Comparison of KIAA cDNA sequences between mouse and human (KIAA0469)
<<Original sequence data>>
mouse mKIAA0469 (mpg00435) length: 3869 bp, CDS: 2 - 1816
human KIAA0469 (hg01666) length: 6450 bp, CDS: 125 - 1804
In this page, the longest coding region predicted by GeneMark
was assigned as CDS for each of mouse and human KIAA cDNAs.
They were colored in green. When the CDS positions were not identical
on the aligned sequences between mouse and human cDNAs, mouse cDNA
sequence was translated based on the human CDS information.
The amino acid sequence produced here may not be identical to the
protein sequence deduced (see Description).
<<Aligned sequence information>>
----------------------------------------------------------
region #match #mismatch %diff
----------------------------------------------------------
DNA
5'UTR: 80 - 181 13 7 35.0
CDS: 182 - 1804 1359 142 9.5
3'UTR: 1805 - 6485 1377 986 41.7
amino acid
CDS: 182 - 1804 491 50 9.2
----------------------------------------------------------
<<Alignment>>
1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
mpg00435 1 .................................................. 1
hg01666 1 CGCGCTCGCGGGGGGCGGTGGCGCCCGGCACAGAGGGGTTAAGGGGGCGG 50
51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
mpg00435 1 .............................CTGTGACCCGCAGCTCC.... 17
| || |||| || ||
hg01666 51 TGCAGACGTCTCCCCGCCCATCCCGCCCCTCGAGAGCCGCGGCGCCCCGC 100
101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
mpg00435 18 .................................................. 18
hg01666 101 CCTATTTATAGCAGCGGTGCCTAGCGCGCCGCGTCTCTCCGCAGGCCCCG 150
R A A S L R R P R
151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
V M E R P A P
mpg00435 18 .............................GCGTCATGGAGCGGCCGGCGC 38
||| ||||||||| |||||||
hg01666 151 GCCGCGGCGTCCTCGACAACCTATCGAAGGCGCCATGGAGCGACCGGCGC 200
P R R P R Q P I E G A M E R P A P
201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
L A V L P F S D P A H A L S L L
mpg00435 39 CTTTGGCTGTGCTGCCCTTCTCCGATCCCGCGCACGCCCTAAGCCTGTTG 88
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hg01666 201 CCCTGGCCGTGCTTCCCTTCTCGGACCCCGCGCACGCCCTGAGCCTGCTG 250
L A V L P F S D P A H A L S L L
251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
R G L S Q L R A E R K F L D V T L
mpg00435 89 CGCGGCCTCAGTCAACTGCGCGCCGAGCGCAAGTTCCTGGATGTGACCCT 138
|||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
hg01666 251 CGCGGCCTGAGCCAGCTGCGCGCCGAGCGCAAGTTCCTGGACGTGACCCT 300
R G L S Q L R A E R K F L D V T L
301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
E A A G G R D F P A H R A V L A A
mpg00435 139 GGAGGCGGCGGGCGGCCGCGACTTCCCCGCGCACCGCGCCGTGCTGGCGG 188
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |
hg01666 301 GGAGGCGGCGGGCGGGCGCGACTTCCCGGCGCACCGTGCGGTGCTGGCCG 350
E A A G G R D F P A H R A V L A A
351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
A S P Y F R A M F A G Q L R E S
mpg00435 189 CCGCTAGTCCCTACTTCCGCGCCATGTTCGCGGGCCAGCTGCGCGAGAGC 238
|||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
hg01666 351 CCGCCAGCCCCTACTTCCGCGCCATGTTCGCGGGGCAGCTGCGCGAGAGC 400
A S P Y F R A M F A G Q L R E S
401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
R A E R V R L H G V P P D M L Q L
mpg00435 239 CGCGCCGAGCGCGTGCGCCTGCACGGGGTGCCGCCCGACATGCTACAGCT 288
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hg01666 401 CGCGCCGAGCGGGTGCGCCTGCACGGAGTGCCTCCCGACATGCTGCAGCT 450
R A E R V R L H G V P P D M L Q L
451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
L L D F S Y T G R V A V S G D N A
mpg00435 289 GCTCCTGGACTTCAGCTACACCGGCAGAGTGGCGGTGAGCGGCGACAACG 338
||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||
hg01666 451 GCTGCTGGACTTCAGCTACACGGGCCGCGTGGCGGTAAGCGGCGACAACG 500
L L D F S Y T G R V A V S G D N A
501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
E P L L R A A D L L Q F P A V K
mpg00435 339 CCGAGCCGCTGCTGCGCGCCGCCGACCTGCTGCAGTTCCCCGCCGTGAAG 388
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
hg01666 501 CTGAGCCGCTGCTGCGCGCCGCCGACCTGCTGCAGTTCCCGGCCGTGAAG 550
