNKLANYTNLSQGVVEHEEDEDS---RRREVKAPRMGTFIGVYLP 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