# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpf02083.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1729.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1729, 976 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7902666 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7812+/-0.000195; mu= 11.4635+/- 0.011 mean_var=99.2564+/-19.386, 0's: 38 Z-trim: 112 B-trim: 435 in 2/64 Lambda= 0.128734 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|212288560|sp|B2RRE4.1|Z518B_MOUSE RecName: Full (1077) 6514 1221.0 0 gi|148705613|gb|EDL37560.1| mCG141317 [Mus musculu (1082) 6514 1221.0 0 gi|109499843|ref|XP_573627.2| PREDICTED: similar t (1072) 5900 1107.0 0 gi|149047323|gb|EDL99992.1| rCG36096 [Rattus norve (1077) 5900 1107.0 0 gi|119613097|gb|EAW92691.1| hCG2026767 [Homo sapie (1020) 4567 859.4 0 gi|166979949|sp|Q9C0D4.2|Z518B_HUMAN RecName: Full (1074) 4561 858.3 0 gi|109073754|ref|XP_001098027.1| PREDICTED: simila (1072) 4552 856.6 0 gi|149702892|ref|XP_001501034.1| PREDICTED: zinc f (1074) 4519 850.5 0 gi|195546922|ref|NP_001124305.1| zinc finger prote (1081) 4471 841.6 0 gi|119924208|ref|XP_584181.3| PREDICTED: similar t (1078) 4327 814.8 0 gi|194668138|ref|XP_001788474.1| PREDICTED: simila ( 937) 4018 757.4 7.2e-216 gi|77681327|dbj|BAB71650.2| unnamed protein produc ( 633) 2824 535.5 3.1e-149 gi|126332012|ref|XP_001370820.1| PREDICTED: hypoth (1077) 1761 338.3 1.2e-89 gi|50747212|ref|XP_420787.1| PREDICTED: hypothetic (1074) 1282 249.3 7.4e-63 gi|224050104|ref|XP_002193148.1| PREDICTED: zinc f (1039) 1253 243.9 3e-61 gi|149642484|ref|XP_001512216.1| PREDICTED: simila (1150) 1141 223.1 6e-55 gi|56789766|gb|AAH88611.1| Kiaa1729 protein [Xenop ( 598) 486 101.3 1.5e-18 gi|47221678|emb|CAG10150.1| unnamed protein produc ( 145) 412 87.0 7.3e-15 gi|189542611|ref|XP_001922874.1| PREDICTED: simila ( 884) 359 77.8 2.6e-11 gi|149642509|ref|XP_001505825.1| PREDICTED: simila (1539) 340 74.5 4.5e-10 gi|125831442|ref|XP_001339026.1| PREDICTED: im:691 (1413) 332 73.0 1.2e-09 gi|50949959|emb|CAH10523.1| hypothetical protein [ (1483) 315 69.8 1.1e-08 gi|109896331|sp|Q6AHZ1.2|Z518A_HUMAN RecName: Full (1483) 315 69.8 1.1e-08 gi|149689802|ref|XP_001501837.1| PREDICTED: simila (1489) 311 69.1 1.8e-08 gi|118599853|gb|AAH30967.1| ZNF518A protein [Homo ( 348) 300 66.5 2.6e-08 gi|109090081|ref|XP_001100415.1| PREDICTED: simila (1481) 308 68.5 2.7e-08 gi|119917516|ref|XP_603021.3| PREDICTED: similar t (1482) 308 68.5 2.7e-08 gi|74204493|dbj|BAB28569.3| unnamed protein produc ( 370) 293 65.2 6.6e-08 gi|205831216|sp|B2RRF6.1|ZF518_MOUSE RecName: Full (1478) 293 65.7 1.8e-07 gi|194041773|ref|XP_001928172.1| PREDICTED: simila (1491) 292 65.6 2.1e-07 gi|80478067|gb|AAI09046.1| ZNF518A protein [Homo s ( 953) 284 63.9 4.2e-07 gi|109090087|ref|XP_001100329.1| PREDICTED: simila ( 954) 284 63.9 4.3e-07 gi|210124085|gb|EEA71783.1| hypothetical protein B ( 235) 247 56.5 1.8e-05 gi|189528266|ref|XP_001922907.1| PREDICTED: RE1-si ( 854) 253 58.1 2.1e-05 gi|119361502|sp|Q2EI20.1|REST_DANRE RecName: Full= ( 855) 250 57.6 3.1e-05 gi|210099698|gb|EEA47788.1| hypothetical protein B ( 235) 241 55.4 3.8e-05 gi|167857755|gb|ACA03866.1| NRSF/REST [Takifugu ru ( 954) 249 57.4 3.8e-05 gi|210128526|gb|EEA76203.1| hypothetical protein B ( 863) 248 57.2 4.1e-05 gi|210080447|gb|EEA29795.1| hypothetical protein B ( 790) 247 57.0 4.3e-05 gi|210121163|gb|EEA68877.1| hypothetical protein B ( 377) 242 55.8 4.7e-05 gi|210122083|gb|EEA69792.1| hypothetical protein B ( 632) 242 56.0 7e-05 gi|210112682|gb|EEA60457.1| hypothetical protein B ( 272) 237 54.7 7.1e-05 gi|73992538|ref|XP_543028.2| PREDICTED: similar to (1342) 246 57.0 7.3e-05 gi|210121079|gb|EEA68793.1| hypothetical protein B ( 181) 231 53.5 0.00011 gi|47229119|emb|CAG03871.1| unnamed protein produc ( 581) 237 55.0 0.00012 gi|210128647|gb|EEA76324.1| hypothetical protein B ( 214) 231 53.5 0.00013 gi|114682321|ref|XP_001160083.1| PREDICTED: hypoth ( 770) 238 55.3 0.00014 gi|10438918|dbj|BAB15379.1| unnamed protein produc ( 829) 238 55.3 0.00014 gi|210102415|gb|EEA50465.1| hypothetical protein B ( 218) 230 53.3 0.00015 gi|210099663|gb|EEA47753.1| hypothetical protein B ( 626) 236 54.8 0.00015 >>gi|212288560|sp|B2RRE4.1|Z518B_MOUSE RecName: Full=Zin (1077 aa) initn: 6514 init1: 6514 opt: 6514 Z-score: 6536.3 bits: 1221.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6514; 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