# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpf01376.fasta.nr -Q ../query/mKIAA4151.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA4151, 1916 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7891726 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1527+/-0.000212; mu= 6.1447+/- 0.012 mean_var=171.7040+/-34.349, 0's: 35 Z-trim: 178 B-trim: 1586 in 2/64 Lambda= 0.097878 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|149267531|ref|XP_001481110.1| PREDICTED: golgi (3230) 11943 1700.8 0 gi|187956399|gb|AAI50732.1| Golgb1 protein [Mus mu (3238) 11943 1700.8 0 gi|94400369|ref|XP_001001861.1| PREDICTED: similar (3201) 11804 1681.2 0 gi|149060541|gb|EDM11255.1| golgi autoantigen, gol (3187) 10886 1551.5 0 gi|516826|dbj|BAA05026.1| rat GCP360 [Rattus norve (3187) 10878 1550.4 0 gi|194222786|ref|XP_001916889.1| PREDICTED: golgin (3352) 8383 1198.1 0 gi|114588772|ref|XP_516685.2| PREDICTED: golgi 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(2252) 1414 213.9 1.4e-51 gi|68129234|emb|CAJ07774.1| hypothetical protein, (3167) 1042 161.5 1.2e-35 gi|9916|emb|CAA39663.1| liver stage antigen [Plasm (1909) 1006 156.2 2.8e-34 gi|189532603|ref|XP_685984.3| PREDICTED: im:715108 (15951) 988 154.6 7.1e-33 gi|121915630|gb|EAY20417.1| viral A-type inclusion (4263) 963 150.5 3.3e-32 gi|89284335|gb|EAR82385.1| Viral A-type inclusion (3812) 926 145.2 1.1e-30 gi|134068390|emb|CAM66680.1| kinesin K39, putative (2926) 882 138.9 7e-29 gi|121894265|gb|EAX99489.1| hypothetical protein T (2624) 866 136.6 3.1e-28 gi|121905960|gb|EAY10879.1| viral A-type inclusion (4057) 852 134.8 1.7e-27 gi|189523351|ref|XP_692550.3| PREDICTED: similar t (2775) 847 133.9 2.1e-27 gi|89296472|gb|EAR94460.1| DNA-directed RNA polyme (4331) 849 134.4 2.3e-27 gi|68125681|emb|CAJ04095.1| kinesin, putative [Lei (2257) 842 133.1 2.9e-27 gi|109075209|ref|XP_001110550.1| PREDICTED: simila (2665) 832 131.8 8.7e-27 gi|109075207|ref|XP_001110512.1| PREDICTED: simila (2701) 832 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