FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4098.ptfa, 1048 aa vs ./tmplib.26680 library 1767969 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9634+/-0.00665; mu= 4.5138+/- 0.443 mean_var=217.3229+/-51.594, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0870 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 ( 962) 1868 248 5.5e-66 mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 ( 889) 581 86 2.2e-17 mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592) 559 84 2.3e-16 mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 ( 801) 516 78 5.9e-15 mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364) 508 77 1.7e-14 mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289) 499 76 3.6e-14 >>mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 (962 aa) initn: 2276 init1: 1084 opt: 1868 Z-score: 1277.0 bits: 247.8 E(): 5.5e-66 Smith-Waterman score: 2896; 60.512% identity (65.836% ungapped) in 742 aa overlap (293-1026:1-690) 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 KILLEIGAKGKPYLTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRSSQARLLIEKYETNKQFLE ::::.:::::.. :...:::::: :... . mKIAA0 RLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNSSLAK 10 20 30 330 340 350 360 370 380 mKIAA4 RDQMSMEGFSRYLGGEENGILPLEALDLSMDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGPSSV . :::..:: :::.:::::.. : :::. ::.:::: :::::::::::::::::: ::: mKIAA0 KGQMSVDGFMRYLSGEENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSV 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 EMYRQALLWGCRCVELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAEAAFKTSPYP :::::.:: :::::::: :::: :::: ::::::::::. ...:.::::: ::::::.: mKIAA0 EMYRQVLLSGCRCVELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFP 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 VILSFENHVDSAKQQAKMAEYCRSIFGDALLIDPLDKYPLSAGIPLPSPQDLMGRILVKN ..::::::::: ::::::::::: :::::::..::.:::: .:.:::::.::: .::::: mKIAA0 ILLSFENHVDSPKQQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPSPMDLMYKILVKN 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 KKR-HRPSTGVPDSSVRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVG ::. :. : : : .:. ::.... :.::.. ::::: : ...: mKIAA0 KKKSHKSSEG----SGKKKLSEQASNTYSDSSSVFEPSSPGAGEADTES----------- 220 230 240 250 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 LEKTSLEPQKSLGEESLSREPNVPMPDRDREDEEEDEEEEETTDPKKPTTDEGTASSEVN .:...:. : :: . :::::.::. mKIAA0 ------------------------------DDDDDDD------DCKKSSMDEGTAGSEAM 260 270 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 ATEEMSTLVNYVEPVKFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLS ::::::.::::..::::.::: ..:::: ::::::::::..:::::::.:::::::.::: mKIAA0 ATEEMSNLVNYIQPVKFESFEISKKRNKSFEMSSFVETKGLEQLTKSPVEFVEYNKMQLS 280 290 300 310 320 330 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 RIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNVGCQLVALNFQTLDLPMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFM :::::::::::::::::::::.:::.:::::::.:: ::.: :..::::.::: :::::: mKIAA0 RIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTVDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFM 340 350 360 370 380 390 750 760 770 780 790 800 mKIAA4 RRPDKSFDPFTEVIVDGIVANALRVKVISGQFLSDKKVGIYVEVDMFGLPVDTRRK-YRT ::::: :::::: ::::::::.: ::.:::::::::::: :::::::::::::::: ..: mKIAA0 RRPDKHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQFLSDKKVGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKT 400 410 420 430 440 450 810 820 830 840 850 860 mKIAA4 RTSQGNSFNPVWDEEPFDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVC .:::::. ::::.:::. : :::::.:: :::::.::::::.:::::::.::: ::::.: mKIAA0 KTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPSLACLRIAAYEEGGKFIGHRILPVQAIRPGYHYIC 460 470 480 490 500 510 870 880 890 900 910 920 mKIAA4 LRNEANQPLCLPALLIYTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRAKQLAALIGESE :::: :::: :::...: :..::.:: . : ::: :::..:.::.::::::::: :.: mKIAA0 LRNERNQPLTLPAVFVYIEVKDYVPDTYADVIEALSNPIRYVNLMEQRAKQLAALTLEDE 520 530 540 550 560 570 930 940 950 960 970 mKIAA4 AQASTETYQ-ETPCQQPGSQLPSNPTPNPLDASPRWPPGPTTSSTSS-----SLSSPGQR ... :. :: . : :. ..:. : .. . : : ... : :...:.. mKIAA0 EEVKKEADPGETSSEAP-SETRTTPAENGVNHTASLAPKPPSQAPHSQPAPGSVKAPAKT 580 590 600 610 620 630 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA4 DDLIASILSEVTPTPLEELRSHKAMVKLRSRQDRDLRELHKKHQRKAVALTRRLLDGLAQ .::: :.:.:: .:::...:..:::.... .....: :.:..:.. : .. mKIAA0 EDLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKLQKKHYKEMKDLVKRHHKKTTELIKEHTTKYNE 640 650 660 670 680 690 1040 mKIAA4 ARAEGKCRPSPSAL mKIAA0 IQNDYLRRRAALEKSAKKDSKKKSEPSSPDHGSSAIEQDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQ 700 710 720 730 740 750 >>mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 (889 aa) initn: 917 init1: 421 opt: 581 Z-score: 404.4 bits: 86.2 E(): 2.2e-17 Smith-Waterman score: 1031; 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