FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1626.ptfa, 1241 aa vs ./tmplib.26680 library 1767776 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9164+/-0.00568; mu= 9.6495+/- 0.379 mean_var=165.3791+/-38.764, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0997 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0294 ( 1324 res) mbg02039 (1324) 2994 444 9.5e-125 mKIAA0337 ( 1082 res) mbg04504 (1082) 538 90 2e-18 mKIAA1066 ( 1328 res) mbg07245 (1328) 382 68 1.3e-11 mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 ( 919) 370 66 3.3e-11 mKIAA0516 ( 1195 res) mbg07952 (1195) 362 65 8.8e-11 mKIAA1415 ( 1665 res) mib23074 (1665) 304 57 3.6e-08 mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059) 290 55 1.1e-07 mKIAA1362 ( 1407 res) mia41047 (1407) 270 52 9.6e-07 mKIAA1256 ( 1539 res) mbg11030 (1539) 270 52 1e-06 mFLJ00018 ( 1372 res) mpm05346 (1372) 263 51 1.9e-06 mKIAA3017 ( 710 res) mph02030 ( 710) 236 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::::: . : : ::: . . : :: . ..: .: mKIAA1 LSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGE-DGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVNDRVWC 1000 1010 1020 1030 1040 1050 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 SCGPRVTVLDAATLQTQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGSSIRLFHTETLEH . .: :.. :.: ..::.:: . .: ... :.:::... :..::.:..: .: mKIAA1 GYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQH 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 LQEINIATRTTFLLP----GQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKIT ::...: .. .: : . . .:.::: . ::::: .::.. .:. : . . mKIAA1 LQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLIAGNRLWVGTGNGVVISIPLT--ETV--VL 1120 1130 1140 1150 1160 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA1 GKGMVSLNGHCGPVAFLAVAMSILAPDILRSDQEEAEGPQAEEDKPDGQAHETVPGPDSH .:. : : ::... . .: .: : : : : :: mKIAA1 HRGQ--LLG-------------------LRANKTSPTS--GEGTRPGGIIH--VYGDDSS 1170 1180 1190 1200 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA1 TARELTRKKGILLQYRLRSTAHL--PGPLLSVREPAPADGSALEHSEEDGSIYEMADDPD . . .. : . :.: : .:. . . :..: . .::. :.:. mKIAA1 D-----KAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVL--ATLNGSVL---DSPS 1210 1220 1230 1240 1250 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA1 VWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRHFGGAPG---------GLSGRAAPC-SETD : ::. ... .. ..:::.:: : . : : ... : :... mKIAA1 EGPGPAAPAADAEGQKLKNALVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEECAGDVNQTKPSLSKAE 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1230 1240 mKIAA1 -STLLIWQVPLAL : ...::: mKIAA1 RSHIIVWQVSYTPE 1320 >>mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 (919 aa) initn: 272 init1: 150 opt: 370 Z-score: 293.5 bits: 66.0 E(): 3.3e-11 Smith-Waterman score: 373; 28.435% identity (31.119% ungapped) in 313 aa overlap (269-574:451-743) 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 KDVLGDSEEEDMGLLEVGVTDIKPPAPELGPMPDGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVES :.: :.: .: .. . :.:..::. mKIAA4 SLLDISNTPESSIHYGETPKSCAKSSRSSTPVP----PKQSARWQVAKELYQTESNYVNI 430 440 450 460 470 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 LKRILQDYRNPLMEMEPKA---LSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTE : :.: .. :: : .. :. .. ...: . .:. : .. : . .:.:: .. mKIAA4 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.: . mKIAA1 ALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEALEQLQSHIEGWEGSN--LTDICTELLLQGNLLKISA 240 250 260 270 280 290 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 GDRGQLIKSKERRVFLLNDMLV-CANINFKGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVE :. .:: ::....:: : mKIAA1 GN------IQERAFFLFDNLLVYCKRKSRVTGSKKSTKRTKSINGSLYIFRGRINTEVME 300 310 320 330 340 >>mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059 aa) initn: 217 init1: 138 opt: 290 Z-score: 230.5 bits: 54.6 E(): 1.1e-07 Smith-Waterman score: 318; 24.457% identity (27.835% ungapped) in 552 aa overlap (18-543:219-729) 10 20 30 40 mKIAA1 AGPCLMASSNPPPQPAIGAPLAPSAPGPSPEVEEDSGEAFEFDDSDE : : : ::. ... : : :. mKIAA4 RFSYHLEGSQPRPGLHQGNRILVKSLSLDPGQSLEPHPEGPQ-RLRSDPGPPTEIPGPRP 190 200 210 220 230 240 50 60 70 80 90 mKIAA1 EEDTSSGLVVPGLAPERDTEPSLICFDTV--PGSDLDPAAAPPQTEAPTVV------SNG : .:: :. .:: . . : : . : . : : :. ... mKIAA4 ----SPLKRAPGPKPQVPPKPSYLQMPRVLPPPEPIPPPPSRPLPADPRVAKGLVPRAEA 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 DAVGAAISGVRRSSWKRK---SSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAERGLV .. .::.:.. .. .. .: : :. : .. . : . .. : .: . mKIAA4 STSSAAVSSLIEKFEREPVIVASDRPAPGPCPVPPEPAMLPQPPPQPTGSQLPEGEASRC 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 YEDVHRAGAPRETEDLGWSSSEFESYSEDSG-EET---KPEAEPTKHRGSFQPKMTQLMK . : .::. : . .: ..: : :. ::: . .. : . : .... mKIAA4 LFLL--APGPRDGEKVPNRDSGIDSISSPSNSEETCFVSDDGPPIHSLCPGPPALASMPV 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 AAKSGTRDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVGVTDIKPPAPELGPMPD : . : : ..: .: :::. : .: : : . mKIAA4 ALADPHRPG----------------SQEVDSDLEEEEEEEEEEKEREIPVPPMERQESVE 430 440 450 460 280 290 300 310 320 mKIAA1 GLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVV---FFR :. :: : :: . ..:.: .:: :. . : . :.: : . :. .:: : mKIAA4 -LTVQQKVF-HIANELLQTEKAYVSRLHLLDQVFCARLLE-EARNRSSFPADVVHGIFSN 470 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 VKEILHCHSMFQIA-LSSRVAEWDSTEKIGDLF--VASFSKSMVLDVYSDYVNNFTNAMS . : :..: . : .:. ::: .:::.. .: : : .:..::.:: :. mKIAA4 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