FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1016.ptfa, 777 aa vs ./tmplib.26680 library 1768240 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3774+/-0.00725; mu= 1.7582+/- 0.484 mean_var=278.8415+/-64.458, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0768 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00248 ( 491 res) mfj21306 ( 491) 966 120 4.5e-28 mKIAA1495 ( 268 res) mbh04715 ( 268) 720 93 4.9e-20 mKIAA1225 ( 1401 res) mbg04842 (1401) 320 49 3.1e-06 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 293 46 1.4e-05 mKIAA1365 ( 1497 res) mbg05137 (1497) 299 47 1.6e-05 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 296 47 2.2e-05 mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 ( 606) 280 45 3.9e-05 mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 ( 811) 226 39 0.003 >>mFLJ00248 ( 491 res) mfj21306 (491 aa) initn: 947 init1: 947 opt: 966 Z-score: 596.4 bits: 120.5 E(): 4.5e-28 Smith-Waterman score: 966; 54.545% identity (57.042% ungapped) in 297 aa overlap (109-396:28-320) 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 FAPALSVTALHPHLHQHHQHHQHHQHHGGTGGTGFNLPLNRGLERALEEAANSGGLNLSA :. : :: .:. :::::::. .: :::: mFLJ00 RRERMAAAVAGPLAAGGEEAAASVSLPGSPG--LPGSRSAERALEEAVATGTLNLSN 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 RKLKEFPRTTAPGHDLSDTVRADLSKNRLVEVPMELCQFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIV :.::.::: .: ..:::: ..::::.::. ::: ::.:::: :.:::::.. . :. mFLJ00 RRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGLSLYHNCLKCLNPALG 60 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 NLQMLTHLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEI :: ::.:::::::::.:: .: :::.::: ::::::.:: .:. : .: .:::: ::. mFLJ00 NLTALTYLNLSRNQLSSLPPYICQLPLRVLIISNNKLGALPPDISTLGSLRQLDVSSNEL 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 TALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPPELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPVCFREMKQLQV .:: .. .:.:::.:::::: :..:: :: :::::..:::::.. ::: : ....::: mFLJ00 QSLPVELCSLRSLRDLNVRRNQLSTLPDELGDLPLVRLDFSCNRISRIPVSFCRLRHLQV 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 LLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTSDSLYLPTIERPHLHQ--HVED-- .::..::::::::::: :::.::::::...: . .. . .:. :: . .:: mFLJ00 VLLDSNPLQSPPAQICLKGKLHIFKYLTMEAGRRGAALGDLVPS--RPPSFSPCPAEDLF 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 mKIAA1 --SKKDS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNAPMSNIVEEDQTIKEDACHRLTP . :. ::: : :.:.:: :..: mFLJ00 PGRRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNEVRTSFAELSFRISELARDPRGPRQPREDGAGDG 300 310 320 330 340 350 >>mKIAA1495 ( 268 res) mbh04715 (268 aa) initn: 751 init1: 706 opt: 720 Z-score: 452.1 bits: 92.9 E(): 4.9e-20 Smith-Waterman score: 720; 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