E P L L R A A D L L Q F P A V K
551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
E A C G A F L Q Q Q L D L A N C L
mpg00435 389 GAGGCGTGCGGCGCCTTCCTGCAGCAGCAGCTCGACCTGGCCAACTGCCT 438
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg01666 551 GAGGCGTGCGGGGCCTTCCTGCAGCAGCAGCTCGACCTGGCCAACTGCCT 600
E A C G A F L Q Q Q L D L A N C L
601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
D M Q D F A E A F S C S G L A S A
mpg00435 439 GGACATGCAGGACTTCGCCGAGGCCTTCAGCTGCTCGGGGCTGGCGAGCG 488
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
hg01666 601 GGACATGCAGGACTTCGCTGAGGCCTTCAGCTGCTCGGGACTGGCGAGCG 650
D M Q D F A E A F S C S G L A S A
651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
A Q R F I L R H V G E L G A E Q
mpg00435 489 CTGCGCAACGCTTCATCCTGCGCCACGTGGGCGAACTGGGCGCCGAGCAA 538
| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
hg01666 651 CGGCGCAGCGGTTCATTCTGCGCCACGTGGGCGAGCTGGGCGCCGAGCAG 700
A Q R F I L R H V G E L G A E Q
701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
L E R L P L A R L L R Y L R D D G
mpg00435 539 CTGGAGAGGCTGCCGCTGGCGCGCCTGCTGCGCTACCTGCGCGACGACGG 588
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
hg01666 701 CTGGAGCGGCTGCCACTGGCGCGCCTGCTGCGCTACCTGCGGGACGACGG 750
L E R L P L A R L L R Y L R D D G
751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
L C V P K E E A A Y Q L A L R W V
mpg00435 589 GCTGTGCGTGCCCAAGGAGGAGGCGGCCTACCAGCTGGCGCTGCGCTGGG 638
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
hg01666 751 GCTGTGTGTGCCCAAGGAGGAGGCCGCCTACCAGCTGGCGCTGCGCTGGG 800
L C V P K E E A A Y Q L A L R W V
801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
R A D P P R R A P H W P Q L L E
mpg00435 639 TGCGCGCGGACCCGCCGCGCCGCGCGCCGCACTGGCCGCAGTTGCTGGAG 688
| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
hg01666 801 TCCGCGCTGACCCGCCGCGCCGCGCCGCGCACTGGCCGCAGCTGCTGGAG 850
R A D P P R R A A H W P Q L L E
851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
A V R L P F V R R F Y L L A H V E
mpg00435 689 GCTGTGCGCCTGCCCTTCGTGCGCCGCTTCTACCTGCTGGCACACGTGGA 738
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||
hg01666 851 GCCGTGCGCCTGCCCTTCGTGCGCCGCTTCTACCTGTTGGCGCACGTCGA 900
A V R L P F V R R F Y L L A H V E
901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
A E P L V A R C P P C L R L L R E
mpg00435 739 GGCCGAGCCACTGGTGGCGCGCTGCCCACCTTGCCTGCGCCTGCTGCGCG 788
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
hg01666 901 GGCCGAGCCGCTGGTGGCGCGCTGCCCACCCTGCCTGCGCCTGCTGCGCG 950
A E P L V A R C P P C L R L L R E
951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
A R D F Q A A R Y D R H D R G P
mpg00435 789 AGGCCCGCGACTTCCAGGCGGCTCGCTACGACCGGCACGACCGCGGGCCC 838
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
hg01666 951 AGGCGCGCGACTTCCAGGCGGCGCGCTACGACCGCCACGACCGCGGGCCC 1000
A R D F Q A A R Y D R H D R G P
1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
C P R M R P R P S T G L A E I L V
mpg00435 839 TGCCCCCGCATGCGTCCGCGCCCGTCCACCGGCCTGGCCGAGATCCTGGT 888
|| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||
hg01666 1001 TGTCCCCGAATGCGTCCTCGCCCGTCCACCGGTCTCGCCGAGATCCTCGT 1050
C P R M R P R P S T G L A E I L V
1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
L V G G C D Q D C D E L V T V D C
mpg00435 889 GCTGGTGGGAGGTTGTGACCAGGACTGCGACGAGCTGGTTACGGTCGACT 938
||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||
hg01666 1051 GCTCGTGGGCGGCTGCGACCAGGACTGTGACGAGCTGGTCACTGTCGACT 1100
L V G G C D Q D C D E L V T V D C
1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
Y N P Q T G Q W R Y L A E F P D
mpg00435 939 GCTACAATCCGCAGACCGGCCAGTGGCGTTACCTGGCCGAGTTCCCCGAT 988
||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||
hg01666 1101 GCTACAACCCGCAGACGGGTCAGTGGCGCTACCTGGCCGAGTTCCCAGAC 1150
Y N P Q T G Q W R Y L A E F P D
1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
H L G G G Y S I V A L G N D I Y V
mpg00435 989 CACTTAGGTGGGGGCTATAGTATCGTGGCTCTGGGCAACGACATCTACGT 1038
||| | || || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||
hg01666 1151 CACCTGGGCGGAGGCTACAGCATCGTGGCGCTGGGCAATGACATCTACGT 1200
H L G G G Y S I V A L G N D I Y V
1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
T G G S D G S R L Y D C V W R Y N
mpg00435 1039 GACGGGCGGGTCTGATGGCTCCCGGCTCTATGACTGCGTGTGGAGATACA 1088
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
hg01666 1201 GACGGGTGGGTCCGATGGCTCCCGGCTCTATGACTGCGTGTGGAGGTACA 1250
T G G S D G S R L Y D C V W R Y N
1251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1300
S S V N E W T E V A P M L K A R
mpg00435 1089 ATTCGAGTGTGAACGAGTGGACGGAGGTGGCACCCATGCTCAAGGCCCGA 1138
| || || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||
hg01666 1251 ACTCAAGCGTGAATGAGTGGGCGGAGGTGGCGCCCATGCTGAAGGCCCGC 1300
S S V N E W A E V A P M L K A R
1301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1350
E Y H S S S V L D G L L Y V V A A
mpg00435 1139 GAGTACCACAGCTCCTCAGTGCTAGACGGCCTTCTGTATGTGGTGGCAGC 1188
||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||
hg01666 1301 GAGTACCACAGCTCCTCTGTGCTGGACGGACTGCTGTACGTGGTGGCCGC 1350
E Y H S S S V L D G L L Y V V A A
1351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1400
D S T E R Y D H A T D S W E A L Q
mpg00435 1189 CGACAGCACGGAGCGCTATGACCATGCCACCGACTCCTGGGAGGCACTGC 1238
||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||
hg01666 1351 CGACAGCACCGAGCGCTATGACCACACCACTGACTCCTGGGAGGCCCTGC 1400
D S T E R Y D H T T D S W E A L Q
1401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1450
P M T Y P M D N C S T T A C R G
mpg00435 1239 AGCCCATGACCTACCCCATGGACAACTGCTCTACCACTGCCTGCCGAGGC 1288
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||
hg01666 1401 AGCCCATGACCTACCCCATGGACAACTGCTCCACCACTGCGTGCCGTGGC 1450
P M T Y P M D N C S T T A C R G
1451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1500
R L Y A I G S L A G K E T M V I Q
mpg00435 1289 CGACTCTATGCCATTGGCTCCCTGGCAGGCAAGGAGACCATGGTGATACA 1338
|| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
hg01666 1451 CGGCTCTATGCCATCGGCTCCCTGGCTGGCAAGGAGACCATGGTGATGCA 1500
R L Y A I G S L A G K E T M V M Q
1501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1550
C Y D P D T D L W S L V N C G Q L
mpg00435 1339 GTGCTATGACCCAGACACTGATCTGTGGTCGCTGGTGAACTGTGGCCAGC 1388
|||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||
hg01666 1501 GTGCTACGACCCGGACACCGACCTGTGGTCGCTGGTGGACTGCGGCCAGC 1550
C Y D P D T D L W S L V D C G Q L
1551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1600
P P W S F A P K T V T L N G L M
mpg00435 1389 TCCCACCGTGGTCCTTTGCGCCCAAGACTGTGACTTTGAATGGACTCATG 1438
|||| || |||||||| || |||||||||| |||| | || |||||||||
hg01666 1551 TCCCGCCCTGGTCCTTCGCCCCCAAGACTGCGACTCTAAACGGACTCATG 1600
P P W S F A P K T A T L N G L M
1601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1650
Y F V R D D S A E V D V Y N P T K
mpg00435 1439 TACTTCGTCAGGGATGACTCTGCCGAGGTGGACGTCTACAACCCCACTAA 1488
||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |
hg01666 1601 TACTTTGTCAGGGATGACTCCGCTGAGGTGGACGTGTACAACCCGACGAG 1650
Y F V R D D S A E V D V Y N P T R
1651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1700
D E W D K I P S M N
mpg00435 1489 AGACGAATGGGACAAGATCCCATCCATGAAT................... 1519
||||||||||||||||||| |||||||||
hg01666 1651 GAACGAATGGGACAAGATCCCGTCCATGAATCAGGTAAATTTTCAGGCGG 1700
N E W D K I P S M N Q V N F Q A G
1701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1750
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 1701 GCCAGCATTGGAAGCACAGGCTGGTCCTGATTTTGCAACCCAAGTGTCAT 1750
Q H W K H R L V L I L Q P K C H
1751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1800
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 1751 CGTGATGAGTGTTTGGGATCCACAGCCATGATGGATGGGTCTCATCTCAA 1800
R D E C L G S T A M M D G S H L N
1801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1850
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 1801 TTAATAGAAGGCTGCTCTTACCCTTATTTTGCACTTAAGGCTCACTGAGA 1850
*
1851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1900
