FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0904.ptfa, 1051 aa vs ./tmplib.26680 library 1767966 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.7238+/-0.0098; mu= -34.7299+/- 0.643 mean_var=664.3819+/-165.268, 0's: 0 Z-trim: 30 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0498 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452) 2659 207 2.2e-53 mKIAA0834 ( 453 res) mpg00938 ( 453) 512 52 2.2e-07 mKIAA1028 ( 546 res) mbg03568 ( 546) 468 49 2.3e-06 mKIAA0936 ( 503 res) mic27001 ( 503) 333 39 0.0018 mKIAA1901 ( 1234 res) mpg03874 (1234) 343 40 0.0022 >>mKIAA1791 ( 1452 res) mpm08259 (1452 aa) initn: 2712 init1: 2240 opt: 2659 Z-score: 1050.7 bits: 206.5 E(): 2.2e-53 Smith-Waterman score: 2743; 49.950% identity (56.109% ungapped) in 993 aa overlap (106-1051:522-1452) 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 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: . : ... . : : ..: mKIAA0 DL------PPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNNSYGKSLSNSKH 410 420 430 440 450 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 NNSPAPPQPAPVKAEPGPGDAVGLGDITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNI >>mKIAA1028 ( 546 res) mbg03568 (546 aa) initn: 582 init1: 201 opt: 468 Z-score: 206.6 bits: 48.9 E(): 2.3e-06 Smith-Waterman score: 658; 31.683% identity (38.369% ungapped) in 505 aa overlap (293-739:59-533) 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 ITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGI-IGEGTYGQVYKAKDKDT .: : :. : .:.::::.::::. :: mKIAA1 LSGGGPRVPVSLWGKQTMDYDFKAKLAAERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKARRKDG 30 40 50 60 70 80 330 340 350 360 370 mKIAA0 GE--LVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLVHQSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKG . :::.. : :. ..: ::: .::.: : .:. .... ...: .: mKIAA1 KDEKEYALKQI----EGTGISMSACREIALLRELKHPNVIALQKVFLSHSD----RK--- 90 100 110 120 130 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 AFYLVFEYMDHDLMGLLE--------SGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLDYCHKKNFLHRD .:.:.: .::: ... . ... .. .::.. :...:. : : . :::: mKIAA1 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mKIAA0 KPSPPFFPSLHNKNLQPKILASLEQKNGEIKPKSRRRWGLISRSTKGSDDWADLDDLDFS 240 250 260 270 280 290 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 PSVPVVLPPAEQTTPEASNTPADMQNVLAVLLSQLMKTQEPAGNLEENTNDKNSGPQGPR ::. . ... ....: ...:: .: .: .:. .:. .... . : mKIAA0 PSLTRI--DVKNKKRQSDDTLCRFESVLD------LKPSESVGT---GTTVSTQASSQRR 300 310 320 330 340 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 RTPTMPQEEAAEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDLSSAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAE :::. mKIAA0 DTPTLQSSAKQHYLKHSRYLPGINIRNGVLPNPGKDFLPSNSWSSSGLSGKSSGTVSVVS 350 360 370 380 390 400 >>mKIAA1901 ( 1234 res) mpg03874 (1234 aa) initn: 201 init1: 170 opt: 343 Z-score: 153.1 bits: 40.2 E(): 0.0022 Smith-Waterman score: 354; 28.616% identity (32.270% ungapped) in 318 aa overlap (296-606:4-292) 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 PQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELV ..:. . ::::..:.. .:. . :. mKIAA1 EGTMEKYVRLQKIGEGSFGKAVLVKSTEDGRHY 10 20 30 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLVHQSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVF ..:.. .. .. . ::. .: .. : ..:..:: .:... :..:.:. mKIAA1 VIKEINISRMSDKERQESRREVAVLANMKHPNIVQYKE---------SFEEN-GSLYIVM 40 50 60 70 80 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 EYMDH-DLMGLL--ESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNS .: . ::. . ..: . :.::.: ... :. .: . : ...:::::: .::.:... mKIAA1 DYCEGGDLFKRINAQKGAL-FQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKD 90 100 110 120 130 140 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 GQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF : ..:.:::.::. :: : . : .: ::. .. :. :.:. ::.: :: mKIAA1 GTVQLGDFGIARVLNSTVELARTC-IGTPYYLSPEICENKP-YNNKSDIWALGCVLYELC 150 160 170 180 190 200 510 520 530 540 550 mKIAA0 TKKPIFQA-NLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKP--KKQYRRRLREEFS : : :.: :.. :..:: :: : : : : .. .. ..: :.. mKIAA1 TLKHAFEAGNMKNLVLKIIS---GS-FPPVSPH-----YSYDLRSLLSQLFKRNPRDR-- 210 220 230 240 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 FIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDF-LKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKK ::. ..:.. . .. . : . .: :: :::..: :: mKIAA1 --PSVN-SILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKT--LSKFGPQPLPGKRPASGQGVSS 250 260 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