FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0970.ptfa, 622 aa vs ./tmplib.26680 library 1768395 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6236+/-0.00512; mu= 12.9377+/- 0.340 mean_var=113.4550+/-26.870, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 134 in 1/35 Lambda= 0.1204 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4164 ( 1207 res) mib02090 (1207) 2182 390 5.6e-109 mKIAA1514 ( 1994 res) mbf03631 (1994) 235 52 5.1e-07 mKIAA1628 ( 1294 res) mbg00013 (1294) 217 49 3.3e-06 mFLJ00154 ( 1340 res) mfj45154 (1340) 196 45 4.3e-05 mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 ( 898) 180 42 0.00022 mKIAA0283 ( 1054 res) mic41033 (1054) 169 40 0.00094 mKIAA4044 ( 1352 res) mpg00593 (1352) 154 38 0.0067 >>mKIAA4164 ( 1207 res) mib02090 (1207 aa) initn: 1720 init1: 938 opt: 2182 Z-score: 2048.9 bits: 390.2 E(): 5.6e-109 Smith-Waterman score: 2182; 50.883% identity (51.378% ungapped) in 623 aa overlap (2-622:589-1207) 10 20 30 mKIAA0 HSHGFKITWDPPKDNGGAPINKYVVEMAEG- ::::.. :: ::::::. : ::..:...: mKIAA4 KSCPSEVLVCTTSPDRPGPPTRPLIKGPVTSHGFSVKWDAPKDNGGSEILKYLLEITDGT 560 570 580 590 600 610 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 SNGNKWDMIYSGTTREHLCDRLTPGCYYRLRVYCISDGGQSAVSESLLVQTPAVPPGPCL :....:.. :::.. :.. .: :: :.::. ::: ::.: :::: :.: .. :: : mKIAA4 SEAGQWEVAYSGSATEYVFTHLKPGTLYKLRACCISTGGHSQCSESLPVRTLSLAPGQCR 620 630 640 650 660 670 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 PPRLQGRPKAKEIQLRWGPPQVDGGSPISCYAVEMTPADKDEPRDVYQGSEVECTVGSLL :::. :::: : ..:.: : ..: .: :.:::: . . .::.: :.:::::.:: mKIAA4 PPRVLGRPKHKGVHLEWDVPASESGCEVSEYSVEMTEPE-NVASEVYHGPELECTVGNLL 680 690 700 710 720 730 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 PGKTYSFRLRAANRIGFGPFSEKYDITTAPGPPDQCRPPQVTCRSATCAQVNWEIPLSNG :: .: ::.:: : :.::.:. .:::: ::: ::: :.:. :. :.:: : : : mKIAA4 PGTVYRFRVRALNDGGYGPYSDVSEITTAAGPPGQCRAPRVSFTPDGCVLVGWESPASPG 740 750 760 770 780 790 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 TDVTEYRLEWGGVEGSMQMCYCGPGLSCELKGLSPATTYYCRVQAMSVVGAGPFSEVVAC .:..::::::: : :... : :: :.. : ::. : ::.::.. .::::.::.: : mKIAA4 ADISEYRLEWGEDEQSLELVYHGPDTCFEMRDLLPAAQYCCRLQAFNPAGAGPYSELVHC 800 810 820 830 840 850 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 VTPPSVPAIVTCLQEISDDDIEYPHYSPSTCLAISWKEPYDHGSEILAYSIDLGDKQPLT :: :.: :. : . .. :::.::...:.:: ..:::::::.:::::. .: mKIAA4 QTPASAPDPVSTLCVLEEEPPSAHPDSPSVCLVLNWEEPCNNGSEILAYNIDLGDSC-IT 860 870 880 890 900 910 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 VGKMTSYIIDSLQPDTTYRIRIQALNSLGAGPFSHTIKLKTKPLPPDPPRLECVAFNHQN ::. :.... .: :.:::::::::.: .:.::::. :: ::.::::.::::::.: . :. mKIAA4 VGNTTTHVMKNLLPETTYRIRIQAINEIGVGPFSQFIKAKTRPLPPSPPRLECAASGPQS 920 930 940 950 960 970 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LKLKWGEGTPKTLSTDAVQYHLQMEDRNGRFVSLYRGPCHTYKVQRLSESTSYKFCIQAC ::::::... :: .. . : ::.:::: ::.:.:::: ::::::::.: : :.: ::: mKIAA4 LKLKWGDSNSKTHAAGDMVYTLQLEDRNKRFISIYRGPSHTYKVQRLTEFTCYSFRIQAM 980 990 1000 1010 1020 1030 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 NEAGEGPLSQEYVFTTPKSLPAALKAPKIEKINDHICEITWEYLQPMKGDPVIYNLQVMV .:::::: :. :.:.: ::.: .::::.. ... . ::: :: . ::.:::: : :::.: mKIAA4 SEAGEGPYSETYTFSTTKSVPPTLKAPRVTQLEGNSCEIFWETVPPMRGDPVSYVLQVLV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 GKDSEFKQIYKGPDTSFRYSSLQLNCEYRFRVCAIRQCQDPTGHQDLVGPYSTTVFFISQ :.:::.::.::: ...:. :.:: : .::::::: :.: : . :.: : .: .. :. : mKIAA4 GRDSEYKQVYKGEEATFQISGLQSNTDYRFRVCACRRCVDTS--QELSGAFSPSAAFMLQ 1100 1110 1120 1130 1140 1150 580 590 600 610 620 mKIAA0 RTEPPASSNKDSVDSARTRRTL-SDEQCAAVILVVFAFFSILIAFIIQYFVIK . : ... ... :. . . .::: ::.:.. :: .:::.:::.:::..: mKIAA4 QREVMLTGDLGGMEEAKMKGMMPTDEQFAALIVLGFATLSILFAFILQYFLMK 1160 1170 1180 1190 1200 >>mKIAA1514 ( 1994 res) mbf03631 (1994 aa) initn: 169 init1: 82 opt: 235 Z-score: 218.4 bits: 52.2 E(): 5.1e-07 Smith-Waterman score: 390; 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