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 1851 CACAGATGTTAAGTAATACCCTATGATTACACAGCTTAGTACACATTTGA 1900
1901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1950
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 1901 GCAGTGTTTATTGAGTATCTGCTGTGAGCCAGAGAGCAGAAGGAAGTGAG 1950
1951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2000
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 1951 GGAGCAAGGCATACAGTCATCTGGGGACACCTGTTCCAGAGAGGGACAGC 2000
2001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2050
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2001 AGGTACAGAGGCCCTGCAGCAGGGCACCCTGGCGTGTTCTTAGATACACC 2050
2051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2100
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2051 AGCAGCCCATGTGGCCGGAGCAGAGTCAGCATGAGGTCTGTGACCTACCT 2100
2101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2150
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2101 TTTTTATTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG 2150
2151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2200
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2151 TGGTACAATCATGGCTCACTGCAGCCTCCACCTCCTTGACTCGCAGTCCT 2200
2201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2250
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2201 CCCACCGCACCTTCCTGAATAGCTGAGACTACAGGCGTGTGCCACCACAC 2250
2251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2300
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2251 CCAGTAATTTTTTTTCTCATATGTAGATACAAAAGGATATTCTTAAAATT 2300
2301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2350
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2301 TTTATAGAGACAGGGTCTTGCTGTGTTACCCAGGCTGGTCTCACACTCCT 2350
2351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2400
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2351 GGCCTCAAGTGACCCTCCTGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTATAG 2400
2401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2450
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2401 GCGTGAACCACCACGCCCAGCTGGTTCCTGAGGAAGTCAGTGTGGGAATA 2450
2451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2500
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2451 CTTTTTTTTTTTTTATACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 2500
2501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2550
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2501 AGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCATCTCCCAGGTTCACGCCA 2550
2551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2600
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2551 TTCTCCCGCCTCAACCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTACCCACCACC 2600
2601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2650
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2601 ACGCCCAGCTAATTTTGTTTGTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACT 2650
2651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2700
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2651 GTGTTAGCCAGGATGGTCTGGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGGCTC 2700
2701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2750
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2701 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCCCA 2750
2751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2800
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2751 CTGTGGGAATACTTGTGTTGAGCACTTGCTGTGTGTTCTGAATAGGACAA 2800
2801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2850
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2801 CCAGGGTCCACCCCTTCTCTCTGGGCTTGTTGAGAAGAGGGGTGCCCAGC 2850
2851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2900
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2851 CTGACAGTGATGGGACAGGGAGGCTTCAGTGCCATTTGGCCATGTGAGCA 2900
2901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2950
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2901 GTGTTAGTCTGAGGTACACATCATATTGCCTACAGCCTTCTTTCCTGTGT 2950
