FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4032.ptfa, 749 aa vs ./tmplib.26680 library 1768268 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2474+/-0.00468; mu= 20.3660+/- 0.314 mean_var=101.8304+/-23.655, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 43 in 1/35 Lambda= 0.1271 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0214 ( 776 res) mbg06117 ( 776) 3312 618 9e-178 >>mKIAA0214 ( 776 res) mbg06117 (776 aa) initn: 3259 init1: 2524 opt: 3312 Z-score: 3283.9 bits: 618.4 E(): 9e-178 Smith-Waterman score: 3312; 66.306% identity (66.757% ungapped) in 739 aa overlap (9-745:40-775) 10 20 30 mKIAA4 GKALSRCIMAET-VSPLKHFVLAKKAITAIFGQLLEFV :::. .::::::: ::: :..:: :: .. mKIAA0 CEGLLPARNEMSLLFSRCNSIVTVKKDKRHMAEVNASPLKHFVTAKKKINGIFEQLGAYI 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA4 TEGSHFVEATYRNPELDRIASEDDLVEIQGYRNKLAVIGEVLSRRHMKVAFFGRTSSGKS :.. :.: :.:: ::: ...:.......:: .:. :.:::.:::::::::::::.::: mKIAA0 QESASFLEDTHRNTELDPVTTEEQVLDVKGYLSKVRGISEVLARRHMKVAFFGRTSNGKS 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 SVINAMLWDKVLPSGIGHTTNCFLSVEGTDGDKAYLMTEGSDEKKSVKTVNQLAHALHMD .::::::::::::::::::::::: : :::: .:.:.::::.::::::::::::::::.: mKIAA0 TVINAMLWDKVLPSGIGHTTNCFLRVGGTDGHEAFLLTEGSEEKKSVKTVNQLAHALHQD 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 KDLKAGCLVHVFWPKAKCALLRDDLVLVDSPGTDVTTELDIWIDKFCLDADVFVLVANSE ..:.:: .: :.::..:: ::.:::::.:::: ::::::: ::::::::::::::::::: mKIAA0 EQLHAGSMVSVMWPNSKCPLLKDDLVLMDSPGIDVTTELDSWIDKFCLDADVFVLVANSE 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 STLMNTEKHFFHKVNERLSKPNIFILNNRWDASASEPEYMEDVRRQHMERCLHFLVEELK ::::.:::.:::::.::::.:::::::::::::::::::::.::::::::: :::.:: mKIAA0 STLMQTEKQFFHKVSERLSRPNIFILNNRWDASASEPEYMEEVRRQHMERCTSFLVDELG 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 mKIAA4 VVSPSEARNRIFFVSAKEVLNSRKHKAQGMPEGGGALAEGFQARLQEFQNFEQTFEECIS ::. ..: .:::::::::::..: .:::::::::::::::::.:. ::::::. :::::: mKIAA0 VVDRAQAGDRIFFVSAKEVLSARVQKAQGMPEGGGALAEGFQVRMFEFQNFERQFEECIS 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 QSAVKTKFEQHTIRAKQILDTVKNILDSVNVAAAEKRVYSMEEREDQIDRLDFIRNQMNL ::::::::::::.::::: ..:. :.::...:: :.::: .: ::.. ::: :: .:..: mKIAA0 QSAVKTKFEQHTVRAKQIAEAVRLIMDSLHIAAQEQRVYCLEMREERQDRLRFIDKQLEL 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 LTLDVKKKIKEVTEEVANKVSCAMTDEICRLSVLVDEFCSEFHPTPSVLKVYKSELNKHI :. : : .::..:::: .:: ::..:: ::::::::. .:::.: ::::::.::..:: mKIAA0 LAQDYKLRIKQITEEVERQVSTAMAEEIRRLSVLVDEYQMDFHPSPVVLKVYKNELHRHI 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 EDGMGRNLADRCTNEVNASILQSQQEIIENLKPLLPAGIQNKLHTLIPCKKFDLSYDLNC :.:.::::.:::.. . .:. ::..:..::::::....:.. :.: . :.::::::: mKIAA0 EEGLGRNLSDRCSTAIASSLQTMQQDMIDGLKPLLPVSMRNQIDMLVPRQCFSLSYDLNC 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 mKIAA4 HKLCSDFQEDIVFRFSLGWSSLVHRFLGSTNAQRVLLGLSEPIFQVPRSLASTPTAPSNP :::.:::::: :.:::::. ::.:::: :..:.::: :. :: : : ::. :: : mKIAA0 DKLCADFQEDIEFHFSLGWTMLVNRFLGPKNSRRALLGYSD---QVQRPLPLTPANPSMP 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 AAPDNA-AQEELMITLITGLASLTSRTSMGIIVVGGVIWKTVGWKLISVTLSMYGALYLY :... .:::::....::::::::::::::.:::::.::.:::.::......:: ::.: mKIAA0 PLPQSSLTQEELMVSMVTGLASLTSRTSMGILVVGGVVWKAVGWRLIALSFGLYGLLYVY 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 ERLTWTTRAKERAFKQQFVNYATEKLQMIVSFTSANCSHQVQQEMATTFARLCQQVDVTQ :::::::.:::::::.:::.::.::::.:.:.:..:::::::::.. :::.::::::.:. mKIAA0 ERLTWTTKAKERAFKRQFVEYASEKLQLIISYTGSNCSHQVQQELSGTFAHLCQQVDITR 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 mKIAA4 KHLEEEIARLSKEIDQLEKIQNNSKLLRNKAIQLESELENFSKQFLHPSSGES .::.::: ..:... :...:. .::::::: :.:::. :..:.:.:: mKIAA0 DNLEQEIAAMNKKVEALDSLQSRAKLLRNKAGWLDSELNMFTHQYLQPSR 730 740 750 760 770 749 residues in 1 query sequences 1768268 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:59:43 2006 done: Mon Mar 27 10:59:44 2006 Scan time: 0.880 Display time: 0.050 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]