FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0433.ptfa, 1132 aa vs ./tmplib.26680 library 1767885 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9909+/-0.00458; mu= 12.2505+/- 0.306 mean_var=116.0042+/-27.567, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1191 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0377 ( 1442 res) mbg05380 (1442) 4943 861 0 >>mKIAA0377 ( 1442 res) mbg05380 (1442 aa) initn: 4985 init1: 2611 opt: 4943 Z-score: 4587.5 bits: 861.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 5001; 65.622% identity (71.390% ungapped) in 1213 aa overlap (4-1129:10-1211) 10 20 30 40 50 mKIAA0 TLCMSNSRKMSEPPRFFVGPEDAEINP-G-NYRRFFHHAEEEEEEEDESPPERQ .. .. : .::.: : .. : ..: .: :.:::: ::: : mKIAA0 VGVPAGMWSLTANEDESTTAHFFLGAGDEGLGTCGIGMRTEESDSELLEDEEDEVPPEPQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 IVVGICSMAKKSKSKPMKEILERISLFKYITVVVFEEEIILNEPVENWPLCDCLISFHSK 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