2951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3000
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 2951 GTCTGTTAACATTTCCAAACCTACACTCCGTGACATCCAGCCTCACAGCT 3000
3001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3050
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3001 TACATCACAGCTTAATGTCCTGGCATTTAAGAGACCCAGCGTTCTGTTTT 3050
3051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3100
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3051 CCCCGCAGTAAGCTGCACATAGTCATAGCGAATTTGGGAAAGATGGAAGG 3100
3101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3150
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3101 AATCATCCAGCCTCGCGGTTCAGAGCCCAGCTCTGCCACTGTCAGCCATG 3150
3151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3200
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3151 CAAGCCTCAGTTTTCCCATCTGTAACATGGGGAGAACAGCACTGCTCAGC 3200
3201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3250
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3201 CCAGAGGGCCACTGCAGAGATTCTGAGAGAGAACGTAGGAAGCGCTGCTC 3250
3251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3300
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3251 GGCACGACCTGCACACGGGGAGGCCTGGCGCTGCAGCGGGCACCCTCATC 3300
3301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3350
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3301 ACCATAGGGAAGGCCCAGCTGCCTCCGGGGAGGCCCGTTCTCCTAGGCAG 3350
3351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3400
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3351 GGTGTTGGAAAGGGGTTGGCCTCTCTGCTGCTTTCTGGGAGAGCCAAGGC 3400
3401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3450
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3401 CACCCCTCTGGGGTACTGACAGGGCATGCCTTGTCTCCAGTGGTTCCCCA 3450
3451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3500
mpg00435 1520 .................................................. 1520
hg01666 3451 GGTGGGGCCCTGCCCTACCCTCTCCTCTGACCTCCACTCACTCATCCCTT 3500
3501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3550
mpg00435 1520 .......CAGGTACACGTTGGGGGCAGCCTGGCCGTCCTGGGAGGCAAAC 1562
|||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |
hg01666 3501 TGGCCCACAGGTACATGTGGGGGGCAGCCTGGCCGTCCTTGGGGGGAAGC 3550
3551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3600
mpg00435 1563 TCTATGTCTCTGGGGGGTACGACAACACCTTTGAACTCTCGGACGTGGTG 1612
| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||
hg01666 3551 TGTACGTCTCTGGGGGATACGACAATACATTTGAACTCTCGGACGTGGTA 3600
3601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3650
mpg00435 1613 GAGGCATATGACCCAGAGACCCGGGCCTGGAGTGTGGTGGGGCGGCTTCC 1662
||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||
hg01666 3601 GAGGCCTATGACCCAGAGACTCGCGCGTGGAGCGTGGTGGGGCGGCTCCC 3650
3651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3700
mpg00435 1663 AGAGCCCACCTTCTGGCACGGCAGCGTGAGCATCTTCCGCCAGTTCATGC 1712
||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||
hg01666 3651 AGAACCCACCTTCTGGCATGGCAGTGTCAGCATCTTCCGCCAGTTCATGC 3700
3701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3750
mpg00435 1713 CACAGACACCGGCAGGGGGGCGTGGCTTCGAGCTGAACAGTGGTAGCAAT 1762
| ||||| | || ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||
hg01666 3701 CCCAGACCTTCTCGGGTGGGCGTGGCTTCGAGTTGGACAGTGGCAGCGAT 3750
3751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3800
mpg00435 1763 GACGTGGATGCAGGCTACCACAGGCTGCCACAGAACCCCGAGGAGCTGCA 1812
||| |||| ||||| | | ||| ||| | | ||||||| ||||||||
hg01666 3751 GACATGGACCCAGGCCGACCCCGGCCGCCGCGGGACCCCGATGAGCTGCA 3800
3801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3850
mpg00435 1813 TTAGCCCAGGCCTGGCCCAGGGGAGGACCTTGGTGTAAGGGGCCTGGCAC 1862
|||||| | ||||||| || || ||| |||| ||| |||||||
hg01666 3801 CTAGCCCCAGTCTGGCCC.GGCACGGGCCTCGGTG.CAGGTAACTGGCAC 3848
3851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3900
mpg00435 1863 ..CTGCAGGGAAGTGGCTCCAGGGTGCTTAGTGAGCGCCTCAGTGTACT. 1909
|||| ||| |||| | | | | | | | | || ||
hg01666 3849 CTCTGCGGGGCAGTGCCCCACTCCTTTGTGCACAAGGACACGTTGGGCTC 3898
