FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1542.ptfa, 1085 aa vs ./tmplib.26680 library 1767932 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7875+/-0.00796; mu= -8.5971+/- 0.525 mean_var=392.0175+/-94.327, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0648 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3013 ( 1461 res) mpm01086 (1461) 614 72 6e-13 mFLJ00034 ( 1255 res) mfj27008 (1255) 478 59 3.6e-09 mKIAA1019 ( 480 res) mbg02982 ( 480) 301 43 0.00018 mKIAA0324 ( 1754 res) mbg00352 (1754) 294 42 0.00069 >>mKIAA3013 ( 1461 res) mpm01086 (1461 aa) initn: 611 init1: 377 opt: 614 Z-score: 324.8 bits: 72.3 E(): 6e-13 Smith-Waterman score: 616; 26.170% identity (28.594% ungapped) in 684 aa overlap (427-1080:806-1461) 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 SDLEQEGLGEIEPTEIRGSTARTQRPPPPDPWDDEDEVSCTPFFGSEERTVTCVTVEEPG : ..::..: : . : :: .:. mKIAA3 ECDSFCSDQNESEVESSANTDSKQLSENSVPHSSEDKLSSDPAVEKVE------TVAQPA 780 790 800 810 820 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 VLPSPDAPQITTHRIVEFRASSRS----RSTSSSRSRKKTKKKKKKVAREHQRTRSST-- ::. :.: .:.. : . ..... . : .. . :.... : : ..: . mKIAA3 ESLVDKAPKPRTRR-SRFHSPSTTWSPNKDAAQEKRRAQSPSPKRETVVESQSSQSPSPK 830 840 850 860 870 880 520 530 540 550 560 mKIAA1 RSGSRDRT-SRSVSPVAEEHTRRHRAKTKSRRSSSDRASSQDRAKRRKDRDDRDREHRRG : ..: : :::.:: . .:..... .:... . :.. . :: . .: . : mKIAA3 RESARGRRKSRSLSPKKDVARERRQSRSPKRENAREAKRSESGSPRRDTSRENQRSQSRV 890 900 910 920 930 940 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 SWGHGRCRRKSRSRSGSPGSSSCERHESK-RRKRRHSGSRSRGSSLERDRRHKHRERSRE . . .: . .:::: . .:.... :: :: : ::::. : : : : . : mKIAA3 KDSSSREKSRSRSRERESDREAQRRERDRERRARRWSRSRSRSRSPSRLRT-KSKSSSFG 950 960 970 980 990 1000 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 RMDKQESVTRSRERRRWRS---RSPSLEHRPRRPPSREKRAHSPEKKGPVREVSPAPATQ : .... : .:: : . : : . : :: :... .. ..:. . : :.. mKIAA3 RNERDNYSPRWKER--WTNDGWRCPRGNDRYRRNDSEKQNENTRNEKNDITADSNDPSST 1010 1020 1030 1040 1050 1060 690 700 710 720 730 mKIAA1 GESRQDGDHSAEPPVSE-VSVLPEVVSVLPEVVVADLNPPEV---------PPVLAEPVA . :.: :.: .. :. . :: . : . : .. mKIAA3 DKHRSD----CPSWVTEKINSGPDPRTRNPEKL-KDSHWEENRNENSGNSWTKNFGPGWM 1070 1080 1090 1100 1110 1120 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 HVPEDLDYGESVEAGHVFEDFSNEAIFIQLDDMSSPPSPESTDSSP-----ERDFPPNPI :... :. . ..: . . .:. : .:....: :... . mKIAA3 SSRGRGGRGKGAYRGNFACNDQSENRWQSRTPLSGSDSFKSAEQQPSKRKSEQELSFGTA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 800 810 820 830 840 mKIAA1 LPPASLPQDSTLPTIQREVLPIHSEDISKPVPQA-LAPSDQSLLKQDTVEITTTTPSTPA .. . :. . :..:: .. . ::. ... .::. :. . mKIAA3 ADRSGWTSASSWAV--RKTLPADVQSYYSSGPQSGWMRQEEETPEQDSNLKDQTNQVDGS 1190 1200 1210 1220 1230 850 860 870 880 890 900 mKIAA1 VVPMTKDSPVLSARGWEAVRPRDAVAQAPLLRSRTLVKRVTWNLQEAEHSTPAALDRDPA .:.. .: .:. . : . . :. . . .. . ..::.. . : mKIAA3 QLPVNMMQPHMSVMQPPVNAPMMNMQRNPFTMHPPMPLHPHTGVPLMQVAAPASIPQGPP 1240 1250 1260 1270 1280 1290 910 920 930 940 950 960 mKIAA1 QVYSPNMPPPLAQPSSILPYALVSQPSVQLI--LQGTLPLAGCGTAQSLAPVPTM-PATV : ::: ::. . : ..:::. . . :... ... ..: : :.:. ::.. mKIAA3 ----PPPPPP---PSQQVSY-VASQPDGKQVQGLSSASHVSNNMNTQVL-PAPSAAPANT 1300 1310 1320 1330 1340 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA1 SELAVPTTNNSEERTATPKTAAEKTKKEEYMKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKE . . :...:. ... :.. . : :::..::.:..:::::::::::....::: mKIAA3 GSVQGPSSGNTS--SSSHVQASNAAVKLAESKKLQIQEKAAQEVKLAIKPFYQNKDITKE 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA1 EYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLVKAYVDKYRHMRRHKKTEGGEEPPTQGAET :::.:.::::.:.:::::::.: .::::::::::::::. :.. : : : mKIAA3 EYKEIVRKAVDKVCHSKSGEVNSTKVANLVKAYVDKYRYSRKKALEEPGSTEKT 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>mFLJ00034 ( 1255 res) mfj27008 (1255 aa) initn: 638 init1: 411 opt: 478 Z-score: 256.9 bits: 59.5 E(): 3.6e-09 Smith-Waterman score: 692; 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