FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4041.ptfa, 1671 aa vs ./tmplib.26680 library 1767346 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7936+/-0.00597; mu= 10.1125+/- 0.395 mean_var=191.8175+/-45.927, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0926 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0279 ( 1484 res) meh01738 (1484) 4234 580 1.6e-165 mKIAA0812 ( 1147 res) mbg15128 (1147) 1742 247 2.3e-65 mKIAA0821 ( 1406 res) mbg08158 (1406) 812 123 6.5e-28 mKIAA0786 ( 891 res) mpm11105 ( 891) 808 122 7.1e-28 mKIAA0768 ( 1057 res) mbh03527 (1057) 675 104 1.8e-22 mKIAA4089 ( 1251 res) mbg12616 (1251) 588 93 6.2e-19 mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 316 56 5.1e-08 mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 ( 835) 306 55 1.1e-07 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 279 51 1.9e-06 mKIAA0533 ( 1702 res) mpf00729 (1702) 272 51 3.9e-06 mKIAA0868 ( 1399 res) mbg15527 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:.:::::: .: .:. : . :. : mKIAA0 DQGWLEPDLFNCTSPAFRELSLLLDGLELN 10 20 30 780 790 800 810 820 830 mKIAA4 ETRMDGNRSLRLAKALRNATQGNSTLFGNDVRTAYQLLARILQHESRQQGFDLAATREAN .: .: .. .::. ::..: .. :..:::.. .::: .: ::.:::: :.::..:. mKIAA0 KTALDTVEAKKLAQRLREVTGQTDHYFSQDVRVTARLLAYLLAFESHQQGFGLTATQDAH 40 50 60 70 80 90 840 850 860 870 880 mKIAA4 FHEDVVHTGSALLAPATEASWEQI-QRSEA---GAAQLLRHFEAYFSNVARNVKRTYLRP :.:... .::::::: : : . ::. . :.: :..:.: : ...:::.. ::: : mKIAA0 FNENLLWAGSALLAPETGHLWAALGQRAPGGSPGSAGLVQHLEEYAATLARNMELTYLNP 100 110 120 130 140 150 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 FVIVTANMILAVDIFDKLNFT-GAQ-VPRFED--IQEELPRELESSVSFPADTFKPPEKK .:: :..:..: ... . : ::. ::... .. . . .. : .:... .: .. mKIAA0 VGLVTPNIMLSIDRMEHPSSTQGARRYPRYHSNLFRGQDAWDPHTHVLLPSQASQPSPSE 160 170 180 190 200 210 950 960 970 980 990 1000 mKIAA4 EGPVVRLTNRRTTPLTAQPEPRAERETSSSRRRRHPDEPGQFAVALVVIYRTLGQLLPEH :. .. :. ...: : :. ::: ........::.:: ::: . mKIAA0 VLPTSSNAENATASSVVSPPAPLEPES----------EPG-ISIVILLVYRALGGLLPAQ 220 230 240 250 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. . :. .. mKIAA4 REHLAKAQRGLPGEGVSEVIQTLLEISQ-DGTSYSGDLLSTIDVL-RNMTEIFRRAYYSP 320 330 340 350 360 830 840 850 860 870 880 mKIAA4 AATREANFHEDVVHTGSALLAPATEASWEQIQRSEAGAAQLLRHFEAYFSNVARNVKRTY . :: :. : ::: .. .::. : .: .:.: : . . .. .: mKIAA4 TPGDVQNF----VQIISNLLAEENRDKWEEAQLMGPNAKELFRLVEDFVDVIGFRMKD-- 370 380 390 400 410 420 890 900 910 920 930 940 mKIAA4 LRPFVIVTANMILAVDIFDKLNFTGAQVPRFEDIQEELPRELESSVSFPADTFKPPEKKE :: :: :..:.. :: .:: ...::: . mKIAA4 LRDAYQVTDNLVLSIH---KLPASGA-----------------TDISFPMKGW------- 430 440 450 950 960 970 980 990 1000 mKIAA4 GPVVRLTNRRTTPLTAQPEPRAERETSS-SRRRRHPDEPGQFAVALVVIYRTLGQLLPEH : : . :: :. : : . :. . :.:. .:.::.::..: . mKIAA4 --------RATGDWAKVPEDRVTVSKSVFSTGLAEADDSSVFVVG-TVLYRNLGSFLALQ 460 470 480 490 500 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA4 YDPDHRSLRLPNRPVINTPVVSAMVYSEGTPLPSSLQRPILVEFSLLETEERSKPVCVFW : :.:. :.:. : : : :: :. .::. . . .. .:..: mKIAA4 R----------NTTVLNSKVISVTV----KPPPRSLLTPLEIEFAHMYNGTTNQ-TCILW 510 520 530 540 550 1070 1080 1090 1100 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: . . : ..: :. .. . . . .:. . .: .:. : mKIAA4 TATLRPKPKEEPKYSINIDQMPQTRL---IHLSMAPDASFPTRSPPAREPPGGA---PPE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1570 1580 1590 1600 1610 1620 mKIAA4 VLSSQPQEQRKGILKNKVTYPPPLPEQPLKSRLREKLADCEQSPTSSRTSSLGSGDGVHA : :: ::: :.::. mKIAA4 VPPVQPPPPPPP--------PPPPPQQPIPPPPTLEPAPPSLGDTGEPAAHPGPSSGAGA 1080 1090 1100 1110 1120 >>mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140 aa) initn: 306 init1: 93 opt: 316 Z-score: 236.3 bits: 56.2 E(): 5.1e-08 Smith-Waterman score: 369; 24.550% identity (32.318% ungapped) in 778 aa overlap (1-743:138-763) 10 20 mKIAA4 PGF--TGDYCETEIDLCYSNPCGANGRCRS ::. .::.: : :: .. : .::: : mKIAA1 WFKCTRHRISYKTAYRRGLRTMYRRRSQCCPGYYENGDFC---IPLC-TEEC-MHGRCVS 110 120 130 140 150 160 30 40 50 60 70 mKIAA4 RE--------GGYTCE--CFEDFTGEHCQVNVRSGRCASGVCKNGGTCVNLLIGGFHCVC . :: : : . : :: :.:: :.::. : : . :. ::: mKIAA1 PDTCHCEPGWGGPDCSSGCDSEHWGPHC-----SNRCQ---CQNGALC-NPITGA--CVC 170 180 190 200 210 80 90 100 110 120 130 mKIAA4 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.. : : : : : : : : mKIAA1 PNCSVSCSCE-NGG---SCSPEDGSCECAPGFRGPLCQRICPPGFYGHGCAQPC-PLCVH 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 SRA-CDMDTGQCACKPGVIGRQCNR-C-DNPFAEVTSLGCEVIYNGCPRAFEAGIWWPQT ::. : .: : : :: : ::. : . :.. . : :: .... mKIAA1 SRGPCHHISGICECLPGFSGALCNQVCAGGHFGQDCAQLCSCANNGTCSPIDGSCQCFPG 680 690 700 710 720 730 720 730 740 750 760 770 mKIAA4 KFGQPAAVPCPKGSVGNAVRH-CSGEKGWLPPELFNCTSGSFVDLKALNEKLNRNETRMD .:. . ::.: :.: : :: ..: mKIAA1 WIGKDCSQACPSGFWGSACFHTCSCHNGASCSAEDGACHCTPGWTGLFCTQRCPSAFFGK 740 750 760 770 780 790 >>mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 (835 aa) initn: 142 init1: 97 opt: 306 Z-score: 230.6 bits: 54.7 E(): 1.1e-07 Smith-Waterman score: 378; 24.966% identity (32.124% ungapped) in 745 aa overlap (2-697:159-786) 10 20 30 mKIAA4 PGFTGDYCETEIDLCYSNPCGANGRCRSREG :. : :: : .: : . .:: ..: mKIAA0 HWGPDCIHPCNCSAGHGNCDAVSGLCLCEAGYEGPQCEQWCRQGYFGP-GCEQKCRCEHG 130 140 150 160 170 180 40 50 60 70 80 mKIAA4 GY------TCECFEDFTGEHCQVNVRSG----RCASGV-CKNGGTCVNLLIGGFHCVCPP . .: : . : :. .: :.:. :. :. : . . :. :.:: mKIAA0 ATCDHVSGACTCPAGWRGSFCEHACPAGFFGLDCGSACNCSAGAPC-DAVTGS--CICPA 190 200 210 220 230 240 90 100 110 120 130 140 mKIAA4 GEYEHPYCEVSTRSFPPQSFVTFRGLRQRFHFTVSLAFATQDRNALLLYNGRFNEKHDFI :.. :.: ... :: .: :: . : . . .: : mKIAA0 GRW-GPHC---AQTCPPLTF----GLNCS---QICTCFNGASCDPVL---G--------- 250 260 270 280 150 160 170 180 190 mKIAA4 ALEIVEEQLQLTFSAGETTTTVTPQVPGGVSDGR--WHSVLVQYYNK--PNIGHLGLPHG : . : : :.:. :. :: : . .. : .:. :.: mKIAA0 ---------QCHCAPGWMGPTCLQACPAGLY-GKNCQHSCLCRNGGSCDPILGQCTCPEG 290 300 310 320 330 200 210 220 230 240 250 mKIAA4 PSGEKVAVVTVDDCDAAVAVHFGSYVG-NYSCAAQGT---QSGSKKS-LDLTGPLLLGGV .: .. ..: . : :. : :: :: .: . :: . mKIAA0 WTG----LACENEC---LPGHHGAGCRLNCSCLNGGTCDRLTGHCRCPAGWTGDKCQS-- 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 mKIAA4 PNLPEDFPVHSRQFVGCMRNLSIDGRIVDMAAFIANNGTRAG-C--ASQRNF----C-DG : . : :: .. .: .. . .: . : :.. : : :.. : . mKIAA0 PCVSGMFGVHCEEHCACRKGATCHHVT---GACLCPPGWRGSHCEQACPRGWFGEACAQR 390 400 410 420 430 310 320 330 340 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