3901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3950
mpg00435 1910 .................................................. 1910
hg01666 3899 ACAGGAGGAGCACAGGCTCTTGGGTGGCGAAGCCAGCCCAGGATCCATTA 3948
3951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4000
mpg00435 1910 .GTGTAAAGGTTCTGTGTATTCAGGGCCTATGTCACAGCTTCTGGGGACT 1958
|| || | |||||| || || |||| ||| || | ||||
hg01666 3949 CCTGGAAGGTTTCTGTACCTTGAGAGCCTGAATCAGAGGCCGTCGGGAAC 3998
4001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4050
mpg00435 1959 AAATAAGGTGGTGGTGACCACCA.................TCATGAATCA 1991
|| | ||| | | |||| ||
hg01666 3999 GCCCTCCCTGCAGTTGAGGAAGAGCCACTTTCCTGCCAGCACATGTTTCT 4048
4051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4100
mpg00435 1992 GCCT.TCAGAAGTTACCCCCAGCTCGTAGCATCCAGCTCAC........T 2032
| | | || || ||||||| | || | ||||||||
hg01666 4049 GGGTCTTGGAGGTCACCCCCACCCCGCGGATCACAGCTCACCCACGCGGC 4098
4101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4150
mpg00435 2033 GTGCAGGGAGCCTCTCCTTGCCCTCTCCTGGGCCTGTGTGCTCCCAGGGC 2082
| || ||| | ||| | ||| | || | | || ||
hg01666 4099 GCACACCCCTCCTGCCGTTGTCATCTGCACCTACTTGTTCCCACCTTGGG 4148
4151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4200
mpg00435 2083 AGAAGGTCCTGTAATGGTAAGAAAGTGGCCTGGCTTGGAGCACTGGGAAT 2132
||| | || ||| | | | | | | |||| | || |
hg01666 4149 AGAGGACGATGACTTGGGAGGGACG....CGTGAAGGGAGAAGGGGTCCT 4194
4201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4250
mpg00435 2133 CAGGGAAAACAAAGGCTAGAGTGA......AGTGCTAAACTCCCCATCCA 2176
| | | ||| | | ||| || || || |
hg01666 4195 CCCATGAGGCTGAGGATGGCCTGAACCTGGAGCAGCGGACCAGGCAGACG 4244
4251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4300
mpg00435 2177 GTCCCAAGGCTCCTCCAATGCTGCAGGTAGAGAGGTG............. 2213
| | ||| ||| | | || || |||||||
hg01666 4245 GGCTGAAGTGGGGTCCCAAATTCCATGTCCAGAGGTGTGGGGAGCCTGCC 4294
4301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4350
mpg00435 2214 ........TTCACACCACTGTCGGGGTCTCACCGTATAGGAATTAAGTAC 2255
| | || ||| | ||| || || | | | | ||
hg01666 4295 TCCCTAGCTCCTGGCCCCTGCCAGGGGCTTACATCAAAACACCTCAGAGG 4344
4351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4400
mpg00435 2256 TAAGAC...............................TGAGCTGGTGGAC 2274
| | ||||| || |
hg01666 4345 GCTGCCCTCCAGAGGCTGCACCCAGAACAGTGGGACATGAGCAGGGGTGT 4394
4401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4450
mpg00435 2275 TGTCACAGTGTGAGTCCAAGCTCTGTCCCTATAGCA..CGTGTTCTTGCC 2322
| | | | | | | | | || ||||| | | | || |
hg01666 4395 GGGCTTGGAGGGTGAAGAGGATGTGGTCCTATCAGATGCTGGGCCTCCTC 4444
4451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4500
mpg00435 2323 TGGCAAGGAGGCCCTCCCTGGGACTCTCCTGGAGGACAGGGAGCAAAGCT 2372
| || | || | | | || | | | | | ||
hg01666 4445 AGCCATAGCCCCCTGCTCCTACCCCCTGACTGGCTCTTGCGTCCTCACCT 4494
4501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4550
mpg00435 2373 CACAGAGCTGGCTTGCTGTGGTGGCTCCTCGGGGGCCTCACTGACACTTA 2422
| || ||| | | || ||| | | || ||| |||||| |
hg01666 4495 CTCACCCTCTCCTTCCCG.GGAGGCCCTGGGAGGTGATCATTGACACCCA 4543
4551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4600
mpg00435 2423 GCTAA...............................GGGCCTGGGAGCAG 2441
|| || ||||||| | |
hg01666 4544 GCCAAGCAGACAGCTGCGGGTGCCCAAGCCCTTGCTGGGCCTGCGCGTGA 4593
4601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4650
mpg00435 2442 AGA...CCCCTGCTTCTAAAGAGAGCC....GAGTGGGGCGGCCCCAGCA 2484
|| || |||||||||||| || | | | || ||| |
hg01666 4594 GGAGTCCCACTGCTTCTAAAGGAAGTCCTGGGCAGGAGGTGGCTTTGGTG 4643
4651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4700
mpg00435 2485 CTTGGCCGTAGGTTTGAAAA.....GCTAGCTGACCTAGGATTTCTAGGG 2529
|||| | ||||||| || |||||| || |||
hg01666 4644 GTTGGTTCCAAAGTTGAAAATGCTTGCAGTTTGACCTTAGAAGAAGTGGG 4693
4701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4750
mpg00435 2530 .................................TCATAGGGCCAGGGACA 2546
| || | |||| |
hg01666 4694 AAGAAGAAGGAGCTCTACAGGGTCAGCTTTGTTTGATTTGTCCAGTCTAA 4743
4751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4800
mpg00435 2547 CAAGTACTAGGGCACCTG...................GACCACAGCTTAG 2577
|||| | | || | || |||||| |
hg01666 4744 GAAGTCCCATTGCCAAAGCTTTCTGCAGGAGGGTGAATGCCGCAGCTT.G 4792
4801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4850
mpg00435 2578 GGGATCCCTGGGTTTCTTTGTGACTTTGAGTGGTTTCATGAGTTTGGGAG 2627
| |||||||||||| | || | | | |||||
hg01666 4793 GCAGCCCCTGGGTTTCTCTTGGAAATGG..........TCAGTTTCCCCT 4832
4851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4900
mpg00435 2628 CTGAGACCCCCTTGTAACCGGTGGGTTTGCCTGGGGTTTGTTATCTTTTG 2677
| || ||| ||| || | | | | | | || |||
hg01666 4833 CAAAGTACCCAAAGTAGCCTTGGCTTGAGTTTTTGTCCTTGCCTCCTTTT 4882
4901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4950
mpg00435 2678 GGGGGAAGAGGCCATTAGGACTTTTTGTT...........ATAGACAAAG 2716
| ||||||| |||| |||| | || | | ||||
hg01666 4883 TAGAGAAGAGGGCATTTAGACTGCATTTTCCTGGTTAAAGAAGGTTAAAG 4932
4951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5000
mpg00435 2717 CCAAAGTTCAGAGTTGCCTTTTTCTAGTGAACTCAAGGGCAGATGAGGCT 2766
| || ||| | | | |||||||||||||| | | ||| |
hg01666 4933 CAAATGTTTA....TTGCCTTTTCTAGTGAACTAACTCGTAGAGATGTTC 4978
5001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5050
mpg00435 2767 CTAGGAACAGAAGTTTCTATCCCATCACA..........TGCCTACTGCT 2806
|| | | | ||| | | || ||| |
hg01666 4979 TCAGCAGGAAGACAGTCTTAGCACTGTCACTTAGCAGATTGCACTTAAGT 5028
5051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5100
mpg00435 2807 GCCTTCT..TGTCCAGCTGGCAGAGGGGGCTGCCTTA............. 2841
|||| | || |||| |||| | || |||||||
hg01666 5029 CCCTTGTGCTGGCCAGATGGCGTGGCTGGTTGCCTTAATATGTCCCAGGA 5078
5101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5150
mpg00435 2842 .................................................. 2842
hg01666 5079 CCCCTGACAGGGCTGCCTGGCCTCTCCCTCGTGCTCCTCAAGAGCCCAGT 5128
5151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5200
mpg00435 2842 ..................ATTTCCTCCTGTTTTGAAAGCCATGTTCTAGA 2873
||| | | | || | ||| | ||| |||||
hg01666 5129 CCATACACTGTGGATGTCATTGCTGTCGGGTTAGGAAGTCTTGTCCTAGA 5178
5201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5250
mpg00435 2874 ATGCTCTGCTGG...................................... 2885
| || ||| |
hg01666 5179 ACGCCCTGGCTGGTATGACCACAGTTCATGGCGGCTCTTCTCGCTTGGGT 5228
5251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5300
mpg00435 2886 ...............GCACCTGACTCTGGGAAAGATGGTAGGTAGAGGGC 2920
||||||| | | ||| | ||||
hg01666 5229 CATGGTCATCTTCCAGCACCTGCTGTGCTGGGAAGGCCGAGGATGGGGGC 5278
5301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5350
mpg00435 2921 AGTGCTCTCCCAACCGATGCCCGCTGGTGACCTAGGGTTCCCTTGGGGAT 2970
|| || | | ||| | || | | || | | ||
hg01666 5279 CCAGCACTGTCCAGGCCTGCTGGGGCCTGGCTGGGAGTCCTGTGGGCAGC 5328
5351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5400
mpg00435 2971 GTGTGGGTTAGGGTTAGGCTT............................. 2991
|| | | | |||||
hg01666 5329 ATGGAACATGCAGCTGGGCTTCCTGTGACCAGGCACCCTCTGGCACTGTT 5378
5401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5450
mpg00435 2992 .....................GTTTCATTTTCTGGTGCCACCAACCCATC 3020
|||| | || | | || | |
hg01666 5379 GCTTGCCCTGTGCCCTGGACCTTTTCCTGCCCTTCTCCTTCCTCTGCTCC 5428
5451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5500
mpg00435 3021 CTTCCAGCGAGTGCTTTCTTTTCTCTGAACCTTAAAAAGAGCTGCCTCCC 3070
||| || | ||| ||| | | ||| || ||||
hg01666 5429 CTTGGGGCTACCCCTTGGCCCCTCCTGGTCTGTGCAAA...CTCCCTCAG 5475
5501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5550
mpg00435 3071 AG.GGCCACCAGAGTTGTCGCTCT...............GCTATGGAGTG 3104
| | || || | ||| ||||| | || | |
hg01666 5476 GGAGCCCCCCTGCCCTGTAGCTCTCGCTTAACTTCCTAGGGGCTGCTGAG 5525
5551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5600
mpg00435 3105 CCTTGCCACAGCAGGGTGGGGTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 3154
|| ||| || | ||| || | | | | | ||| | | |||
hg01666 5526 CCCACCCAGAGGTTGTTGGAGTTCAGCGGGGCAGCTTGTCTCCCT.TGTC 5574
5601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5650
mpg00435 3155 TGTGTGTGTGTGTGTG.TGTGTGTG......................... 3178
| | | || | | || || ||
hg01666 5575 AGCAGGGGCGTAAGGGCTGGGTTTGGCCATACAAGGTTGGCTACGCCCTC 5624
5651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5700
mpg00435 3179 .................................................. 3179
hg01666 5625 AATCCCTGACCGTTCCAGGCACTGAGCTGGGCACCCACGGAAGGACATGC 5674
5701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5750
mpg00435 3179 .....TGTGTGTTGTGTATGGAGTGCCTTGCCACAGCAGGGTGGGGTCCT 3223
| ||| || || | | || | || | || | |
hg01666 5675 TGTCCAGACTGTGATGACTGCCAGCACAGGGCATCTCGGGCTTGGCTGGT 5724
5751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5800
mpg00435 3224 GTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAGTACC 3273
|| | || |||| | || || ||| | |||||
hg01666 5725 CTGCGAGGCCTTGCCCCTGTGGAACTCTGGGTTCCTGTTTTCTCAGTCTT 5774
5801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5850
mpg00435 3274 GAGGACAGTGTTGTTCAGTCCTCTTGGGGACAGGCTAGGAGGCTTTCCAG 3323
| | ||| | | | | | || | | | |
hg01666 5775 TTTTGCGGCTTTGCTGTGGTTGGCAGCTGCCGTACTCCAGGCTTGTGTCG 5824
5851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5900
mpg00435 3324 AGGAAGGACACGA....CCTGCAGCAATTAACTGCAGGATAGTGCACACT 3369
| | | || || || | | ||||||| || | ||
hg01666 5825 GCCACTCAGATGAGGGCTGTGGTGCGAGCCAGTGCAGGAGAG.CTGCGCT 5873
5901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5950
mpg00435 3370 TGCACAGGGCCCCTCTGCCCTG......CTCCAGAGCTACTCAGGTTTCC 3413
|| | |||||| | || |||| || |||| ||||| |||
hg01666 5874 TGGGATTGTGCCCTCTCCTGTGTCTGTCCTCCGGACCTACCCAGGTCTCC 5923
5951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6000
mpg00435 3414 A.CATCAGGGCCC...........CTCCAAAACTAAGGATAGTAAGAA.. 3449
| ||||||| ||| | || || ||| || | | ||
hg01666 5924 ACCATCAGGACCCTGTCTTTGGGTTTAGAAGACCAAGTATGGGGAAAACC 5973
6001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6050
mpg00435 3450 ...................................TTGTAAGCACTTTGT 3464
||| ||| |
hg01666 5974 AGGCACCAGCCTCTGCAGCAATGGGTCCCTCTAGCCTGTGGACACCAGCT 6023
6051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6100
mpg00435 3465 GTGCCCACCGGGAGTCCAGGACTGTCCCTCCCTGGGCGTCACCTCTGCCA 3514
| | || || |||| | |||| | | |||||||
hg01666 6024 GGGGGATCCAGG..GTCAGGCCCCCTCCTCTCCCCAGTTTCCCTCTGCTG 6071
6101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6150
mpg00435 3515 CTGGCTCTGGGCTGTAA....CCCACTGCTTATCACATGTCTCTACACTA 3560
|| |||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||
hg01666 6072 TGGGTTCTGGGCTGTCATGTCTCCACCACTTA.AGGATGTCTTTACACTG 6120
6151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6200
mpg00435 3561 AC..AGGGATTGAAGCTGGGCCACCTGGGTATGGGATTGTCCCTGTCACA 3608
|| |||| || | |||| |||||| |||| | ||| |||
hg01666 6121 ACTTCAGGATAGATGTTGGGATGCCTGGGCATGG....CCACATGTTACA 6166
6201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6250
mpg00435 3609 TGTACAAAGCTTTTATATGTTAGGACAAAACTTAAGTTATGAGAGAAGTT 3658
|||||| | |||| || || || ||||||||| | ||
hg01666 6167 TGTACAGAACTTT....GTCTACAGCACAAATTAAGTTAT...ATAAACA 6209
6251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6300
mpg00435 3659 CTGTGCCTAGTATTGA..........TCTATAAGGGATTTTTCTTATATT 3698
| ||| || ||||| | |||||||| ||| | ||| |
hg01666 6210 CAGTGACTGGTATTTAATGCTGATCTACTATAAGGTATTCT..ATATTTA 6257
6301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6350
mpg00435 3699 TATGACTTGAGAGAC...TTAGGAAGACTGCCTGCCTGCCTTAGGAAGGC 3745
|||||||| |||||| | | || | | ||| || | | |
hg01666 6258 TATGACTTCAGAGACGCGTATGTAATAAAGGACGCCCTCCCTCCAGTGTC 6307
6351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6400
mpg00435 3746 GGCACTCAGT...CACCAGTGGCT.GGGCAGATTTGTATATTTATTTTTG 3791
|| |||| | |||| || | |||||| || |||||||||||||
hg01666 6308 CACATCCAGTTCACCCCAGAGGGTCGGGCAGGTTGACATATTTATTTTTG 6357
6401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6450
mpg00435 3792 TCTGTTCTGTA.GCTTCTGTGTCCAGCATCCTG....AGGTCTTAGGGT. 3835
||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||
hg01666 6358 TCTATTCTGTAGGCTTCCATGTCCAGAATCCTGCTTAAGGTTTTAGGGTA 6407
6451 ----+----*----+----*----+----*----+----*--- 6493
mpg00435 3836 GCTTCCCTAATTTTTGAAATAAAA.TGTTTCCTAT........ 3869
|||| || |||||| ||||||| | ||||||||
hg01666 6408 CCTTCAGTACTTTTTGCAATAAAAGTATTTCCTATCCATTTGG 6450